| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1994264 = | 33 (1.080) | 64 (3.000) +ATTTCTAATGTCGT |
4/68 | 1.8 | 68.7% | coding (443/1833 nt) | uvrC | excision nuclease subunit C |
| ? | NC_000913 | 3208976 = | 50 (1.640) | coding (953/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate:succinate antiporter | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAA > NC_000913/3208929‑3209024 | cggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGc < 1:187853/48‑1 (MQ=255)cggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGc < 1:1464062/48‑1 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCAc < 1:185553/49‑1 (MQ=255) cggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTg < 1:337344/49‑1 (MQ=255) tGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtg < 1:1819868/49‑1 (MQ=255) gATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgc > 1:2314072/1‑49 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 1:502429/49‑1 (MQ=255) ttATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgctg < 1:91526/49‑1 (MQ=255) tatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATgctgct < 1:933606/48‑1 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:1029441‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:951379‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:1993579‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:1364133‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:2362781‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACGGATGCTGCtt > 1:1858139‑M2/36‑49 (MQ=255) ttggcgctactgcgaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:267933‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:250498‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:75161‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:1260718‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:2181231‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:71368‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:1701385‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc > 1:225822‑M2/35‑49 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc > 1:1056712‑M2/35‑49 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1562507‑M2/15‑1 (MQ=255) atCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTc > 1:1213290/1‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:1652625‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:935877‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:1237774‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:626406‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:387038‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:240716‑M2/34‑49 (MQ=255) tCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCt < 1:576269/49‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1983891‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:2258096‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:381866‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1342026‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1119443‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:339789‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:351697‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:434245‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:1878268‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:712157‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:113201‑M2/33‑49 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:1304710‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:1053274‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:2186162‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:2125508‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:167415‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:3284‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:624783‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:712760‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1055243‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1372792‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1436362‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1287122‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1924609‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:805567‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtAACTGATGCTGCTTCTg < 1:580508‑M2/17‑1 (MQ=255) gATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTgc < 1:825260/49‑1 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:449085‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2245025‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:411717‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:1519891‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:597620‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:1374780‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2205848‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:197349‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:1246399‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:811487‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:69833‑M2/31‑47 (MQ=255) ccGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAt > 1:2094537/1‑49 (MQ=255) cgcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAtt < 1:750777/49‑1 (MQ=255) cgcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAtt < 1:2044217/49‑1 (MQ=255) cgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt < 1:2143232/49‑1 (MQ=255) cgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt < 1:174118/49‑1 (MQ=255) cgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt < 1:2053597/49‑1 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:787721/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:1525599/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:174140/1‑48 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGtt < 1:571693/49‑1 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGtt > 1:214520/1‑49 (MQ=255) gTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGga < 1:306292/49‑1 (MQ=255) gTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGga < 1:804553/49‑1 (MQ=255) ttACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 1:2198082/1‑49 (MQ=255) ttACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac < 1:15802/49‑1 (MQ=255) aCAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 1:1615269/1‑49 (MQ=255) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 1:2226646/1‑48 (MQ=255) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 1:876531/1‑48 (MQ=255) aGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACa > 1:1754082/1‑49 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAt < 1:2121556/49‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt < 1:1004234/49‑1 (MQ=255) gtggtgGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTg > 1:990376/1‑49 (MQ=255) ggtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt > 1:342482/1‑48 (MQ=255) gtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTc < 1:2214907/48‑1 (MQ=255) gtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTc < 1:883623/48‑1 (MQ=255) tggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg < 1:1621415/49‑1 (MQ=255) ggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg > 1:276034/1‑48 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaa < 1:305809/49‑1 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaa > 1:1923691/1‑49 (MQ=255) | CGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAA > NC_000913/3208929‑3209024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |