| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 59 (0.810) +CGAGATGGACG |
36/76 | 0.1 | 56.9% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 624576 = | 116 (1.230) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC | |||||
AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCG > NC_000913/380063‑380159 | aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:3836157‑M1/1‑49 (MQ=255)aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:2240525‑M1/50‑2 (MQ=255)aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:3341870‑M1/1‑49 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 1:2519601‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 1:6311237‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:2942976‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat > 1:4074464‑M1/1‑44 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:3888779‑M1/1‑43 (MQ=255) cAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:5409559‑M1/1‑42 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 1:6195563‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 1:1179848‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgg < 1:4998625‑M1/49‑9 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg > 1:3046681‑M1/1‑38 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt > 1:909208‑M1/1‑37 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:558009‑M1/1‑35 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:5223816‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 1:4875516‑M1/50‑18 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc < 1:92114‑M1/49‑17 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:5013191‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:1107892‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:1695681‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:7068279‑M1/1‑32 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:4589558‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:5298442‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:4356114‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:3701868‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2182972‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:1413638‑M1/50‑20 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 1:3370362‑M1/50‑21 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc < 1:4854132‑M1/50‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:6162612‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:5666798‑M1/50‑27 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:6797019‑M1/50‑28 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg < 1:6483234‑M1/50‑29 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:6361173‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg > 1:5101695‑M1/1‑21 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:5364623‑M1/50‑30 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 1:4017976‑M1/50‑31 (MQ=255) tGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1698122‑M1/1‑19 (MQ=255) tGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:5237991‑M1/1‑19 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 1:2889995‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 1:4010717‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggg < 1:5717464‑M1/48‑32 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1284983‑M1/1‑17 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:5553491‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:5287843‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:1604258‑M1/1‑16 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag > 1:5113739‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg < 1:3579984‑M1/50‑37 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg < 1:2762113‑M1/50‑37 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg > 1:2904689‑M1/1‑14 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 1:2772394‑M1/1‑13 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg < 1:3311661‑M1/50‑38 (MQ=255) gCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt < 1:1335364‑M1/49‑39 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:2051262‑M1/50‑41 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtt < 1:2251427‑M1/49‑40 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:4567108‑M1/1‑10 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:3263070‑M1/1‑10 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:5648351‑M1/1‑10 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:6189885‑M1/50‑42 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:1126689‑M1/50‑42 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg < 1:5095636‑M1/50‑43 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:4310355‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:4097267‑M1/50‑45 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtg < 1:5159159‑M1/50‑46 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:3690573‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggc > 1:4455817‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:6142244‑M1/1‑4 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:4007258‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag > 1:4955197‑M1/1‑3 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 1:4408943‑M1/49‑49 (MQ=255) | AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCG > NC_000913/380063‑380159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |