New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1994264 = | 23 (0.850) | 30 (1.570) +ATTTCTAATGTCGT |
3/68 | 2.0 | 66.5% | coding (443/1833 nt) | uvrC | excision nuclease subunit C |
? | NC_000913 | 3208976 = | 20 (0.740) | coding (953/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate:succinate antiporter |
CGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAG > NC_000913/3208929‑3209021 | cggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGc < 1:1634529/48‑1 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCAc > 1:501111/1‑49 (MQ=255) cggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACt > 1:515093/1‑48 (MQ=255) ggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGa > 1:1923252/1‑49 (MQ=255) ggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGa > 1:1749591/1‑49 (MQ=255) gTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAt < 1:1689859/49‑1 (MQ=255) tGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtg < 1:152440/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct > 1:776144/1‑49 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:1610565‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1066363‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc > 1:123264‑M2/35‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:1784950‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:1755937‑M2/34‑49 (MQ=255) tCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCt < 1:1028688/49‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1290337‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1950674‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1705780‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1245778‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:493229‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1122647‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1624327‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1327171‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:793204‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:798613‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:850219‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:140570‑M2/16‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg < 1:999268‑M2/18‑2 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg < 1:1079688‑M2/18‑2 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1946469‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1512487‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:643049‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:168767‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1158369‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1725962‑M2/17‑1 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:1371017‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:839874‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:1474400‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:37605‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:2022243‑M2/31‑47 (MQ=255) gcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTa > 1:130929/1‑49 (MQ=255) ggTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGt > 1:348081/1‑49 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGtt < 1:1471817/49‑1 (MQ=255) gTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGga > 1:1647965/1‑49 (MQ=255) gTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGga < 1:379171/49‑1 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 1:1569277/1‑48 (MQ=255) aCAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacg < 1:1949862/48‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt > 1:337427/1‑49 (MQ=255) tggtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt < 1:2026794/49‑1 (MQ=255) gtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCa < 1:383957/49‑1 (MQ=255) tggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg < 1:767559/49‑1 (MQ=255) | CGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAG > NC_000913/3208929‑3209021 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |