| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 687,860 | Δ1,185 bp | IS5‑mediated | insH‑3 | insH‑3 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 687860 | 689044 | 1185 | 88 [0] | [0] 87 | insH‑3 | insH‑3 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 687859 | 0 (0.000) | 83 (1.170) | 56/96 | 0.0 | 100% | noncoding (1187/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 689045 = | 0 (0.000) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTG > NC_000913/688996‑689094 | tatcgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcc > 1:5297167‑M2/50‑50 (MQ=255) atcgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcc < 1:2815356‑M2/1‑1 (MQ=255) atcgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcc < 1:5176741‑M2/1‑1 (MQ=255) atcgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCt > 1:1458459‑M2/49‑50 (MQ=255) atcgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCt > 1:60265‑M2/49‑50 (MQ=255) tcgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCtt < 1:5182651‑M2/3‑1 (MQ=255) cgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCt > 1:2097737‑M2/47‑48 (MQ=255) cgtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCt > 1:951846‑M2/47‑48 (MQ=255) gtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTa < 1:825697‑M2/4‑1 (MQ=255) gtctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAg < 1:4044393‑M2/5‑1 (MQ=255) tctgcaactttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAgg < 1:5472292‑M2/6‑1 (MQ=255) 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actttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAt < 1:3921861‑M2/12‑1 (MQ=255) actttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAt > 1:811215‑M2/39‑50 (MQ=255) actttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAt > 1:572490‑M2/39‑50 (MQ=255) ctttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAtt > 1:107383‑M2/38‑50 (MQ=255) tttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAtt > 1:4156067‑M2/37‑49 (MQ=255) tttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAtt > 1:1185841‑M2/37‑49 (MQ=255) ttattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACAtt > 1:1724320‑M2/36‑48 (MQ=255) tattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTa < 1:1661719‑M2/15‑1 (MQ=255) tattgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAg > 1:3281249‑M2/35‑50 (MQ=255) attgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAg < 1:2255917‑M2/16‑1 (MQ=255) tgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGttt > 1:4592708‑M2/32‑50 (MQ=255) tgtgcagtgttgtgcctgttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGttt > 1:2201092‑M2/32‑50 (MQ=255) 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1:1298301‑M2/16‑49 (MQ=255) gttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGata > 1:3003521‑M2/15‑50 (MQ=255) gttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGata > 1:2899010‑M2/15‑50 (MQ=255) ttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGata < 1:2912214‑M2/36‑1 (MQ=255) ttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGata < 1:2167947‑M2/36‑1 (MQ=255) ttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGat < 1:4712155‑M2/35‑1 (MQ=255) ttagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGat < 1:2987056‑M2/35‑1 (MQ=255) tagggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATAtt > 1:4419903‑M2/13‑50 (MQ=255) agggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTg > 1:604001‑M2/12‑50 (MQ=255) gggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATtga < 1:4544895‑M2/40‑2 (MQ=255) ggaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCt < 1:2738554‑M2/41‑1 (MQ=255) gaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTg < 1:1029789‑M2/42‑1 (MQ=255) gaaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTg < 1:824494‑M2/42‑1 (MQ=255) aaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGt > 1:2195880‑M2/8‑50 (MQ=255) aaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGt < 1:1680827‑M2/43‑1 (MQ=255) aaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGt > 1:352709‑M2/8‑50 (MQ=255) aaggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGt < 1:3436834‑M2/43‑1 (MQ=255) aggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGtt < 1:5163151‑M2/44‑1 (MQ=255) ggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGttt < 1:5282330‑M2/45‑1 (MQ=255) ggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGttt < 1:1771006‑M2/45‑1 (MQ=255) ggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGttt < 1:4741639‑M2/45‑1 (MQ=255) ggtgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGttt < 1:2610512‑M2/45‑1 (MQ=255) tgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTa > 1:5118486‑M2/4‑50 (MQ=255) tgcCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTa > 1:729050‑M2/4‑50 (MQ=255) cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAtt > 1:4006106‑M2/2‑50 (MQ=255) cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAtt > 1:3966267‑M2/2‑50 (MQ=255) cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAtt > 1:2622225‑M2/2‑50 (MQ=255) cttAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAttg > 1:2575406/1‑50 (MQ=255) | GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTG > NC_000913/688996‑689094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |