| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1509561 | 9 (0.080) | 134 (1.220) | 70/98 | 0.0 | 92.7% | coding (54/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 1555763 = | 12 (0.110) | intergenic (‑94/+63) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GTTATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGTTGACCCAGGGCGAAACTGTCGCTGAAG > NC_000913/1509512‑1509610 | gTTATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCt < 1:3643315/50‑1 (MQ=255) ttATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCt > 2:2100903/1‑49 (MQ=255) ttATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCt > 1:5247330/1‑49 (MQ=255) tATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTa > 1:667384‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCttt < 1:3320172/49‑1 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 1:1311188‑M1/1‑47 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 1:2597707‑M1/1‑47 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaa < 1:2369250‑M1/49‑3 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaa < 1:4534832‑M1/49‑3 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaa < 2:5301315‑M1/49‑3 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaa < 1:4686696‑M1/49‑3 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 2:75450‑M1/1‑46 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa < 2:464444‑M1/49‑4 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 1:2140644‑M1/1‑46 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa < 2:1358005‑M1/49‑4 (MQ=255) cccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac > 2:4600519‑M1/1‑45 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaa < 1:2957387‑M1/50‑7 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaaca < 1:4268076‑M1/49‑6 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaaca > 1:3910274‑M1/1‑44 (MQ=255) cGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaa > 2:1322536‑M1/1‑43 (MQ=255) cGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaa > 1:1178815‑M1/1‑43 (MQ=255) gTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaa > 1:4222404‑M1/1‑42 (MQ=255) gTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGa < 2:2503573/50‑1 (MQ=255) tCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaa < 1:591699‑M1/50‑10 (MQ=255) cACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaa > 2:2836150‑M1/1‑40 (MQ=255) aCTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaaca > 2:3105673‑M1/1‑39 (MQ=255) ctctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac < 1:4206772‑M1/50‑13 (MQ=255) tctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac > 2:2173473‑M1/1‑37 (MQ=255) ttACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacc < 1:1456090‑M1/48‑14 (MQ=255) tACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt > 1:1870586‑M1/1‑34 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 2:1970169‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat < 2:1516272‑M1/48‑16 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat < 1:2607191‑M1/48‑16 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat < 2:2678662‑M1/48‑16 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacca < 1:835751‑M1/47‑15 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:3037061‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:4322372‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 2:2334037‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 2:2580615‑M1/50‑19 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:4598081‑M1/50‑20 (MQ=255) cccGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg > 1:3842610‑M1/1‑30 (MQ=255) ccGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgca < 2:2721967‑M1/50‑22 (MQ=255) ccGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg > 2:449247‑M1/1‑29 (MQ=255) cgcgCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcag < 1:3468857‑M1/50‑23 (MQ=255) cgcgCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcag < 2:5221381‑M1/50‑23 (MQ=255) gcgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcagg < 2:4931303‑M1/50‑24 (MQ=255) gcgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGtt > 1:4593572/1‑50 (MQ=255) cgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc < 2:3218156‑M1/50‑25 (MQ=255) cgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc < 1:295337‑M1/50‑25 (MQ=255) cgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc < 1:1131690‑M1/50‑25 (MQ=255) gcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc > 2:2632342‑M1/1‑25 (MQ=255) gcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc > 1:569494‑M1/1‑25 (MQ=255) ccGGATGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaa > 2:342‑M1/1‑24 (MQ=255) ccGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaa > 2:3970900‑M1/1‑24 (MQ=255) ccGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaa > 1:220956‑M1/1‑24 (MQ=255) ccGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaa > 2:1824983‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaat > 2:758319‑M1/1‑23 (MQ=255) cGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaat > 1:1721892‑M1/1‑23 (MQ=255) ggAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatg > 1:2140912‑M1/1‑22 (MQ=255) ggAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatg > 2:2019513‑M1/1‑22 (MQ=255) ggAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGTTGAccc < 1:2413002/50‑1 (MQ=255) gAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatgg < 2:2423719‑M1/50‑30 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggt > 1:4860045‑M1/1‑20 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggg > 2:2545275‑M1/1‑20 (MQ=255) aGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtg < 2:4362996‑M1/50‑32 (MQ=255) aGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtg > 1:2253973‑M1/1‑19 (MQ=255) aGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtg < 1:515797‑M1/50‑32 (MQ=255) aGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtg > 2:2688901‑M1/1‑19 (MQ=255) ggCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgt > 2:1629885‑M1/1‑18 (MQ=255) ggCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgt > 1:1219233‑M1/1‑18 (MQ=255) gCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacgccattgcgcaggcaatggtgtt < 2:4757009‑M1/50‑34 (MQ=255) gCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt < 1:4760595‑M1/50‑34 (MQ=255) gCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt > 2:557274‑M1/1‑17 (MQ=255) cGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt < 1:2264158‑M1/50‑35 (MQ=255) cGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt > 2:4125595‑M1/1‑16 (MQ=255) cGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt > 1:4645478‑M1/1‑16 (MQ=255) ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttta < 2:5057634‑M1/50‑36 (MQ=255) gTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaa > 1:1858624‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaa > 2:1144609‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaa > 1:3461406‑M1/1‑14 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcg > 1:3158375‑M1/1‑11 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc < 2:628159‑M1/49‑39 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc < 1:3503039‑M1/49‑39 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc < 1:4943535‑M1/49‑39 (MQ=255) atatGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGTTGACCCAGGGCGAAACt > 1:3570275/1‑50 (MQ=255) tatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcg < 2:3568393‑M1/49‑40 (MQ=255) tGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtca < 1:32431‑M1/50‑43 (MQ=255) tGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtca > 2:3904686‑M1/1‑8 (MQ=255) ggTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcat > 2:5010362‑M1/1‑7 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattg < 1:4000509‑M1/50‑46 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 2:1269804‑M1/1‑5 (MQ=255) ttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 2:1735934‑M1/1‑4 (MQ=255) ttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 2:1166814‑M1/1‑4 (MQ=255) ttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 2:1033603‑M1/1‑4 (MQ=255) tCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattga < 2:3227580‑M1/49‑47 (MQ=255) tCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattga < 1:4875505‑M1/49‑47 (MQ=255) tCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattga < 1:5007857‑M1/49‑47 (MQ=255) cTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattgag > 1:4989557‑M1/1‑2 (MQ=255) cTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattgag > 1:1621229‑M1/1‑2 (MQ=255) taaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattgagga > 1:432490‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTTATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGTTGACCCAGGGCGAAACTGTCGCTGAAG > NC_000913/1509512‑1509610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |