| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3090346 | 12 (0.110) | 138 (1.260) | 65/98 | 0.0 | 92.6% | intergenic (+94/‑1) | yggI/endA | conserved protein YggI/DNA‑specific endonuclease I |
| ? | NC_000913 | 3091055 = | 10 (0.090) | intergenic (+1/‑79) | endA/rsmE | DNA‑specific endonuclease I/16S rRNA m(3)U1498 methyltransferase | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTGATGTACCGTTATTTGTCTATTGCTGCGGTGGTACTGAGCGCAGCATTTT > NC_000913/3090297‑3090395 | ccAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTg < 2:773385/49‑1 (MQ=255)ccAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGc < 2:3077647‑M1/50‑2 (MQ=255) cAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcc > 2:4773904‑M1/1‑48 (MQ=255) cAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcc > 2:2532333‑M1/1‑48 (MQ=255) aaaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcct < 1:2080268‑M1/50‑4 (MQ=255) aaaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcc > 1:4645545‑M1/1‑47 (MQ=255) aaaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcc > 1:2187256‑M1/1‑47 (MQ=255) aaaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcc > 2:3297919‑M1/1‑47 (MQ=255) aaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGccta > 2:4209491‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGccta > 1:3989032‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGccta < 1:4528198‑M1/50‑5 (MQ=255) aaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGccta > 2:2921514‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGccta > 2:437075‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGccta < 2:870315‑M1/50‑5 (MQ=255) aaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctac < 2:3717156‑M1/50‑6 (MQ=255) aaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctac < 2:4557157‑M1/50‑6 (MQ=255) aaCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctac < 2:5017508‑M1/50‑6 (MQ=255) aCAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctaca < 2:3618933‑M1/50‑7 (MQ=255) cAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTGATGTAc < 2:3993048/50‑1 (MQ=255) cAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac < 2:3420046‑M1/50‑8 (MQ=255) cAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac < 2:2051663‑M1/50‑8 (MQ=255) cAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac > 2:4368399‑M1/1‑43 (MQ=255) cAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac < 2:754‑M1/50‑8 (MQ=255) aGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacact < 1:3174797‑M1/50‑9 (MQ=255) aGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacact < 2:1673133‑M1/50‑9 (MQ=255) aGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac > 2:211176‑M1/1‑42 (MQ=255) aGCTTTCGCTACGTTGCTGGCACGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac > 2:4998834‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacacta < 2:520607‑M1/50‑10 (MQ=255) gCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacacta < 2:2744425‑M1/50‑10 (MQ=255) gCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacac > 2:3174621‑M1/1‑41 (MQ=255) cTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactag < 2:3215135‑M1/50‑11 (MQ=255) tttCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagc > 2:3962044‑M1/1‑39 (MQ=255) tCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagc < 1:139106‑M1/48‑12 (MQ=255) tCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagc < 1:3478765‑M1/48‑12 (MQ=255) tCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagc < 2:2332032‑M1/48‑12 (MQ=255) cGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgg > 1:2766821‑M1/1‑36 (MQ=255) gCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcggga < 1:3804994‑M1/50‑16 (MQ=255) gCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcggga > 1:3035671‑M1/1‑35 (MQ=255) gCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcggga > 2:1568638‑M1/1‑35 (MQ=255) cTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTGATGTACCGTTATTTg < 1:3673851/50‑1 (MQ=255) cTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggat > 2:3919909‑M1/1‑34 (MQ=255) aCGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattc > 1:4788841‑M1/1‑32 (MQ=255) cGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattct < 1:1150948‑M1/50‑20 (MQ=255) cGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattct > 2:5082734‑M1/1‑31 (MQ=255) cGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattct < 2:452261‑M1/50‑20 (MQ=255) cGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattc < 1:3337250‑M1/49‑19 (MQ=255) cGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggatt < 1:90024‑M1/48‑18 (MQ=255) gTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctt > 1:1675712‑M1/1‑30 (MQ=255) gTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctt > 2:2238541‑M1/1‑30 (MQ=255) gTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctt < 1:3683300‑M1/50‑21 (MQ=255) ttGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattcttt < 2:1828088‑M1/50‑22 (MQ=255) ttGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattcttt > 1:4702725‑M1/1‑29 (MQ=255) ttGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattcttt < 2:239797‑M1/50‑22 (MQ=255) ttGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattcttt > 1:4790649‑M1/1‑29 (MQ=255) tGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttt > 2:594941‑M1/1‑28 (MQ=255) tGCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttt > 2:1408847‑M1/1‑28 (MQ=255) gCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttt < 1:3963882‑M1/49‑23 (MQ=255) gCTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttt < 2:4158347‑M1/49‑23 (MQ=255) cTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttg < 1:1769069‑M1/50‑25 (MQ=255) cTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttg > 1:4939353‑M1/1‑26 (MQ=255) cTGGCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattcttttt < 1:3148783‑M1/49‑24 (MQ=255) gCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgtta < 1:757920‑M1/50‑28 (MQ=255) gCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgtta < 2:4528037‑M1/50‑28 (MQ=255) gCTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgtt > 2:5085542‑M1/1‑23 (MQ=255) cTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaa > 1:5092906‑M1/1‑22 (MQ=255) cTCGTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaa < 1:4873930‑M1/50‑29 (MQ=255) gTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaaccc > 2:1506850‑M1/1‑19 (MQ=255) gTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacc < 2:1006559‑M1/49‑31 (MQ=255) gTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaac < 2:3832383‑M1/48‑30 (MQ=255) gTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaac < 1:3770749‑M1/48‑30 (MQ=255) gTTTTAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaac < 1:1114429‑M1/48‑30 (MQ=255) ttttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccc > 2:2253946‑M1/1‑18 (MQ=255) ttttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattatttttgttaacccc > 2:2146624‑M1/1‑18 (MQ=255) tttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccc > 1:5189103‑M1/1‑17 (MQ=255) tttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccc > 1:3390080‑M1/1‑17 (MQ=255) ttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttgacccct < 1:454416‑M1/49‑34 (MQ=255) ttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaaccccta > 1:219016‑M1/1‑16 (MQ=255) ttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccct < 2:3082807‑M1/49‑34 (MQ=255) ttAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccct < 2:463318‑M1/49‑34 (MQ=255) tAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctac > 1:5106027‑M1/1‑15 (MQ=255) tAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaaccccta < 2:3648782‑M1/49‑35 (MQ=255) tAACACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaaccccta < 1:757265‑M1/49‑35 (MQ=255) aaCACGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctac < 1:1872211‑M1/49‑36 (MQ=255) acacGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccc < 1:4887435‑M1/50‑38 (MQ=255) cacGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctgcccc < 2:5246845‑M1/50‑39 (MQ=255) cacGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctacccc < 2:1154727‑M1/50‑39 (MQ=255) cacGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctacccc < 1:4983152‑M1/50‑39 (MQ=255) cacGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccc > 2:2528272‑M1/1‑12 (MQ=255) cacGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccc > 2:3569445‑M1/1‑12 (MQ=255) acGGAGTAAGTGATGTACCGTTATTTGTCTATTGCTGCGGTGGTACTGAg > 2:4597991/1‑50 (MQ=255) acGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctacccca > 2:3460901‑M1/1‑11 (MQ=255) acGGAG‑AAGTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctacccca < 2:1753220‑M1/50‑40 (MQ=255) gaagTGcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccccacgcgt < 1:2407395‑M1/49‑45 (MQ=255) tGcctacactagcgggattctttttgttaaccccttccccacgcgtacag < 2:1391955‑M1/50‑49 (MQ=255) tGcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccccacgcgtacaa < 2:3582848‑M1/50‑49 (MQ=255) tGcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccccacgcgtacaa > 2:636441‑M1/1‑2 (MQ=255) tGATGTACCGTTATTTGTCTATTGCTGCGGTGGTACTGAGCGCAGCAttt < 1:5139522/50‑1 (MQ=255) tGATGTACCGTTATTTGTCTATTGCTGCGGTGGTACTGAGCGCAGCAttt < 1:1383142/50‑1 (MQ=255) gcctacactagcgggattctttttgttaacccctacctcacgcgtacaac > 2:3364837‑M1/1‑1 (MQ=255) gcctacactagcgggattctttttgttaacccctaccccacgcgtacaac > 2:3722721‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCAAAACAGCTTTCGCTACGTTGCTGGCTCGTTTTAACACGGAGTAAGTGATGTACCGTTATTTGTCTATTGCTGCGGTGGTACTGAGCGCAGCATTTT > NC_000913/3090297‑3090395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |