| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 366364 | 56 (0.510) | 146 (1.390) | 67/94 | 0.0 | 59.3% | intergenic (‑59/+64) | lacZ/lacI | beta‑galactosidase/DNA‑binding transcriptional repressor LacI |
| ? | NC_000913 | 1323131 = | 147 (1.400) | intergenic (‑49/‑89) | trpL/yciV | trp operon leader peptide/RNA/ssDNA 5'‑>3' exonuclease | |||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACAT > NC_000913/366315‑366413 | cTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGA > 1:1073061‑M1/1‑50 (MQ=255)cTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGA < 2:3229251‑M1/50‑1 (MQ=255) gtgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAt > 2:5327165‑M1/1‑48 (MQ=255) gtgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAg > 1:1560748/1‑50 (MQ=255) gtgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAg > 1:619591/1‑50 (MQ=255) gtgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAg > 1:2443649/1‑50 (MQ=255) tgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtga > 2:3803426‑M1/1‑47 (MQ=255) tgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAt < 2:3550813‑M1/48‑2 (MQ=255) tgtgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAt < 1:1668365‑M1/48‑2 (MQ=255) tgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgat < 2:4453613‑M1/49‑5 (MQ=255) tgAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa < 1:3712659/49‑1 (MQ=255) gAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgatt > 1:823838‑M1/1‑44 (MQ=255) gAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgatt > 1:463383‑M1/1‑44 (MQ=255) gAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgatt > 1:3829324‑M1/1‑44 (MQ=255) gAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgatt > 1:1867069‑M1/1‑44 (MQ=255) aaaTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaa < 2:2401860‑M1/50‑8 (MQ=255) aaaTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaa > 2:167381‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaa < 1:4957213/50‑1 (MQ=255) aaTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaat > 2:2932462‑M1/1‑42 (MQ=255) aTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaatt < 2:1558310‑M1/50‑10 (MQ=255) aTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaatt > 2:1137228‑M1/1‑41 (MQ=255) aTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaatt < 1:1458626‑M1/50‑10 (MQ=255) aTTGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaatt < 1:2559347‑M1/50‑10 (MQ=255) ttGTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattg < 2:1651771‑M1/50‑11 (MQ=255) gTTATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgt > 2:592837‑M1/1‑38 (MQ=255) ttATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtca < 1:3762394‑M1/50‑14 (MQ=255) ttATCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtc > 1:5095634‑M1/1‑37 (MQ=255) tATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa > 1:2702939/1‑49 (MQ=255) aTCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaa > 2:3257270‑M1/1‑35 (MQ=255) aTCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaa > 2:4561917‑M1/1‑35 (MQ=255) aTCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaa > 2:2670356‑M1/1‑35 (MQ=255) aTCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaa > 1:3798729‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCGCTCACAATTCCACGCATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaac < 2:3919653‑M1/49‑16 (MQ=255) tCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaaca < 1:386323‑M1/50‑17 (MQ=255) tCCGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaaca < 1:1945168‑M1/50‑17 (MQ=255) tCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAg < 1:3280665/50‑1 (MQ=255) cGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcagcag < 1:2775795‑M1/49‑18 (MQ=255) cGCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagc < 2:4146055‑M1/50‑19 (MQ=255) cGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGTATAAAGTGTAAAGcc < 1:2835799/50‑1 (MQ=255) cGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc < 1:1250603/50‑1 (MQ=255) gCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagct < 1:4015132‑M1/50‑20 (MQ=255) gCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagct < 1:3686770‑M1/50‑20 (MQ=255) gCTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagct > 2:845616‑M1/1‑31 (MQ=255) cTCACAATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctc < 1:4505480‑M1/50‑21 (MQ=255) cTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg > 2:5208018/1‑50 (MQ=255) cacaATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcat > 2:232803‑M1/1‑28 (MQ=255) cacaATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcat > 1:1899131‑M1/1‑28 (MQ=255) acaATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatt > 2:3323130‑M1/1‑27 (MQ=255) acaATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctca < 1:3205569‑M1/48‑22 (MQ=255) acaATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg < 1:31890/49‑1 (MQ=255) caATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcattt > 2:40184‑M1/1‑26 (MQ=255) caATTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcattt < 2:4782933‑M1/50‑25 (MQ=255) caATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGt > 1:4705130/1‑50 (MQ=255) aaTTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttc < 2:4238484‑M1/50‑26 (MQ=255) aTTCGACACATTATACGAGCCGGAtgattacttgtcaacagctcattt > 2:3114441‑M1/1‑24 (MQ=255) aTTCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcattt > 2:1380188‑M1/1‑24 (MQ=255) ttCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcattt > 1:1691622‑M1/1‑23 (MQ=255) ttCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcattt > 1:4731357‑M1/1‑23 (MQ=255) tCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcag > 1:4162764‑M1/1‑22 (MQ=255) tCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcag > 2:3365461‑M1/1‑22 (MQ=255) tCCACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcag > 1:1297247‑M1/1‑22 (MQ=255) ccACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcaga < 2:4202069‑M1/49‑29 (MQ=255) ccACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcaga < 2:2538692‑M1/49‑29 (MQ=255) ccACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcaga < 1:3157526‑M1/49‑29 (MQ=255) ccACACATTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcaga < 1:3448828‑M1/49‑29 (MQ=255) cacacaTTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaat < 1:2918512‑M1/50‑31 (MQ=255) cacacaTTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaat < 1:5117494‑M1/50‑31 (MQ=255) cacacaTTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaa > 2:1335664‑M1/1‑20 (MQ=255) cacacaTTATACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaa > 1:1095736‑M1/1‑20 (MQ=255) acacaACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAt > 2:5387637/1‑50 (MQ=255) acacaACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAt < 1:1524082/50‑1 (MQ=255) acacaACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCATGGGGCGCCTAAt > 1:2287255/1‑50 (MQ=255) aacaTACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtgagt < 1:3519427/50‑1 (MQ=255) ttataCGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgc > 2:769859‑M1/3‑14 (MQ=255) acaTGCGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtgagtg < 2:1296052/50‑1 (MQ=255) tatACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgc > 2:646810‑M1/2‑13 (MQ=255) aTACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgcc < 1:3921210‑M1/49‑38 (MQ=255) tACGAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgc > 1:2179664‑M1/1‑11 (MQ=255) tACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGc < 2:22025/50‑1 (MQ=255) gAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaac > 2:2892672‑M1/1‑8 (MQ=255) gAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaac > 2:1218642‑M1/1‑8 (MQ=255) gAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaac < 2:4823315‑M1/50‑43 (MQ=255) gAGCCGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaac < 2:2254831‑M1/50‑43 (MQ=255) gCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACt > 1:2211156/1‑50 (MQ=255) ccGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACt > 1:1005698/1‑49 (MQ=255) cGGAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgt > 2:4739671‑M1/1‑4 (MQ=255) ggAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgtta > 2:3958499‑M1/1‑3 (MQ=255) ggAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgtta < 2:5046134‑M1/50‑48 (MQ=255) ggAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgtta > 2:1188278‑M1/1‑3 (MQ=255) ggAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgtta > 1:1824866‑M1/1‑3 (MQ=255) ggAtgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgtta > 1:2995831‑M1/1‑3 (MQ=255) ggAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTca > 1:4824367/1‑49 (MQ=255) gatgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgttat > 2:1891789‑M1/1‑2 (MQ=255) gatgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgttat > 2:723483‑M1/1‑2 (MQ=255) gatgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgttat > 2:919492‑M1/1‑2 (MQ=255) gAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTcaca < 2:1849653/50‑1 (MQ=255) gAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTcaca > 1:5206891/1‑50 (MQ=255) atgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgttat > 2:3032888‑M1/1‑1 (MQ=255) atgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgttat > 2:2443975‑M1/1‑1 (MQ=255) atgattaattgtcaacagctcatttcagaatatttgccagaaccgttat > 1:4996882‑M1/1‑1 (MQ=255) | CTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACAT > NC_000913/366315‑366413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |