New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 79 (0.940) +CGAGATGGACG |
44/76 | 0.0 | 63.3% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
? | NC_000913 | 624576 = | 119 (1.090) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC |
GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCG > NC_000913/380062‑380159 | gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:2265534/50‑1 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:1276103‑M1/1‑49 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:7050997‑M1/1‑49 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:2886011‑M1/1‑48 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:2387213‑M1/1‑47 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:6344415‑M1/1‑46 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:6245743‑M1/50‑7 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:6728439‑M1/50‑8 (MQ=255) cAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:705758‑M1/1‑42 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 1:6921822‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 1:1350238‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgg < 1:2443169‑M1/49‑9 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgg < 1:1517147‑M1/49‑9 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac > 1:3143653‑M1/1‑40 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac > 1:8081936‑M1/1‑40 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac < 1:2766636‑M1/50‑11 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg < 1:4674057‑M1/50‑12 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg < 1:5333337‑M1/50‑13 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg < 1:6259456‑M1/50‑13 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg > 1:4712762‑M1/1‑38 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt > 1:6663202‑M1/1‑37 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:1961919‑M1/50‑14 (MQ=255) ttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc > 1:4209725‑M1/1‑36 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:2412634‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:5838617‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:4025725‑M1/1‑35 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc < 1:593245‑M1/49‑16 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:4039376‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:3001109‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 1:5220056‑M1/50‑18 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 1:139287‑M1/50‑18 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2922529‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:5533975‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:7813508‑M1/50‑20 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 1:2815777‑M1/50‑21 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 1:7874395‑M1/50‑21 (MQ=255) tCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgc > 1:5865502‑M1/1‑29 (MQ=255) tCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgc < 1:2696856‑M1/50‑22 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:2576938‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:181927‑M1/1‑27 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc > 1:8140555‑M1/1‑26 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 1:7470015‑M1/1‑25 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:7548549‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:4676499‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:4218751‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:3954026‑M1/1‑24 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:4211483‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:6498880‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:4483974‑M1/1‑23 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg > 1:7070005‑M1/1‑22 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:7762271‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:7272501‑M1/50‑30 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1842523‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:5133564‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:6882195‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:6316209‑M1/1‑20 (MQ=255) tGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1671567‑M1/1‑19 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:2339037‑M1/1‑18 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 1:7036500‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggg < 1:7486070‑M1/48‑32 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1978664‑M1/1‑17 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 1:6546381‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 1:6638572‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:1524811‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:3718930‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:6798483‑M1/1‑16 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:28285‑M1/50‑36 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:4720543‑M1/50‑36 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:208342‑M1/50‑36 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag > 1:2090277‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg > 1:1172482‑M1/1‑14 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:1762431‑M1/1‑12 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:3621347‑M1/1‑12 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:7416155‑M1/1‑12 (MQ=255) gCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt < 1:4941881‑M1/49‑39 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:4903029‑M1/50‑41 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:4164708‑M1/50‑42 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag > 1:260452‑M1/1‑9 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag > 1:7122441‑M1/1‑9 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg > 1:7758056‑M1/1‑8 (MQ=255) aCCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttaggg < 1:2978048‑M1/50‑44 (MQ=255) aCCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttaggg < 1:21101‑M1/50‑44 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:2971231‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:5870038‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:7996515‑M1/1‑6 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtg < 1:2151045‑M1/50‑46 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:2975846‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtga < 1:6477723‑M1/50‑47 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtga < 1:3117000‑M1/50‑47 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtga < 1:3637529‑M1/50‑47 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag < 1:2886212‑M1/50‑48 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag > 1:1292570‑M1/1‑3 (MQ=255) tAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg > 1:729556‑M1/1‑2 (MQ=255) tAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg > 1:6790990‑M1/1‑2 (MQ=255) tAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg > 1:1001293‑M1/1‑2 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 1:3269114‑M1/49‑49 (MQ=255) | GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCG > NC_000913/380062‑380159 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |