| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3090346 | 12 (0.110) | 138 (1.260) | 65/98 | 0.0 | 92.6% | intergenic (+94/‑1) | yggI/endA | conserved protein YggI/DNA‑specific endonuclease I |
| ? | NC_000913 | 3091055 = | 10 (0.090) | intergenic (+1/‑79) | endA/rsmE | DNA‑specific endonuclease I/16S rRNA m(3)U1498 methyltransferase | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3090297‑3090346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTACAAC > NC_000913/3091055‑3091103 CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGC > 1:4283510/1‑50 CAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 2:2532333/1‑50 CAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 2:4773904/1‑50 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCT < 1:2080268/50‑1 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCT < 1:2202146/50‑1 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 1:4645545/1‑49 AAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCC > 2:3297919/1‑49 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 2:2921514/1‑50 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 1:3989032/1‑50 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 2:437075/1‑50 AAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTA > 2:4209491/1‑50 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTAC < 2:5017508/50‑1 AACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTAC < 2:4557157/50‑1 CAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC < 2:754/50‑1 CAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC < 2:2051663/50‑1 CAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC < 2:3420046/50‑1 AGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACT < 1:3174797/50‑1 AGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACT < 2:1673133/50‑1 AGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACT < 2:3297132/50‑1 AGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC > 2:211176/1‑49 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTA < 2:2744425/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTA < 2:520607/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTA < 1:2092440/50‑1 GCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACAC > 2:3174621/1‑48 CTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAG < 1:510990/50‑1 TTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC > 2:3962044/1‑50 TCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCG < 1:1351339/49‑1 TCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC < 2:2332032/48‑1 TCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGC < 1:3478765/48‑1 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA > 1:3035671/1‑50 GCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGA < 1:3804994/50‑1 CTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGAT > 2:3152659/1‑50 ACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTC > 1:348514/1‑50 ACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTC > 1:4788841/1‑50 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCT < 1:1150948/50‑1 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCT > 2:5082734/1‑50 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCT < 2:452261/50‑1 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCT < 2:1096144/50‑1 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCT < 1:2822067/50‑1 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTC < 1:3337250/49‑1 CGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATT < 1:90024/48‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT > 1:4917501/1‑50 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT < 1:3683300/50‑1 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT > 2:2238541/1‑50 GTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTT > 1:1675712/1‑50 TTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTT > 1:4790649/1‑50 TTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTT < 2:239797/50‑1 TGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT > 2:422620/1‑50 TGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT > 2:1408847/1‑50 TGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT > 2:594941/1‑50 GCTGGCTCGTTTTAACACGTAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT < 2:563251/49‑1 GCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTT > 2:484779/1‑50 GCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT < 2:4158347/49‑1 GCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTT < 2:3408124/49‑1 CTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTG < 1:1769069/50‑1 CTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTT < 1:3148783/49‑1 GGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT > 1:5013972/1‑49 GGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGT > 2:5182450/1‑49 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTA < 1:757920/50‑1 GCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTA < 2:814676/50‑1 CTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAA < 1:4873930/50‑1 CTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAA > 1:5092906/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC > 2:1506850/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCC > 2:1674215/1‑50 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAAC < 2:3832383/48‑1 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAAC < 1:1114429/48‑1 GTTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAAC < 1:3770749/48‑1 TTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC > 2:3723093/1‑50 TTTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTATTTTTGTTAACCCC > 2:2146624/1‑50 TTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC > 1:5189103/1‑49 TTTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCC > 1:4604788/1‑49 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTGACCCCT < 1:454416/49‑1 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTA > 1:219016/1‑50 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCT < 2:463318/49‑1 TTAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCT < 2:3082807/49‑1 TAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTAC > 2:1831860/1‑50 TAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTAC > 1:3871945/1‑50 TAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTA < 1:757265/49‑1 TAACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTA < 2:3648782/49‑1 ACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTGCCC < 2:395694/50‑1 ACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCC < 2:2288325/50‑1 ACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCC < 1:4887435/50‑1 ACACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCC < 2:3617555/50‑1 CACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCC < 1:4983152/50‑1 CACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCC < 2:1154727/50‑1 CACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCC > 2:3569445/1‑49 CACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCC > 2:2528272/1‑49 ACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCA < 2:1753220/50‑1 ACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCA > 2:3460901/1‑50 ACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCA < 2:3690400/50‑1 ACGGAG‑AAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCA < 2:4510506/50‑1 gAAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGT < 1:2407395/49‑1 gAAGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCG > 1:1530702/2‑49 AGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTAC < 2:2927085/50‑1 AGTGCCTACACTAGCGGGATTCTTTTTGTTAACCCCTACCCCACGCGTA > 2:5041271/1‑49 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |