| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1400324 | 10 (0.090) | 111 (1.010) | 57/98 | 0.1 | 90.6% | coding (1450/1527 nt) | abgT | p‑aminobenzoyl glutamate:H(+) symporter |
| ? | NC_000913 | 1482256 = | 13 (0.120) | coding (605/606 nt) | azoR | FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTT > NC_000913/1482208‑1482305 | cctatcggcggaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatactg < 2:5104904‑M2/2‑2 (MQ=255) gagaTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTa < 1:3492864/49‑1 (MQ=255) ctatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgccgccatacTAt > 2:5215530‑M2/48‑50 (MQ=255) ctatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTAt < 1:1836900‑M2/3‑1 (MQ=255) ctatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTAt > 2:3514038‑M2/48‑50 (MQ=255) ctatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTAt < 2:1488310‑M2/3‑1 (MQ=255) ctatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTAt > 1:2550098‑M2/48‑50 (MQ=255) tatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg > 2:3663864‑M2/47‑50 (MQ=255) tatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg > 2:725151‑M2/47‑50 (MQ=255) tatcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg > 1:1513384‑M2/47‑50 (MQ=255) agaTGTGGACTGAATATCTACACTCCGGATCAAGGCCGTTCCCGGTTAt < 2:4142008/49‑1 (MQ=19) atcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg > 1:4468845‑M2/46‑49 (MQ=255) atcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg > 2:524827‑M2/46‑49 (MQ=255) tcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg < 2:4152716‑M2/4‑1 (MQ=255) tcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg < 2:1116333‑M2/4‑1 (MQ=255) tcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg < 2:4024954‑M2/4‑1 (MQ=255) tcggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCa < 2:2992384‑M2/6‑1 (MQ=255) tcggcagaccgacaagataccacgccagcacagcgcagccatacTATGCa < 2:2276548‑M2/6‑1 (MQ=255) cggcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATg > 1:4490945‑M2/44‑47 (MQ=255) ggcagaccgacaaggtaccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAg < 2:3603924‑M2/7‑1 (MQ=255) gcagaccgacaagatacctcgccagcacatcgcagccatacTATGCAGaa < 1:757698‑M2/9‑1 (MQ=255) gcagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGaa < 2:1817558‑M2/9‑1 (MQ=255) cagaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGaaa < 1:3520184‑M2/10‑1 (MQ=255) agactgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGaaa > 2:235366‑M2/40‑49 (MQ=255) agaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGaaa > 2:3942373‑M2/40‑49 (MQ=255) agaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAAc < 2:2484021‑M2/11‑1 (MQ=255) gaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAAc > 1:2300411‑M2/39‑49 (MQ=255) gaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAAc > 2:1419719‑M2/39‑49 (MQ=255) gaccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACa < 2:1317150‑M2/12‑1 (MQ=255) ccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAAt < 1:1017874‑M2/14‑1 (MQ=255) ccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAAt < 1:3608696‑M2/14‑1 (MQ=255) ccgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAAt > 2:2247009‑M2/37‑50 (MQ=255) cgacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATg < 1:3375119‑M2/15‑1 (MQ=255) gacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGc > 1:4183500‑M2/35‑50 (MQ=255) gacaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGc > 1:675691‑M2/35‑50 (MQ=255) gacaagataccacgccagcacatcgcagccaaacTATGCAGAAACAATGc > 2:4174205‑M2/35‑50 (MQ=255) aaTATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATg < 2:3604317/49‑1 (MQ=255) acaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCt > 1:1956669‑M2/34‑50 (MQ=255) acaagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCt < 1:545740‑M2/17‑1 (MQ=255) caagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTg < 1:906676‑M2/18‑1 (MQ=255) caagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTg > 2:2874351‑M2/33‑50 (MQ=255) aagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGt > 2:3373286‑M2/32‑50 (MQ=255) aagataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGt < 2:2350279‑M2/19‑1 (MQ=255) tCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTc > 2:2562585/1‑50 (MQ=255) agataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTc < 2:2952782‑M2/20‑1 (MQ=255) agataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTc < 1:4089028‑M2/20‑1 (MQ=255) agataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTc > 1:5384981‑M2/31‑50 (MQ=255) agataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTc < 2:4453298‑M2/20‑1 (MQ=255) gataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCg < 1:2395287‑M2/21‑1 (MQ=255) cTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTc > 1:616868/1‑49 (MQ=255) ataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGa > 2:3374714‑M2/29‑50 (MQ=255) ataccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGa < 1:4388648‑M2/22‑1 (MQ=255) taccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGAt > 2:547668‑M2/28‑50 (MQ=255) taccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGAt < 1:3940079‑M2/23‑1 (MQ=255) taccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGAt < 1:2648631‑M2/23‑1 (MQ=255) taccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGAt < 1:4700600‑M2/23‑1 (MQ=255) cAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGa < 1:2082436/48‑1 (MQ=255) cAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATg < 2:5032617/50‑1 (MQ=255) cAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATg > 1:3550564/1‑50 (MQ=255) ccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATgg > 2:2878171‑M2/26‑50 (MQ=255) ccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATgg > 1:3735321‑M2/26‑50 (MQ=255) ccacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATg < 1:2046190‑M2/24‑1 (MQ=255) cacgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgc > 1:3963888‑M2/25‑50 (MQ=255) acgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGCTggcc > 2:621842‑M2/24‑49 (MQ=255) acgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct < 2:797130‑M2/27‑1 (MQ=255) acgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 1:1985658‑M2/24‑50 (MQ=255) cgccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctg > 2:3815355‑M2/23‑50 (MQ=255) gccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgc > 1:1066729‑M2/22‑50 (MQ=255) gccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgc > 2:212463‑M2/22‑50 (MQ=255) gccagcacatcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgc < 2:2652381‑M2/29‑1 (MQ=255) gACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt < 1:409504/50‑1 (MQ=255) tcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTc < 2:4494300‑M2/38‑1 (MQ=255) tcgcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTc < 1:180435‑M2/38‑1 (MQ=255) tcgcagccatacTAAGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt > 2:556576‑M2/13‑49 (MQ=255) gcagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt > 1:744815‑M2/11‑47 (MQ=255) cagccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGa < 2:1246513‑M2/41‑1 (MQ=255) agccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAc > 1:4706153‑M2/9‑50 (MQ=255) agccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAc < 2:749851‑M2/42‑1 (MQ=255) agccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAc > 1:2482198‑M2/9‑50 (MQ=255) agccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAc > 2:4402597‑M2/9‑50 (MQ=255) agccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGAc < 1:2973493‑M2/42‑1 (MQ=255) gtCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACt > 2:627933/1‑50 (MQ=255) gccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACt > 2:3380753‑M2/8‑50 (MQ=255) ccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtg < 2:4366464‑M2/44‑1 (MQ=255) ccatacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtg > 2:1798354‑M2/7‑50 (MQ=255) catacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgt > 1:4708411‑M2/6‑50 (MQ=255) catacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgt < 2:1383885‑M2/45‑1 (MQ=255) catacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgt > 1:3288844‑M2/6‑50 (MQ=255) atacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgtg > 1:4190662‑M2/5‑50 (MQ=255) atacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgtg > 1:130323‑M2/5‑50 (MQ=255) atacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgtg > 1:3318699‑M2/5‑50 (MQ=255) atacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgtg > 1:4220011‑M2/5‑50 (MQ=255) atacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgtg > 2:2591754‑M2/5‑50 (MQ=255) tacTATGCAGAAACAATGCTGTCGCTGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGc > 2:3730137‑M2/4‑50 (MQ=255) tacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGc < 2:4182574‑M2/47‑1 (MQ=255) tacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGc > 1:2316031‑M2/4‑50 (MQ=255) tacTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGc < 1:4913955‑M2/47‑1 (MQ=255) gTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCt < 2:163818/50‑1 (MQ=255) cTATGCAGAAACACTGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCtt > 2:1259079‑M2/2‑50 (MQ=255) tATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCttt > 1:5242768/1‑50 (MQ=255) | TGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTT > NC_000913/1482208‑1482305 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |