| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,994,992 | Δ3,877 bp | [ygeL]–ygeQ | [ygeL], ygeN, ygeO, insD‑4, insC‑4, ygeP, ygeQ | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2994992 | 2998868 | 3877 | 113 [0] | [0] 113 | [ygeL]–ygeQ | [ygeL],ygeN,ygeO,insD‑4,insC‑4,ygeP,ygeQ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2994991 | 0 (0.000) | 108 (1.550) | 63/94 | 0.0 | 100% | pseudogene (102/156 nt) | ygeL | protein YgeL |
| ? | NC_000913 | 2998869 = | 0 (0.000) | intergenic (‑41/+115) | ygeQ/glyU | protein YgeQ/tRNA‑Gly | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAA > NC_000913/2998820‑2998918 | tgtagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagccca > 1:3529379‑M2/50‑50 (MQ=255)tgtagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagccca > 1:4943680‑M2/50‑50 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagccca < 1:4989534‑M2/1‑1 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccAc < 1:5264946‑M2/2‑1 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACt > 1:1158499‑M2/48‑50 (MQ=255) agatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACt > 1:2232384‑M2/47‑49 (MQ=255) gatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTa > 1:4643527‑M2/46‑50 (MQ=255) gatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTa < 1:4168599‑M2/5‑1 (MQ=255) gatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTa > 1:178097‑M2/46‑50 (MQ=255) gatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTa < 1:5209270‑M2/5‑1 (MQ=255) atttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAt < 1:5231445‑M2/6‑1 (MQ=255) atttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAt > 1:2448218‑M2/45‑50 (MQ=255) atttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAt < 1:3153505‑M2/6‑1 (MQ=255) tttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAtt < 1:2654044‑M2/7‑1 (MQ=255) tttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAtt < 1:2047482‑M2/7‑1 (MQ=255) tttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAtt > 1:461476‑M2/44‑50 (MQ=255) ttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAtt > 1:3165513‑M2/43‑49 (MQ=255) tgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAttt > 1:1859866‑M2/42‑49 (MQ=255) tgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAttt > 1:119597‑M2/42‑49 (MQ=255) tgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAttt < 1:610603‑M2/8‑1 (MQ=255) tgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAttt < 1:4977127‑M2/8‑1 (MQ=255) tgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAttt < 1:1330891‑M2/8‑1 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa > 1:3178037‑M2/41‑50 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTa < 1:613870‑M2/9‑1 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTa < 1:4699282‑M2/9‑1 (MQ=255) ttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaac < 1:2809909‑M2/11‑1 (MQ=255) ttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa < 1:1757875‑M2/10‑1 (MQ=255) ttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa < 1:2503441‑M2/10‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaac < 1:529917‑M2/14‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaac > 1:1130678‑M2/37‑50 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaac < 1:3823261‑M2/14‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaac < 1:662138‑M2/14‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaa < 1:4117598‑M2/13‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaa < 1:865902‑M2/13‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaa < 1:2658715‑M2/13‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaa < 1:1948268‑M2/13‑1 (MQ=255) actccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACt < 1:4359213‑M2/15‑1 (MQ=255) actccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACt < 1:2655186‑M2/15‑1 (MQ=255) actccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACt > 1:3131889‑M2/36‑50 (MQ=255) ctccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACtt < 1:1224879‑M2/16‑1 (MQ=255) ctccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACtt < 1:491991‑M2/16‑1 (MQ=255) tccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACtt > 1:5412561‑M2/34‑49 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTg < 1:859806‑M2/17‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTg < 1:3114036‑M2/17‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTg < 1:5045522‑M2/17‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGa < 1:4267644‑M2/18‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGa < 1:1257626‑M2/18‑1 (MQ=255) gctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaa < 1:1190549‑M2/20‑1 (MQ=255) gctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaa < 1:3717493‑M2/20‑1 (MQ=255) ctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:2695628‑M2/30‑50 (MQ=255) ctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:2964739‑M2/30‑50 (MQ=255) tatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:3592052‑M2/29‑49 (MQ=255) tatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:4751304‑M2/29‑49 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAAt > 1:420422‑M2/27‑48 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAAt < 1:2585998‑M2/22‑1 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATaa < 1:2908769‑M2/24‑1 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATaa < 1:4509179‑M2/24‑1 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATa < 1:3215369‑M2/23‑1 (MQ=255) agctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAg > 1:4475477‑M2/26‑50 (MQ=255) tttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtg > 1:4600434‑M2/23‑50 (MQ=255) tcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtgt < 1:2399286‑M2/29‑1 (MQ=255) tcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGtt > 1:1454367‑M2/21‑50 (MQ=255) cttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGttt > 1:410155‑M2/20‑50 (MQ=255) cagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTa < 1:1464743‑M2/33‑1 (MQ=255) cagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTa < 1:1769206‑M2/33‑1 (MQ=255) cagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTa < 1:3187624‑M2/33‑1 (MQ=255) cagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTa < 1:2975398‑M2/33‑1 (MQ=255) agatctttataggccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAc < 1:4382454‑M2/34‑1 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAcc > 1:791245‑M2/16‑50 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAcc > 1:3590899‑M2/16‑50 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAc < 1:380439‑M2/34‑1 (MQ=255) gatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCt < 1:4347175‑M2/36‑1 (MQ=255) gatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCt > 1:4746307‑M2/15‑50 (MQ=255) gatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCt < 1:1642850‑M2/36‑1 (MQ=255) gatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCt < 1:1896908‑M2/36‑1 (MQ=255) atctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTg > 1:626536‑M2/14‑50 (MQ=255) tttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgt > 1:3217461‑M2/11‑50 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTgg < 1:1162851‑M2/38‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttg > 1:4070639‑M2/9‑50 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttg > 1:2619419‑M2/9‑50 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttg > 1:2533041‑M2/9‑50 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgtt < 1:1584818‑M2/41‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgtt < 1:191039‑M2/41‑1 (MQ=255) atagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgt > 1:1387733‑M2/8‑50 (MQ=255) tagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgtt < 1:4185268‑M2/44‑1 (MQ=255) tagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgt > 1:3771032‑M2/7‑49 (MQ=255) tagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgt > 1:1441955‑M2/7‑49 (MQ=255) tagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgt > 1:3178094‑M2/7‑49 (MQ=255) agcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTa > 1:5384608‑M2/6‑50 (MQ=255) gcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTa > 1:4362890‑M2/5‑49 (MQ=255) gcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTa < 1:524700‑M2/45‑1 (MQ=255) gcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTa < 1:3983357‑M2/45‑1 (MQ=255) gcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTAc < 1:4494270‑M2/46‑1 (MQ=255) cccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACa < 1:314277‑M2/47‑1 (MQ=255) cccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACa < 1:3218554‑M2/47‑1 (MQ=255) ccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACaa < 1:4615103‑M2/48‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |