| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1400324 | 10 (0.090) | 111 (1.010) | 57/98 | 0.1 | 90.6% | coding (1450/1527 nt) | abgT | p‑aminobenzoyl glutamate:H(+) symporter |
| ? | NC_000913 | 1482256 = | 13 (0.120) | coding (605/606 nt) | azoR | FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CCTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGCAACATCAGCAGCCATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1400275‑1400324‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTT > NC_000913/1482256‑1482304 CTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCCGCCATACTAT > 2:5215530/1‑50 CTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTAT > 2:3514038/1‑50 CTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTAT < 1:1836900/50‑1 CTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTAT > 1:2740692/1‑50 CTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTAT > 1:2550098/1‑50 TATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG > 2:3663864/1‑50 TATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG > 1:1513384/1‑50 TATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG > 2:725151/1‑50 ATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG > 1:4468845/1‑49 ATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG > 2:524827/1‑49 TCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCA < 2:2992384/50‑1 TCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG < 2:4152716/48‑1 TCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG < 2:1116333/48‑1 TCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACAGC‑GCAGCCATACTATGCA < 2:2276548/50‑1 CGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATG > 1:4490945/1‑47 GGCAGACCGACAAGGTACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAG < 2:3603924/49‑1 GCAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAA < 2:1817558/50‑1 CAGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAA < 1:3520184/50‑1 AGACTGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAA > 2:235366/1‑49 AGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAAC < 2:2484021/50‑1 AGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAA > 2:3942373/1‑49 AGACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAA > 1:3447053/1‑49 GACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACA < 2:1317150/50‑1 GACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAAC > 1:2300411/1‑49 GACCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAAC > 2:1419719/1‑49 CCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAAT > 2:2247009/1‑50 CCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAAT < 1:1017874/50‑1 CCGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAAT < 1:3608696/50‑1 CGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATG > 1:656151/1‑50 CGACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATG < 1:3375119/50‑1 GACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGC > 1:4183500/1‑50 GACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGC > 1:675691/1‑50 GACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCAAACTATGCAGAAACAATGC > 2:4174205/1‑50 ACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCT > 1:1956669/1‑50 ACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCT < 2:1592199/50‑1 ACAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCT < 1:545740/50‑1 CAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTG < 1:906676/50‑1 CAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTG < 2:1114170/50‑1 CAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTG > 2:3568443/1‑50 CAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTG < 1:4520028/50‑1 CAAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTG > 2:2874351/1‑50 AAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGT > 2:3373286/1‑50 AAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGT > 2:3673665/1‑50 AAGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGT < 2:2350279/50‑1 AGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTC < 2:4453298/50‑1 AGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTC < 2:2952782/50‑1 AGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTC < 1:4089028/50‑1 AGATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTC > 1:5384981/1‑50 GATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCG < 1:2395287/50‑1 ATACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGA < 1:4388648/50‑1 TACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGAT < 1:2648631/50‑1 TACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGAT < 1:3940079/50‑1 TACCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGAT > 2:547668/1‑50 CCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGG > 2:2878171/1‑50 CCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGG > 1:3735321/1‑50 CCACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATG < 1:5012823/49‑1 CACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGC > 1:3963888/1‑50 ACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGCTGGCc > 2:621842/1‑49 ACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCT > 2:1316140/1‑50 ACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCT > 1:1985658/1‑50 ACGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCT < 2:797130/50‑1 CGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTG < 2:4273631/50‑1 CGCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTG > 2:3815355/1‑50 GCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGC < 2:2652381/50‑1 GCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGC > 1:1066729/1‑50 GCCAGC‑ACATC‑GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGC > 2:212463/1‑50 tcGCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTC < 2:4494300/48‑1 tcGCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTC < 1:180435/48‑1 tcGCAGCCATACTAAGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGT > 2:556576/3‑49 GCAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGT > 1:744815/1‑47 CAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGA < 2:1246513/50‑1 CAGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGA > 1:4200158/1‑50 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC > 1:4706153/1‑50 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC > 2:4402597/1‑50 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC < 1:2973493/50‑1 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC > 1:2482198/1‑50 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC > 1:3686583/1‑50 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC < 2:715681/50‑1 AGCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAC < 2:749851/50‑1 GCCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACT > 2:3380753/1‑50 CCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTG > 2:1798354/1‑50 CCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTG < 2:2865947/50‑1 CCATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTG < 2:4366464/50‑1 CATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGT > 1:4708411/1‑50 CATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGT < 2:4055154/50‑1 CATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGT < 2:1383885/50‑1 ATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTG > 1:130323/1‑50 ATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTG > 1:2343851/1‑50 ATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTG > 2:2591754/1‑50 ATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTG > 1:3318699/1‑50 ATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTG > 1:4190662/1‑50 ATACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTG > 1:4220011/1‑50 TACTATGCAGAAACAATGCTGTCGCTGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGC > 2:3730137/1‑50 TACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGC < 2:4182574/50‑1 TACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGC > 1:2316031/1‑50 TACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGC > 1:1994549/1‑50 TACTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGC < 1:4913955/50‑1 CTATGCAGAAACACTGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTT > 2:1259079/1‑50 CTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTT < 1:153995/50‑1 CTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCT < 2:223794/49‑1 CCTATCGGCAGACCGACAAGATACCACGCCAGCAACATCAGCAGCCATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1400275‑1400324‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTT > NC_000913/1482256‑1482304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |