| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 59 [0] | [0] 57 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 57 (1.000) | 42/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
CGTCCTGGTTAGGATCGATAACAACGAGCATGTTCTGATACATAGCCATACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG > NC_000913/1398574‑1398668 | acgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:2869646‑M2/50‑50 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:3193859‑M2/48‑48 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACa < 1:2859750‑M2/3‑1 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:2789248‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:182584‑M2/45‑50 (MQ=255) cacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGt > 1:2242356‑M2/44‑50 (MQ=255) acctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtc > 1:4275434‑M2/43‑50 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct < 1:3918666‑M2/9‑1 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct < 1:2512489‑M2/9‑1 (MQ=255) ctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtctc > 1:1098326‑M2/41‑50 (MQ=255) ctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtctc > 1:2180177‑M2/41‑50 (MQ=255) tttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTa < 1:3289131‑M2/14‑1 (MQ=255) tttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTa > 1:2662415‑M2/37‑50 (MQ=255) ttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTa > 1:3844617‑M2/36‑49 (MQ=255) tatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTac > 1:3578343‑M2/35‑49 (MQ=255) tatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTac > 1:4449248‑M2/35‑49 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:855084‑M2/34‑50 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTaca < 1:2714951‑M2/16‑1 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTaca < 1:2340893‑M2/16‑1 (MQ=255) tgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa < 1:3305845‑M2/17‑1 (MQ=255) ctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTAcaacaa > 1:3951119‑M2/31‑50 (MQ=255) ctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTAcaacaa < 1:2057778‑M2/20‑1 (MQ=255) ctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTAcaacaa > 1:4363798‑M2/31‑50 (MQ=255) taactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac > 1:4806‑M2/30‑50 (MQ=255) taactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac > 1:226748‑M2/30‑50 (MQ=255) taactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac > 1:2203100‑M2/30‑50 (MQ=255) aactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACt > 1:3313521‑M2/29‑50 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac < 1:1265455‑M2/21‑1 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACt < 1:1278531‑M2/22‑1 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg < 1:4132069‑M2/23‑1 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg > 1:908932‑M2/28‑50 (MQ=255) ctgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt < 1:2811197‑M2/24‑1 (MQ=255) gtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTc > 1:2852291‑M2/25‑49 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCaa < 1:3172346‑M2/27‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc < 1:1938519‑M2/28‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc < 1:353553‑M2/28‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc < 1:4443641‑M2/28‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:2370557‑M2/22‑50 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGc < 1:3506727‑M2/30‑1 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGc < 1:208738‑M2/30‑1 (MQ=255) taacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:966802‑M2/20‑48 (MQ=255) taacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCa < 1:3243863‑M2/31‑1 (MQ=255) acacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAg < 1:3879058‑M2/32‑1 (MQ=255) acacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAg < 1:87847‑M2/32‑1 (MQ=255) cacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGtt > 1:528037‑M2/17‑50 (MQ=255) cacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGtt > 1:1207144‑M2/17‑50 (MQ=255) cagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg > 1:752977‑M2/15‑50 (MQ=255) cagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg < 1:1222516‑M2/36‑1 (MQ=255) caaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTaa < 1:4008532‑M2/39‑1 (MQ=255) caaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTaa > 1:1527488‑M2/12‑50 (MQ=255) aaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAt < 1:1889487‑M2/40‑1 (MQ=255) aaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAt < 1:680381‑M2/40‑1 (MQ=255) aaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAt > 1:1280058‑M2/11‑50 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaa < 1:199315‑M2/44‑1 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaa < 1:140648‑M2/44‑1 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaa > 1:2997577‑M2/7‑49 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAg < 1:1887167‑M2/46‑1 (MQ=255) | CGTCCTGGTTAGGATCGATAACAACGAGCATGTTCTGATACATAGCCATACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG > NC_000913/1398574‑1398668 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |