| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 77 [0] | [0] 78 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 76 (0.930) | 51/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388840‑1388936 | aCGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:6415266‑M1/49‑1 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:3319084‑M1/1‑48 (MQ=255) gTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTaca < 1:1662327‑M1/50‑4 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag < 1:3082793‑M1/50‑5 (MQ=255) cacaCCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagg > 1:4488090‑M1/1‑45 (MQ=255) cacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggt > 1:4221954‑M1/1‑43 (MQ=255) acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtc > 1:2300951‑M1/1‑42 (MQ=255) acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtc < 1:5424928‑M1/50‑9 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct < 1:3495849‑M1/50‑10 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct < 1:4256155‑M1/50‑10 (MQ=255) cTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctc < 1:226318‑M1/50‑11 (MQ=255) tAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcc > 1:1226716‑M1/1‑39 (MQ=255) tAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcc > 1:5038860‑M1/1‑39 (MQ=255) tAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcc > 1:79970‑M1/1‑39 (MQ=255) tAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcc > 1:6118488‑M1/1‑39 (MQ=255) aGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcct > 1:3628419‑M1/1‑38 (MQ=255) aGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcct > 1:1536415‑M1/1‑38 (MQ=255) gTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcctt < 1:6402552‑M1/50‑14 (MQ=255) gTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcct > 1:1652969‑M1/1‑37 (MQ=255) tttATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcctta < 1:2622244‑M1/50‑15 (MQ=255) tATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttac < 1:4710953‑M1/49‑16 (MQ=255) tATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttac > 1:1828318‑M1/1‑34 (MQ=255) aTGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaa > 1:670473‑M1/1‑33 (MQ=255) 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> 1:2035273‑M1/1‑19 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:4301494‑M1/1‑18 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:1809050‑M1/1‑18 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:15857‑M1/1‑18 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:3143052‑M1/1‑18 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:3254899‑M1/1‑18 (MQ=255) acacAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagt > 1:4228095‑M1/1‑17 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt > 1:4824710‑M1/1‑15 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg < 1:2581554‑M1/50‑37 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg > 1:1487563‑M1/1‑14 (MQ=255) aGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgt < 1:3489968‑M1/50‑38 (MQ=255) gCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgt > 1:1520832‑M1/1‑12 (MQ=255) cAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaa > 1:3961140‑M1/1‑11 (MQ=255) aaaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaat > 1:1271006‑M1/1‑10 (MQ=255) aaaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaat < 1:5128897‑M1/50‑41 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt < 1:1609245‑M1/50‑42 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt < 1:4585200‑M1/50‑42 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:5431154‑M1/1‑8 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:3446478‑M1/1‑8 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaa < 1:1603813‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:2341486‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:2645445‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:3443879‑M1/1‑6 (MQ=255) cTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaa < 1:1372771‑M1/50‑46 (MQ=255) cTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:1795776‑M1/1‑5 (MQ=255) tATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:1827928‑M1/1‑4 (MQ=255) aTTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:73623‑M1/1‑3 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat > 1:1775008‑M1/1‑2 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaaga < 1:4620548‑M1/49‑48 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaaga < 1:146081‑M1/49‑48 (MQ=255) | ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388840‑1388936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |