| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,651,293 | Δ2,422 bp | [yhiS]–yhiS | [yhiS], insH‑11, yhiS | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3651293 | 3653714 | 2422 | 225 [0] | [0] 224 | [yhiS]–yhiS | [yhiS],insH‑11,yhiS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3651292 | 0 (0.000) | 208 (2.010) | 85/94 | 0.0 | 100% | pseudogene (2/746 nt) | yhiS | putative uncharacterized protein YhiS |
| ? | NC_000913 | 3653715 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑246) | yhiS/slp | putative uncharacterized protein YhiS/starvation lipoprotein | |||||
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
GGTAAAAGAATTCGCTTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTAC > NC_000913/3653666‑3653764 | ccaatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttata > 1:5248231‑M2/50‑50 (MQ=255) caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat > 1:1533350‑M2/49‑50 (MQ=255) caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat < 1:6655895‑M2/2‑1 (MQ=255) caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat < 1:2519055‑M2/2‑1 (MQ=255) caatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttata < 1:1883351‑M2/1‑1 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:4954490‑M2/3‑1 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:3383043‑M2/3‑1 (MQ=255) aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:2787871‑M2/3‑1 (MQ=255) atttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:880697‑M2/47‑49 (MQ=255) atttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTg < 1:1635695‑M2/4‑1 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa > 1:6217731‑M2/46‑50 (MQ=255) ttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:4104649‑M2/45‑50 (MQ=255) taaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:5528301‑M2/44‑49 (MQ=255) taaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat < 1:4462520‑M2/6‑1 (MQ=255) taaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:3880744‑M2/44‑49 (MQ=255) taaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat < 1:2055254‑M2/6‑1 (MQ=255) aaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta > 1:6610608‑M2/43‑50 (MQ=255) aaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatt < 1:8191409‑M2/7‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:6023080‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:6143690‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat > 1:7252422‑M2/42‑50 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:4612769‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:6735775‑M2/9‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:7823480‑M2/8‑1 (MQ=255) catcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat > 1:3972087‑M2/40‑48 (MQ=255) catcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta < 1:7350135‑M2/11‑1 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:2226752‑M2/39‑50 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:2837913‑M2/39‑50 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:6472880‑M2/39‑50 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:2963870‑M2/39‑50 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:8289820‑M2/39‑50 (MQ=255) ttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCAc > 1:5720938‑M2/36‑50 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGc < 1:3320507‑M2/13‑1 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCa < 1:4057987‑M2/14‑1 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt < 1:1464642‑M2/16‑1 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACtt > 1:4442957‑M2/33‑49 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACtt < 1:7669373‑M2/17‑1 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:7188867‑M2/19‑1 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta > 1:3787126‑M2/32‑50 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta > 1:5314028‑M2/32‑50 (MQ=255) ataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat < 1:3844712‑M2/20‑1 (MQ=255) ataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta > 1:2689649‑M2/31‑49 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtata < 1:822947‑M2/21‑1 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:418979‑M2/30‑49 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:6972093‑M2/30‑49 (MQ=255) aaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:6782700‑M2/29‑50 (MQ=255) aaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:8160075‑M2/29‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:6362125‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:3059560‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:774744‑M2/23‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:5484187‑M2/27‑49 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:1003086‑M2/27‑49 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:6712934‑M2/26‑1 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:4168567‑M2/26‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:5618630‑M2/24‑50 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:1025831‑M2/24‑50 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:1910202‑M2/24‑50 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:7329820‑M2/27‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:7108628‑M2/24‑50 (MQ=255) atgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTg > 1:7384081‑M2/22‑49 (MQ=255) tgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa < 1:5769538‑M2/30‑1 (MQ=255) tgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa < 1:7672912‑M2/30‑1 (MQ=255) gatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa > 1:8202087‑M2/20‑49 (MQ=255) gatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa > 1:2460949‑M2/20‑49 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATtgagt > 1:4803705‑M2/19‑47 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:3130502‑M2/31‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:5868345‑M2/31‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa < 1:6239628‑M2/32‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa < 1:7160613‑M2/33‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:1829652‑M2/18‑49 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:626291‑M2/18‑49 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:7451748‑M2/18‑49 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:6209215‑M2/18‑49 (MQ=255) gaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa > 1:3284537‑M2/17‑49 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaa < 1:1086772‑M2/35‑1 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaa < 1:7635752‑M2/34‑1 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:8072741‑M2/15‑50 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAAt < 1:8311988‑M2/37‑1 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAAt < 1:5647605‑M2/37‑1 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAAt < 1:6909665‑M2/37‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATa < 1:5971649‑M2/38‑1 (MQ=255) ggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:2746089‑M2/11‑46 (MQ=255) ggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGa < 1:4712541‑M2/40‑1 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAt > 1:2640837‑M2/10‑50 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAt < 1:5854270‑M2/41‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:5832684‑M2/8‑50 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:6388944‑M2/8‑50 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtttt < 1:3507733‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:7593504‑M2/7‑49 (MQ=255) tttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTa > 1:5088294‑M2/6‑50 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTAt > 1:4180984‑M2/5‑50 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTAt > 1:5239088‑M2/5‑50 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTAt > 1:6856816‑M2/5‑50 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg < 1:3545804‑M2/47‑1 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:1449570‑M2/3‑49 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:1315491‑M2/3‑49 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:4921580‑M2/3‑49 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:2996815‑M2/3‑49 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGt < 1:1220645‑M2/48‑1 (MQ=255) atTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTAc > 1:6122781/1‑50 (MQ=255) | GGTAAAAGAATTCGCTTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTAC > NC_000913/3653666‑3653764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |