| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 77 [0] | [0] 78 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 76 (0.930) | 51/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:6415266/49‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:3319084/1‑49 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:1662327/50‑1 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:3082793/50‑1 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 1:4488090/1‑50 CACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGT > 1:4221954/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:2300951/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 1:5424928/50‑1 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:3495849/50‑1 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:4256155/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC < 1:226318/50‑1 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:1226716/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:5038860/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:79970/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:6118488/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:3628419/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:1536415/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTT < 1:6402552/50‑1 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:1652969/1‑49 TTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA < 1:2622244/50‑1 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC < 1:4710953/49‑1 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC > 1:1828318/1‑49 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:670473/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:2760733/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:4105278/1‑50 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC < 1:1123016/50‑1 GCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC > 1:1804721/1‑49 GCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC > 1:60994/1‑49 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACA < 1:6123575/49‑1 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:2405295/1‑50 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:4324098/1‑50 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:2655847/1‑50 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:297415/1‑50 AACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT > 1:3365519/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG > 1:2918983/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:922566/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:77651/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:3003637/49‑1 GTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC > 1:3491471/1‑49 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:5583055/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:816082/48‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:5275117/48‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:1655812/48‑1 CAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC > 1:5785608/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:5052669/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:6380903/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:5887927/49‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:2035273/1‑48 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:4301494/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:1809050/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:15857/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:3143052/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:3254899/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT > 1:4228095/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:4824710/1‑50 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:2581554/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:1487563/1‑50 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT < 1:3489968/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT > 1:1520832/1‑49 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 1:3961140/1‑50 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:1271006/1‑50 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:5128897/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:1609245/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:4585200/50‑1 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:5431154/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:3446478/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:1603813/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2341486/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2645445/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:3443879/1‑49 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:1372771/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1795776/1‑48 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1827928/1‑47 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:73623/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:1775008/1‑50 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGA < 1:4620548/49‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGA < 1:146081/49‑1 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |