| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 123 [0] | [0] 123 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 117 (1.050) | 61/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:1637548/49‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:7638185/49‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:1874715/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:7561727/1‑48 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:6946750/1‑48 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:4491419/50‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:7900895/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG < 1:463131/50‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:4513928/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 1:7381454/49‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 1:5275946/50‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:8455596/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:3552768/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:1141655/50‑1 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:5321991/50‑1 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:5724050/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC < 1:2837614/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 1:1682674/1‑50 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC < 1:8138908/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 1:3247831/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTT < 1:6691727/50‑1 TTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA > 1:6548546/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:6967306/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACA < 1:4806614/49‑1 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACA < 1:5426012/49‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC < 1:1317346/50‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC < 1:4413863/50‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:363563/1‑49 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:1387663/1‑50 AACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT > 1:917259/1‑50 AACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT > 1:6744164/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG < 1:7847717/50‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:6561425/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:4362907/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:5695275/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:3058192/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:3154654/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:3307136/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC < 1:1412144/48‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC < 1:2163461/48‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT < 1:979039/50‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT < 1:2676314/50‑1 TGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 1:3900092/1‑49 GTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC > 1:6099825/1‑49 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA > 1:8362498/1‑50 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA > 1:1672760/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:6108646/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:7238768/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:3775428/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAGCAACTGTCAACG > 1:7745995/1‑49 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:368456/50‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:3583024/50‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:736383/50‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:6575887/1‑49 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:6278327/1‑49 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:3061295/1‑49 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:2752643/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:5209510/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:3907016/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:5917146/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:1402660/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:43843/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACCGTCAACGCAGT > 1:5673763/1‑50 CACAGCAAACGCTATTGCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 1:7752953/50‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 1:6777902/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:3451554/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:3633838/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:35140/1‑50 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT > 1:2849418/1‑49 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 1:4360227/1‑50 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA < 1:8158672/50‑1 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 1:693768/1‑50 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA < 1:2424247/50‑1 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA < 1:4322297/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:4383768/1‑50 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:6657055/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:4981329/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:4877859/1‑50 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:6678284/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA < 1:7250943/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA < 1:7057273/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA < 1:6605782/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA < 1:3885043/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA > 1:6471871/1‑49 CGCTATTACAGGGTCTCATTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA > 1:5362770/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:6982/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2361114/1‑49 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:4486999/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:8598258/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:6695300/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2338232/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:6426089/1‑47 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:5776192/1‑46 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:6417038/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:7366143/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGA < 1:6299533/49‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:163967/48‑1 TACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:6145471/1‑49 TACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:3900913/1‑49 TACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:87931/1‑49 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |