| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 175 [0] | [0] 175 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 172 (1.180) | 80/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4196645/1‑50ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 1:4250539/50‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 1:4252614/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 2:3792993/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 2:534037/1‑49 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 2:1389517/50‑1 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:3440190/50‑1 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG > 1:3499756/1‑50 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 2:5310570/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:1884286/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:1704862/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:5467163/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 2:2879658/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:381485/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 1:5643804/49‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 2:3070747/49‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 2:3161512/49‑1 CACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGT > 2:2276035/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:5122863/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 1:5697943/1‑50 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 2:1249817/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:767914/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 2:2104797/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 2:574603/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:3581853/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTGCAGGGTCTCCTT < 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ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG < 2:3952836/50‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG < 2:1106226/50‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 2:1255104/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC < 1:4549021/48‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 1:1488901/1‑50 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 2:1581729/1‑50 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT < 2:3700537/50‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA < 2:4524797/50‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 2:4535611/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 2:3952068/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:889611/48‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 2:2735529/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 2:89648/50‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 1:703641/50‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:2070107/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 1:2525827/50‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:5504377/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:5392815/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 2:1641815/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 2:5525806/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 2:1928220/1‑48 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4610322/1‑48 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 2:1405597/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:5112888/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG < 1:1041287/49‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:2436178/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 2:1160765/1‑50 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 2:3742289/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:2211131/50‑1 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< 1:4701333/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:3000680/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:4509754/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1121116/1‑49 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:3553053/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 2:3651446/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 2:2601126/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 2:1691578/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 2:3988862/50‑1 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:4061876/1‑47 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 2:4463263/1‑50 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:3646450/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:391250/1‑50 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:2008281/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:2924306/48‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |