| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 92,854 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 92844 | 92846 | 3 | 26 [0] | [0] 24 | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 92847 = | 0 (0.000) | 18 (0.620) | 16/76 | 0.3 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| ? | NC_000913 | = 92843 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI | |||||
GGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92903‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG < NC_000913/92843‑92798 GGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACG > 1:1692240/1‑49 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGC < 1:1073181/49‑1 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGC > 1:505315/1‑49 TACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGAAGACTTCCCGCC < 1:566887/49‑1 CCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGC < 1:1354645/49‑1 GGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCG > 1:518027/1‑49 GTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGC < 1:826528/49‑1 GTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGC > 1:592526/1‑49 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC < 1:1171445/49‑1 TTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT > 1:2111649/1‑49 TTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT > 1:2622092/1‑49 TAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGG > 1:2738334/1‑49 TGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAG > 1:2848443/1‑49 GCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCG < 1:1005464/49‑1 GCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGC < 1:1518113/48‑1 CGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGC < 1:1692800/49‑1 ATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCA > 1:2323216/1‑49 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCT > 1:2784301/1‑49 AGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTC > 1:1016227/1‑49 CTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCAT > 1:2251084/1‑49 TAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA < 1:1969018/48‑1 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCAT < 1:2017045/48‑1 TCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATG < 1:312425/49‑1 tCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCA > 1:477556/2‑49 TTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAG > 1:224564/1‑49 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG > 1:1751235/1‑49 ACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGC > 1:1015323/1‑49 CCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGA < 1:694071/49‑1 CGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAC < 1:73368/49‑1 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAC > 1:2280251/1‑48 CGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAAT < 1:1719647/49‑1 GCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG < 1:772836/49‑1 GGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92903‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG < NC_000913/92843‑92798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |