| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 687,860 | Δ1,185 bp | IS5‑mediated | insH‑3 | insH‑3 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 687860 | 689044 | 1185 | 88 [0] | [0] 87 | insH‑3 | insH‑3 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 687859 | 0 (0.000) | 83 (1.170) | 56/96 | 0.0 | 100% | noncoding (1187/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 689045 = | 0 (0.000) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTC > NC_000913/687810‑687908 | ttATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC > 1:3367317‑M1/1‑50 (MQ=255)ttATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC > 1:4529213‑M1/1‑50 (MQ=255) tATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCc > 1:5297167‑M1/1‑49 (MQ=255) aTCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCct > 1:1458459‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCct > 1:60265‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCc < 1:2815356‑M1/49‑2 (MQ=255) aTCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCc < 1:5176741‑M1/49‑2 (MQ=255) tCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCctt < 1:5182651‑M1/50‑4 (MQ=255) cGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCct > 1:951846‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCct > 1:2097737‑M1/1‑46 (MQ=255) gTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttag < 1:4044393‑M1/50‑6 (MQ=255) gTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCctta < 1:825697‑M1/49‑5 (MQ=255) tCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttagg < 1:3065631‑M1/50‑7 (MQ=255) tCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttagg > 1:4795502‑M1/1‑44 (MQ=255) tCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttagg < 1:5472292‑M1/50‑7 (MQ=255) cTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttagg > 1:5289507‑M1/1‑43 (MQ=255) cTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttagg > 1:4262141‑M1/1‑43 (MQ=255) cTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttagg > 1:3385154‑M1/1‑43 (MQ=255) tGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggt > 1:2375953‑M1/1‑42 (MQ=255) cAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaac < 1:1754251‑M1/50‑11 (MQ=255) cAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaa > 1:2139483‑M1/1‑40 (MQ=255) cAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaa < 1:5570329‑M1/49‑10 (MQ=255) cAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaa < 1:1548251‑M1/49‑10 (MQ=255) cAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggt < 1:4328732‑M1/47‑8 (MQ=255) aCTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacat > 1:572490‑M1/1‑38 (MQ=255) aCTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacat < 1:3921861‑M1/50‑13 (MQ=255) aCTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacat > 1:811215‑M1/1‑38 (MQ=255) aCTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacat > 1:915848‑M1/1‑38 (MQ=255) cTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatt > 1:107383‑M1/1‑37 (MQ=255) tttATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatt > 1:1185841‑M1/1‑36 (MQ=255) tttATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatt > 1:4156067‑M1/1‑36 (MQ=255) ttATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatt > 1:1724320‑M1/1‑35 (MQ=255) tATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttag > 1:3281249‑M1/1‑34 (MQ=255) tATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacattta < 1:1661719‑M1/49‑16 (MQ=255) aTTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttag < 1:2255917‑M1/49‑17 (MQ=255) tgtgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagttt > 1:2201092‑M1/1‑31 (MQ=255) tgtgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagttt > 1:4592708‑M1/1‑31 (MQ=255) gtgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGTTGCcttaggtaacatttagtttg > 1:5029966‑M1/1‑30 (MQ=255) gtgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagttt < 1:461332‑M1/49‑20 (MQ=255) tgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttgg > 1:3891103‑M1/1‑29 (MQ=255) tgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttgg < 1:3590273‑M1/50‑22 (MQ=255) tgCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttg < 1:1540383‑M1/49‑21 (MQ=255) cAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggc < 1:3694169‑M1/49‑23 (MQ=255) aGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggct > 1:2844187‑M1/1‑26 (MQ=255) gttgtGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaat > 1:4320155‑M1/1‑23 (MQ=255) ttgtGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatg > 1:1455904‑M1/1‑22 (MQ=255) ttgtGCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatg < 1:2306137‑M1/50‑29 (MQ=255) gtgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgt < 1:3832420‑M1/49‑30 (MQ=255) gtgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgt > 1:2619303‑M1/1‑20 (MQ=255) gtgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgt > 1:3061929‑M1/1‑20 (MQ=255) tgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaa < 1:4846982‑M1/50‑32 (MQ=255) tgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta < 1:3575251‑M1/49‑31 (MQ=255) tgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta > 1:58400‑M1/1‑19 (MQ=255) tgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta > 1:4772117‑M1/1‑19 (MQ=255) tgCCTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta < 1:52400‑M1/49‑31 (MQ=255) ccTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaag < 1:3461473‑M1/50‑34 (MQ=255) ccTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta > 1:3938797‑M1/1‑17 (MQ=255) cTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaaga < 1:2196377‑M1/50‑35 (MQ=255) cTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta > 1:5483679‑M1/1‑16 (MQ=255) cTGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgta > 1:4726908‑M1/1‑16 (MQ=255) tGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaaga > 1:2595555‑M1/1‑15 (MQ=255) tGTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaaga > 1:1298301‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagata > 1:3003521‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagata > 1:2899010‑M1/1‑14 (MQ=255) ttAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagata < 1:2167947‑M1/49‑37 (MQ=255) ttAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagata < 1:2912214‑M1/49‑37 (MQ=255) ttAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagat < 1:2987056‑M1/48‑36 (MQ=255) ttAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagat < 1:4712155‑M1/48‑36 (MQ=255) tAGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatatt > 1:4419903‑M1/1‑12 (MQ=255) aGGGAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattg > 1:604001‑M1/1‑11 (MQ=255) gggAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattga < 1:4544895‑M1/50‑41 (MQ=255) ggAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgct < 1:2738554‑M1/50‑42 (MQ=255) gAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctg < 1:1029789‑M1/50‑43 (MQ=255) gAAGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctg < 1:824494‑M1/50‑43 (MQ=255) aaGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgt < 1:1680827‑M1/50‑44 (MQ=255) aaGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgt < 1:3436834‑M1/50‑44 (MQ=255) aaGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgt > 1:352709‑M1/1‑7 (MQ=255) aaGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgt > 1:2195880‑M1/1‑7 (MQ=255) aGGTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgtt < 1:5163151‑M1/50‑45 (MQ=255) ggTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttt < 1:4741639‑M1/50‑46 (MQ=255) ggTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttt < 1:2610512‑M1/50‑46 (MQ=255) ggTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttt < 1:1771006‑M1/50‑46 (MQ=255) ggTGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttt < 1:5282330‑M1/50‑46 (MQ=255) tGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgtttta > 1:729050‑M1/1‑3 (MQ=255) tGCcttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgtttta > 1:5118486‑M1/1‑3 (MQ=255) ccttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttttatt > 1:3966267‑M1/1‑1 (MQ=255) ccttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttttatt > 1:4006106‑M1/1‑1 (MQ=255) ccttaggtaacatttagtttggctaaatgtaaagatattgctgttttatt > 1:2622225‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTC > NC_000913/687810‑687908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |