| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,165,151 | Δ12,060 bp | yegP–gatY | 17 genes yegP, yegQ, cyaR, ogrK, yegZ, yegR, yegS, gatR, insE‑5, insF‑5, gatR, gatD, gatC, gatB, gatA, gatZ, gatY |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2165151 | 2177210 | 12060 | 86 [0] | [0] 89 | yegP–gatY | yegP,yegQ,cyaR,ogrK,yegZ,yegR,yegS,gatR,insE‑5,insF‑5,gatR,gatD,gatC,gatB,gatA,gatZ,gatY |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2165150 | 0 (0.000) | 86 (1.180) | 56/98 | 0.0 | 100% | intergenic (+152/‑39) | baeR/yegP | DNA‑binding transcriptional activator BaeR/DUF1508 domain‑containing protein YegP |
| ? | NC_000913 | 2177211 = | 0 (0.000) | intergenic (‑7/+301) | gatY/fbaB | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 subunit GatY/fructose‑bisphosphate aldolase class I | |||||
GCTGTGCGTTGTTCAGCATCTGCTTTGTCGATACCACGTACATTTTCATATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGTTTTT > NC_000913/2177162‑2177260 | aggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaa < 1:4883925‑M2/1‑1 (MQ=255)aggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaa > 1:3748660‑M2/50‑50 (MQ=255)aggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaa > 1:2820858‑M2/50‑50 (MQ=255) ggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaAt < 1:5190481‑M2/2‑1 (MQ=255) catcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATcc > 1:4447370‑M2/47‑50 (MQ=255) catcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATcc < 1:2580752‑M2/4‑1 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt < 1:5060118‑M2/5‑1 (MQ=255) tcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTg < 1:2609055‑M2/6‑1 (MQ=255) cagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGt > 1:4691674‑M2/44‑50 (MQ=255) agaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGt < 1:3803965‑M2/7‑1 (MQ=255) agaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTc < 1:3964477‑M2/8‑1 (MQ=255) agaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTc < 1:2054873‑M2/8‑1 (MQ=255) gaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCg > 1:1186797‑M2/42‑50 (MQ=255) aaaatcgctcatcctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgt < 1:4622374‑M2/10‑1 (MQ=255) aaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgt > 1:1207384‑M2/41‑50 (MQ=255) atcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttg < 1:2245662‑M2/13‑1 (MQ=255) tcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgt > 1:5422812‑M2/37‑50 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt > 1:2193202‑M2/35‑50 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt < 1:3256433‑M2/16‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:5249899‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:4659988‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:2896779‑M2/17‑1 (MQ=255) tcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc > 1:158800‑M2/33‑50 (MQ=255) 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< 1:1613428‑M2/34‑1 (MQ=255) aacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAAt < 1:3757336‑M2/34‑1 (MQ=255) aacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATg < 1:1130200‑M2/35‑1 (MQ=255) acagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATg > 1:4787194‑M2/15‑49 (MQ=255) cagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGaa < 1:616932‑M2/37‑1 (MQ=255) cagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGaa < 1:4562083‑M2/37‑1 (MQ=255) gcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAat < 1:137073‑M2/39‑1 (MQ=255) gcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAat > 1:2485599‑M2/12‑50 (MQ=255) cacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAatt < 1:4218434‑M2/40‑1 (MQ=255) cacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAat > 1:5099107‑M2/11‑49 (MQ=255) acctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAatta > 1:2597856‑M2/10‑50 (MQ=255) cctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAattat > 1:3803178‑M2/9‑50 (MQ=255) cctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAattat < 1:5316710‑M2/42‑1 (MQ=255) 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< 1:4916285‑M2/48‑1 (MQ=255) aATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGtttt > 1:791291‑M2/2‑50 (MQ=255) atCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGttttt < 1:3102827/50‑1 (MQ=255) atCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGttttt < 1:51254/50‑1 (MQ=255) atCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGtttt > 1:339745/1‑49 (MQ=255) | GCTGTGCGTTGTTCAGCATCTGCTTTGTCGATACCACGTACATTTTCATATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGTTTTT > NC_000913/2177162‑2177260 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |