| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 366364 | 56 (0.510) | 146 (1.390) | 67/94 | 0.0 | 59.3% | intergenic (‑59/+64) | lacZ/lacI | beta‑galactosidase/DNA‑binding transcriptional repressor LacI |
| ? | NC_000913 | 1323131 = | 147 (1.400) | intergenic (‑49/‑89) | trpL/yciV | trp operon leader peptide/RNA/ssDNA 5'‑>3' exonuclease | |||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
TTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGA > NC_000913/1323082‑1323180 | ttGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgat < 2:2931806/50‑1 (MQ=255)ttGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgat > 2:175072/1‑50 (MQ=255)tgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggat > 1:4985667‑M2/50‑50 (MQ=255) gtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggat > 2:5327165‑M2/49‑49 (MQ=255) tgtgaaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggatga < 2:1319646‑M2/3‑1 (MQ=255) tgtgaaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggat < 1:1668365‑M2/1‑1 (MQ=255) tgtgaaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggat < 2:3550813‑M2/1‑1 (MQ=255) tCGATACCCTTTTTCCGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgatga < 1:1889528/49‑1 (MQ=255) tCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgatgat < 2:4371149/50‑1 (MQ=255) tCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgatgat > 2:1335687/1‑50 (MQ=255) tCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgatgat > 2:1048200/1‑50 (MQ=255) tCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCgatga < 1:3763323/49‑1 (MQ=255) gaaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGAtt > 1:463383‑M2/45‑49 (MQ=255) aaattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTaa > 2:167381‑M2/44‑50 (MQ=255) aTACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTaa < 1:288476/50‑1 (MQ=255) aTACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTaa < 1:4086507/50‑1 (MQ=255) aattgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAAt > 2:1199576‑M2/43‑50 (MQ=255) attgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAAtt < 2:1558310‑M2/9‑1 (MQ=255) ttgttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTg > 2:683298‑M2/41‑50 (MQ=255) cccTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAAtt < 1:820441/49‑1 (MQ=255) ccTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGt < 1:2497359/50‑1 (MQ=255) gttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGt > 2:592837‑M2/39‑49 (MQ=255) ttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTc > 2:898521‑M2/38‑49 (MQ=255) ttatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTc > 1:2607463‑M2/38‑49 (MQ=255) tatccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCaa > 1:1787913‑M2/37‑50 (MQ=255) tttACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCa < 1:3614966/48‑1 (MQ=255) ctccgctcacaattccacacattctacgagccggaTGATTAATTGTCaa < 2:2895154‑M2/14‑1 (MQ=255) atccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCaa > 2:2670356‑M2/36‑49 (MQ=255) atccgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCaa > 2:4561917‑M2/36‑49 (MQ=255) tACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACa < 1:2326298/49‑1 (MQ=255) cgctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTcagcag < 1:2775795‑M2/17‑1 (MQ=255) aCGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAg < 1:5324269/49‑1 (MQ=255) gctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCt < 1:3686770‑M2/19‑1 (MQ=255) gctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCt > 2:4492786‑M2/32‑50 (MQ=255) cGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGc < 2:366271/49‑1 (MQ=255) cGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCt < 1:467676/50‑1 (MQ=255) ctcacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCt > 1:3813261‑M2/31‑49 (MQ=255) tGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCa > 1:3875051/1‑50 (MQ=255) gAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCAt > 1:1521174/1‑50 (MQ=255) cacaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCAt > 2:232803‑M2/29‑50 (MQ=255) acaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCa < 1:3205569‑M2/21‑1 (MQ=255) acaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCAtt < 1:3995780‑M2/23‑1 (MQ=255) acaattccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCAt < 2:1175129‑M2/22‑1 (MQ=255) aaCTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCAtt > 2:2387009/1‑50 (MQ=255) aCTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCAttt < 2:3186348/50‑1 (MQ=255) cTTGCGTACTAGTTATCTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTc < 2:3261811/50‑1 (MQ=255) cTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCAttt > 1:1196559/1‑49 (MQ=255) cTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTc < 1:84452/50‑1 (MQ=255) cTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTc < 2:3843538/50‑1 (MQ=255) ttGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCAttt > 1:3459760/1‑48 (MQ=255) attccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCa < 2:275738‑M2/26‑1 (MQ=255) ttccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCAttt > 1:4731357‑M2/24‑47 (MQ=255) ttccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAg < 2:4746244‑M2/27‑1 (MQ=255) tGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCAttt > 1:720611/1‑47 (MQ=255) tccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCCTTTCAg > 2:4042721‑M2/23‑49 (MQ=255) tccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAg > 1:4162764‑M2/23‑49 (MQ=255) tccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAg > 2:3365461‑M2/23‑49 (MQ=255) gCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAg < 1:3942796/49‑1 (MQ=255) ccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGa < 2:2538692‑M2/28‑1 (MQ=255) ccacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGa < 1:3157526‑M2/28‑1 (MQ=255) cGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGaa > 2:4252128/1‑50 (MQ=255) cGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGaa > 1:1948320/1‑50 (MQ=255) cGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGa < 2:1375550/49‑1 (MQ=255) cGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGa < 1:3268570/49‑1 (MQ=255) gTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAat < 1:581698/50‑1 (MQ=255) cacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAat < 1:5047417‑M2/30‑1 (MQ=255) cacacattatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAat < 1:5117494‑M2/30‑1 (MQ=255) tACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAata > 2:4081154/1‑50 (MQ=255) aCTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAatat > 1:4866946/1‑50 (MQ=255) cTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAatat < 1:1268952/49‑1 (MQ=255) cTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAatat < 2:2262405/49‑1 (MQ=255) cTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATAtt > 1:210339/1‑50 (MQ=255) ttatacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGc > 2:769859‑M2/15‑50 (MQ=255) gTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGc < 2:3753062/50‑1 (MQ=255) ttAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGc > 2:3326398/1‑49 (MQ=255) tAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGc > 2:465647/1‑48 (MQ=255) tAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGc > 2:3508899/1‑48 (MQ=255) tacgagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCa < 2:5174623‑M2/38‑1 (MQ=255) aaCTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCa < 1:4505883/49‑1 (MQ=255) aCTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGa < 1:2201494/50‑1 (MQ=255) aCTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGa < 1:353527/50‑1 (MQ=255) tAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAc > 1:1024294/1‑50 (MQ=255) gagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAc < 2:4823315‑M2/42‑1 (MQ=255) gagccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAc < 1:1839907‑M2/42‑1 (MQ=255) agccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAcc > 1:2678778‑M2/8‑50 (MQ=255) agccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAcc < 1:1093421‑M2/43‑1 (MQ=255) aGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAcc > 2:2125056/1‑50 (MQ=255) aGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAcc > 2:3121420/1‑50 (MQ=255) gccggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCg > 2:4216718‑M2/7‑50 (MQ=255) ggaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTa > 1:2995831‑M2/4‑50 (MQ=255) gaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 2:3928089‑M2/3‑50 (MQ=255) gaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 1:1309549‑M2/3‑50 (MQ=255) gaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 2:1891789‑M2/3‑50 (MQ=255) gaTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 2:723483‑M2/3‑50 (MQ=255) aTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 1:3357289‑M2/2‑49 (MQ=255) aTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 2:3032888‑M2/2‑49 (MQ=255) aTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTAt > 2:2443975‑M2/2‑49 (MQ=255) aTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATg < 1:1415943‑M2/49‑1 (MQ=255) aTGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATg < 2:4165837‑M2/49‑1 (MQ=255) tgatTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTatga < 2:5012158/50‑1 (MQ=255) | TTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGA > NC_000913/1323082‑1323180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |