| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 13 (0.120) | 112 (1.040) | 67/96 | 0.0 | 91.5% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 8 (0.070) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT > NC_000913/1398623‑1398671 ACGTCACTCCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 1:2931798/50‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 2:1625840/50‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 1:2349612/50‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 2:1454199/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 1:3339840/50‑1 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:3789046/50‑1 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 2:3427652/50‑1 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 2:51479/1‑50 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 1:5133104/1‑50 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 2:1467282/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG < 2:3084825/50‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:726459/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 1:886002/49‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 1:969424/49‑1 CACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGT > 2:4518552/1‑50 CACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGT > 1:2744505/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:3424837/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 2:3132383/50‑1 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:4246035/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:3228592/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:4535900/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:5088619/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 2:1576749/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:2005676/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:2472015/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 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1:741215/50‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:983188/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:1175249/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 2:1561209/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 2:2153826/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:2036518/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 2:553081/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:3311011/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4495504/1‑49 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4406518/1‑49 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:779371/1‑49 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:5363136/1‑48 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4998101/1‑48 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 2:3941137/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:206364/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT > 2:5280805/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT > 2:1766526/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:3760240/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG < 1:1418768/49‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG < 1:2045983/49‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 2:136098/50‑1 aaAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCGTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 2:3183736/48‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:959520/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:113846/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:1800045/1‑50 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT < 1:1916298/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT < 1:37816/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:3913409/1‑49 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 2:3217604/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:4793350/50‑1 CAAACCCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 2:2057862/1‑50 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 2:2682638/1‑50 agCGCTATTACAGGGTCTCCTTACGACAACTGTCAACGCGGTTTGTAATT < 1:1830101/48‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 2:1920991/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGCCAACGCAGTTTGTAAT > 2:5018283/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA < 2:5205581/50‑1 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 2:4319452/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:1181687/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 2:1126486/1‑49 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:3645556/1‑47 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 2:4515971/1‑46 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 2:3840610/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 2:1183803/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 2:1375879/1‑50 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:2899797/48‑1 TACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT < 2:1444815/50‑1 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT > NC_000913/1398623‑1398671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |