| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1509561 | 9 (0.080) | 134 (1.220) | 70/98 | 0.0 | 92.7% | coding (54/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 1555763 = | 12 (0.110) | intergenic (‑94/+63) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1509514‑1509561‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGA > NC_000913/1555763‑1555811 TATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTA > 1:667384/1‑49 ATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAA > 1:1311188/1‑50 ATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAA > 1:2597707/1‑50 ATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAA < 1:4534832/49‑1 ATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAA < 1:4686696/49‑1 TCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAAC < 1:3028990/50‑1 TCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAA > 2:75450/1‑49 TCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAA < 2:464444/49‑1 TCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAA > 1:2140644/1‑49 TCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAA < 2:1358005/49‑1 CCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAAC > 2:4600519/1‑49 CCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAA < 1:2957387/50‑1 CCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACA > 1:3910274/1‑49 CCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACA < 2:1265094/49‑1 CGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAA > 1:1178815/1‑49 GTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAA > 1:4222404/1‑49 TCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAA < 2:2672130/50‑1 TCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAA < 1:591699/50‑1 CACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAA > 2:2836150/1‑49 ACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACA > 2:3105673/1‑50 CTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACAC < 1:4206772/50‑1 TTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCAT > 1:4599777/1‑50 TTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACC < 1:1456090/48‑1 TACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATT > 1:1752981/1‑50 ACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATT < 2:1970169/49‑1 ACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCAT < 2:1516272/48‑1 ACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCAT < 1:2607191/48‑1 ACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCAT < 2:2678662/48‑1 ACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCAT < 1:3217649/48‑1 ACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCA < 1:835751/47‑1 CACCCGCGCCTGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGC < 2:3793047/50‑1 CACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGC < 1:3037061/50‑1 CACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGC < 2:2580615/50‑1 CACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGC < 2:2334037/50‑1 CACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGC < 1:4322372/50‑1 CACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTG < 2:4938973/49‑1 ACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCG < 2:3414171/50‑1 ACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCG > 1:49497/1‑50 ACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCG < 1:2767651/50‑1 CCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGC < 2:5159209/50‑1 CCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCG > 1:3842610/1‑49 CCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCG > 2:449247/1‑48 CGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAG < 2:5221381/50‑1 CGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAG < 1:3468857/50‑1 GCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGG < 2:4931303/50‑1 GCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGG < 1:5054912/50‑1 CGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGC < 2:3218156/50‑1 CGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGC < 1:1131690/50‑1 GCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCA < 2:1343899/50‑1 CCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAA > 1:220956/1‑50 CCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAA > 2:1824983/1‑50 CGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAAT > 1:1721892/1‑50 CGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAAT > 2:758319/1‑50 GGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATG > 1:2140912/1‑50 GGAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATG > 2:2019513/1‑50 GAAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGG < 2:2423719/50‑1 AAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGg > 2:2545275/1‑49 AAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGT < 1:4210115/50‑1 AAGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGT > 1:4860045/1‑50 AGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTG < 2:4362996/50‑1 AGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTG > 1:2253973/1‑50 AGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTG < 2:5389572/50‑1 AGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTG > 2:2688901/1‑50 AGGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTG < 1:515797/50‑1 GGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGT > 2:1629885/1‑50 GGCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGT > 1:1219233/1‑50 GCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACGCCATTGCGCAGGCAATGGTGTT < 2:4757009/50‑1 GCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTT > 2:557274/1‑50 GCGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTT < 1:4760595/50‑1 CGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTT < 1:2264158/50‑1 CGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTT < 2:2566883/50‑1 CGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTT > 2:4125595/1‑49 CGGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTT > 1:4645478/1‑49 GGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTA < 1:5298572/50‑1 GGTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTA < 2:5057634/50‑1 GTTATCTGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCACTGGTGTTTAA > 1:4875389/1‑50 GTTATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAA > 1:1858624/1‑50 TATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATC > 2:2040538/1‑50 TATACGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATC > 1:1952375/1‑50 ATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATC < 1:3503039/49‑1 ATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATC < 1:3508376/49‑1 ATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATC < 2:628159/49‑1 ATATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATC < 1:4943535/49‑1 TATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGT < 1:3918105/50‑1 TATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGT < 2:2810802/50‑1 TATGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCG < 2:3568393/49‑1 TGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCA < 1:32431/50‑1 TGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCA > 2:3904686/1‑50 TGGTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTC < 2:2291515/49‑1 GTTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATT < 1:1554108/50‑1 TTTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATT > 2:1269804/1‑49 TTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATT > 2:1033603/1‑48 TTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATT > 2:1166814/1‑48 TTCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATT > 2:1735934/1‑48 TCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAG > 1:3325284/1‑50 TCTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGA < 2:3227580/49‑1 CTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAG > 1:4989557/1‑49 CTAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAG < 2:1109003/49‑1 TAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGA > 2:4061453/1‑50 TAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGA > 1:432490/1‑50 TATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1509514‑1509561‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGA > NC_000913/1555763‑1555811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |