| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1509561 | 9 (0.080) | 134 (1.220) | 70/98 | 0.0 | 92.7% | coding (54/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 1555763 = | 12 (0.110) | intergenic (‑94/+63) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGAC > NC_000913/1555716‑1555812 | tCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATaaaaa > 2:3356367/1‑50 (MQ=255)atcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaaa > 1:1311188‑M2/48‑50 (MQ=255)atcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaaa > 1:2597707‑M2/48‑50 (MQ=255)atcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaa < 2:5301315‑M2/2‑1 (MQ=255)atcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaa < 1:4534832‑M2/2‑1 (MQ=255) tcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaaa > 2:75450‑M2/47‑49 (MQ=255) tcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaaa < 2:1358005‑M2/3‑1 (MQ=255) tcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaaa > 1:2140644‑M2/47‑49 (MQ=255) tcccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctaaa < 2:464444‑M2/3‑1 (MQ=255) ccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACaa < 1:2957387‑M2/6‑1 (MQ=255) ccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACa < 2:1265094‑M2/5‑1 (MQ=255) ccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACa > 1:3910274‑M2/45‑49 (MQ=255) ccgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACa < 1:4268076‑M2/5‑1 (MQ=255) cgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACaa > 1:2177541‑M2/44‑49 (MQ=255) cgtcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACaa > 1:1178815‑M2/44‑49 (MQ=255) gCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATaaaaacaaa < 1:3293448/49‑1 (MQ=255) tcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACaaaaa < 2:2672130‑M2/9‑1 (MQ=255) tcactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACaaaaa < 1:591699‑M2/9‑1 (MQ=255) cactcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACaaaaa > 2:2836150‑M2/41‑49 (MQ=255) actcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAaca > 2:3105673‑M2/40‑50 (MQ=255) tACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATaaaaacaaaaac < 1:1002423/48‑1 (MQ=255) ctcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAacac < 1:4206772‑M2/12‑1 (MQ=255) tcttacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAacac > 2:2173473‑M2/38‑49 (MQ=255) tacacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCAtt > 1:1752981‑M2/35‑50 (MQ=255) acacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCa < 1:835751‑M2/14‑1 (MQ=255) acacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCAtt < 2:1538658‑M2/16‑1 (MQ=255) acacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCAt < 1:2607191‑M2/15‑1 (MQ=255) cacccgcgcctgaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgc < 2:3793047‑M2/18‑1 (MQ=255) cacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgc < 1:3821111‑M2/18‑1 (MQ=255) cacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgc < 1:3037061‑M2/18‑1 (MQ=255) cacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgc < 1:4322372‑M2/18‑1 (MQ=255) cacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgc < 2:2580615‑M2/18‑1 (MQ=255) cacccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTg < 2:4938973‑M2/17‑1 (MQ=255) acccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgcg < 2:3414171‑M2/19‑1 (MQ=255) acccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgcg > 1:49497‑M2/32‑50 (MQ=255) acccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgcg < 1:4598081‑M2/19‑1 (MQ=255) cccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgcgc < 2:5159209‑M2/20‑1 (MQ=255) ccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTgcg > 2:449247‑M2/30‑48 (MQ=255) ccgcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCa < 2:2721967‑M2/21‑1 (MQ=255) gcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAgg < 2:4931303‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAgg < 1:5054912‑M2/23‑1 (MQ=255) cgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGc < 1:4753788‑M2/24‑1 (MQ=255) cgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGc < 1:1131690‑M2/24‑1 (MQ=255) cgccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGc < 1:295337‑M2/24‑1 (MQ=255) gccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGc > 2:2632342‑M2/26‑49 (MQ=255) gccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGc > 1:569494‑M2/26‑49 (MQ=255) gccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCa < 2:1829219‑M2/25‑1 (MQ=255) gccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCa < 2:1343899‑M2/25‑1 (MQ=255) ccggatggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCaa > 2:342‑M2/25‑50 (MQ=255) ccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCaa > 2:1824983‑M2/25‑50 (MQ=255) ccggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCaa > 1:220956‑M2/25‑50 (MQ=255) cggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAAt > 2:758319‑M2/24‑50 (MQ=255) ggaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATg > 2:2019513‑M2/23‑50 (MQ=255) gCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATg < 1:642169/50‑1 (MQ=255) gaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATgg < 2:2423719‑M2/29‑1 (MQ=255) gaaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATgg > 2:4688176‑M2/22‑50 (MQ=255) aaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGgt > 1:4860045‑M2/21‑50 (MQ=255) aaggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGgt < 1:4210115‑M2/30‑1 (MQ=255) aggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGgtg > 2:2688901‑M2/20‑50 (MQ=255) aggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGgtg < 2:5389572‑M2/31‑1 (MQ=255) aggcgggtatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAatggcg > 2:3110254‑M2/20‑48 (MQ=255) ggcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGgtgt > 2:1629885‑M2/19‑50 (MQ=255) gcggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGtt > 2:557274‑M2/18‑50 (MQ=255) cggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGttt < 2:2566883‑M2/34‑1 (MQ=255) cggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGttt < 1:2264158‑M2/34‑1 (MQ=255) cggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGtt > 2:4125595‑M2/17‑49 (MQ=255) cggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGtt > 1:4645478‑M2/17‑49 (MQ=255) aGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGttt < 1:3368465/50‑1 (MQ=255) ggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTa < 2:4431912‑M2/35‑1 (MQ=255) ggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTa < 2:5057634‑M2/35‑1 (MQ=255) ggttatatggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTa < 1:5298572‑M2/35‑1 (MQ=255) gTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGttt > 1:474643/1‑49 (MQ=255) 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aaGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGt > 1:685182/1‑50 (MQ=255) tggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTc < 2:2291515‑M2/41‑1 (MQ=255) tggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCa < 1:32431‑M2/42‑1 (MQ=255) tggtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCa > 2:3904686‑M2/9‑50 (MQ=255) cAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCAt < 1:2344036/50‑1 (MQ=255) gtttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCAtt < 1:1554108‑M2/44‑1 (MQ=255) tttctAAACAAAAACACCATTGCTCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCAtt > 2:245428‑M2/6‑49 (MQ=255) tttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCAtt > 2:1269804‑M2/6‑49 (MQ=255) ttctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCAtt > 1:1276810‑M2/5‑48 (MQ=255) tctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGa < 2:3227580‑M2/46‑1 (MQ=255) tctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGa < 1:5007857‑M2/46‑1 (MQ=255) tctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGa < 1:681664‑M2/46‑1 (MQ=255) ctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAg > 1:1621229‑M2/3‑49 (MQ=255) ctAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAg < 2:1109003‑M2/47‑1 (MQ=255) tAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGa > 2:4061453‑M2/2‑50 (MQ=255) aaacaaaaacaCCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGAc > 1:4640414/1‑50 (MQ=255) | TCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGAC > NC_000913/1555716‑1555812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |