| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 366364 | 56 (0.510) | 146 (1.390) | 67/94 | 0.0 | 59.3% | intergenic (‑59/+64) | lacZ/lacI | beta‑galactosidase/DNA‑binding transcriptional repressor LacI |
| ? | NC_000913 | 1323131 = | 147 (1.400) | intergenic (‑49/‑89) | trpL/yciV | trp operon leader peptide/RNA/ssDNA 5'‑>3' exonuclease | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/366315‑366364‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATG > NC_000913/1323131‑1323179 CTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGA > 1:1073061/1‑50 TGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAT > 1:1637149/1‑50 GTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAT > 2:5327165/1‑49 GTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAT > 2:2714048/1‑49 TGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGA < 2:1319646/50‑1 TGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGA > 2:3803426/1‑50 TGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAT < 2:134178/48‑1 TGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGAT < 2:4453613/49‑1 GAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATT > 1:3795486/1‑49 GAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATT > 1:1867069/1‑49 GAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATT > 2:3307016/1‑49 GAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATT > 1:3829324/1‑49 GAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATT > 1:823838/1‑49 AAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTA < 1:374133/49‑1 AATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAAT < 2:4803457/50‑1 AATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAAT > 2:2932462/1‑50 AATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAAT > 2:1199576/1‑50 ATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATT < 1:1458626/50‑1 ATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATT > 1:3494314/1‑50 ATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATT < 2:1423648/50‑1 ATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATT < 1:2559347/50‑1 TTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTG < 2:1651771/50‑1 GTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGT < 2:31676/49‑1 GTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGT > 2:592837/1‑49 TTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCA < 2:4070536/50‑1 TTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTC < 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1:1726308/50‑1 AATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTT > 1:1281615/1‑49 ATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCA < 2:1659014/50‑1 ATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTT > 1:3204782/1‑48 ATTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTT > 2:3064687/1‑48 TTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTT > 1:1691622/1‑47 TTCCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTT > 1:4731357/1‑47 CCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGA < 1:3157526/49‑1 CCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGA < 2:2538692/49‑1 CCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGA < 2:3201686/49‑1 CCACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGA < 2:4202069/49‑1 CACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAAT < 1:2918512/50‑1 CACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAA > 1:1095736/1‑49 CACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAA > 1:105612/1‑49 CACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAA > 2:1335664/1‑49 ACACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATA > 1:810284/1‑50 ttATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGC < 2:2336558/48‑1 ttATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGC > 2:769859/3‑50 tATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGC > 2:646810/2‑49 ATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCC < 1:4091871/49‑1 ATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCC < 1:3921210/49‑1 ATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGC > 1:1870591/1‑48 TACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCA < 2:5174623/49‑1 TACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCA < 2:3670695/49‑1 TACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCA < 2:2267330/49‑1 TACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGC > 1:2179664/1‑47 CGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAA > 1:2199716/1‑50 CGAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGA < 2:323227/49‑1 GAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAC > 2:1218642/1‑50 GAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAC < 2:2254831/50‑1 GAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAC > 1:4667411/1‑50 GAGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAC > 2:2892672/1‑50 AGCCGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACC < 2:5091683/50‑1 CGGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGT > 2:4739671/1‑49 GGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTA > 1:1824866/1‑50 GGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTA < 1:4757769/50‑1 GGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTA > 1:2995831/1‑50 GGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTA > 2:3958499/1‑50 GATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAT > 1:1309549/1‑50 GATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAT > 2:723483/1‑50 ATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATG < 1:1520669/50‑1 ATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATG < 2:4165837/50‑1 ATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAT > 1:1236973/1‑49 ATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAT > 2:2443975/1‑49 ATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAT > 1:4996882/1‑49 ATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAT > 1:3357289/1‑49 CTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/366315‑366364‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATG > NC_000913/1323131‑1323179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |