| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 59 (0.810) +CGAGATGGACG |
36/76 | 0.1 | 56.9% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 624576 = | 116 (1.230) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC | |||||
AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 ||||||||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:3836157/1‑50AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:3341870/1‑50AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC < 1:2240525/50‑1 AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACG < 1:6311237/50‑1 AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACG < 1:2519601/50‑1 AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:2942976/1‑49 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT > 1:4074464/1‑50 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG > 1:3888779/1‑50 CAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG > 1:5409559/1‑49 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA > 1:1179848/1‑50 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA > 1:6195563/1‑50 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGG < 1:4998625/49‑1 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG > 1:3046681/1‑50 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT > 1:909208/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:558009/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:5223816/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:4875516/50‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCC < 1:92114/49‑1 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:5013191/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:7068279/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:1107892/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:1695681/1‑50 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:3701868/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:5298442/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:4356114/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:4589558/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:1413638/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2182972/50‑1 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG < 1:3370362/50‑1 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC < 1:4854132/50‑1 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:5666798/50‑3 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:6162612/50‑3 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:6797019/50‑1 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG < 1:6483234/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:5364623/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:6361173/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG > 1:5101695/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG < 1:4017976/50‑1 TGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1698122/1‑49 TGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:5237991/1‑49 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAG < 1:4010717/50‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAG < 1:2889995/50‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:5717464/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1284983/1‑47 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:5553491/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:1604258/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:5287843/1‑48 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG > 1:5113739/1‑50 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG > 1:2904689/1‑50 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG < 1:2762113/50‑1 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG < 1:3579984/50‑1 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG > 1:2772394/1‑50 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG < 1:3311661/50‑1 GCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT < 1:1335364/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:2051262/50‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTT < 1:2251427/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:4567108/1‑48 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:5648351/1‑48 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:3263070/1‑48 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:6189885/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:1126689/50‑1 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:5095636/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:4310355/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:4097267/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGc > 1:4455817/1‑48 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTG < 1:5159159/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:3690573/1‑49 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:6142244/1‑48 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:4007258/1‑48 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG > 1:4955197/1‑50 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG < 1:4408943/49‑1 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > 1:681178/1‑50 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > 1:740585/1‑50 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG < 1:6205859/49‑1 ||||||||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |