| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 79 (0.940) +CGAGATGGACG |
44/76 | 0.0 | 63.3% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 624576 = | 119 (1.090) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC | |||||
AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 ||||||||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:1276103/1‑50AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:7050997/1‑50 AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:2886011/1‑49 GGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:2387213/1‑48 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:6344415/1‑47 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:6245743/50‑1 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG < 1:6728439/50‑1 CAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG > 1:705758/1‑49 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA > 1:1350238/1‑50 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA > 1:6921822/1‑50 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGG < 1:2443169/49‑1 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGG < 1:1517147/49‑1 GAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAC < 1:2766636/50‑1 GAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAC > 1:3143653/1‑50 GAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAC > 1:8081936/1‑50 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG < 1:4674057/50‑1 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG < 1:5333337/50‑1 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG > 1:4712762/1‑50 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG < 1:6259456/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT < 1:1961919/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT > 1:6663202/1‑50 TTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTC > 1:4209725/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:2412634/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:4025725/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:5838617/1‑50 CCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC < 1:593245/49‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:4039376/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:139287/50‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:3001109/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:5220056/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2922529/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:5533975/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:7813508/50‑1 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG < 1:2815777/50‑1 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG < 1:7874395/50‑1 TCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGC < 1:2696856/50‑1 TCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGC > 1:5865502/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:2576938/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:181927/1‑50 GACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCC > 1:8140555/1‑50 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc > 1:7470015/1‑49 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct > 1:7548549/1‑48 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:4676499/50‑3 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct > 1:3954026/1‑48 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:4218751/50‑3 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:4483974/1‑50 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:6498880/50‑1 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:4211483/50‑1 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG > 1:7070005/1‑50 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:7762271/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:7272501/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:6316209/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:6882195/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1842523/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:5133564/1‑50 TGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1671567/1‑49 GCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:2339037/1‑48 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAG < 1:7036500/50‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:7486070/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1978664/1‑47 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:6638572/50‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:6546381/50‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:6798483/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:3718930/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:1524811/1‑48 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:208342/50‑1 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG > 1:2090277/1‑50 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:4720543/50‑1 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:28285/50‑1 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG > 1:1172482/1‑50 TGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:3621347/1‑50 TGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:1762431/1‑50 TGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:7416155/1‑50 GCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT < 1:4941881/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:4903029/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG > 1:260452/1‑50 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:4164708/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG > 1:7122441/1‑50 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG > 1:7758056/1‑50 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:2978048/50‑1 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:21101/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:2971231/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:5870038/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:7996515/1‑50 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTG < 1:2151045/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:2975846/1‑49 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGA < 1:3117000/50‑1 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGA < 1:3637529/50‑1 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGA < 1:6477723/50‑1 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG < 1:2886212/50‑1 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG > 1:1292570/1‑50 TACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG > 1:1001293/1‑50 TACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG > 1:729556/1‑50 TACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG > 1:6790990/1‑50 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG < 1:3269114/49‑1 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > 1:2545851/1‑50 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG < 1:2681787/49‑1 ||||||||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |