| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 77 (0.880) +CGAGAT |
43/86 | 0.1 | 68.2% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 4070444 = | 82 (0.820) | intergenic (‑43/+71) | yihR/yihS | putative aldose 1‑epimerase YihR/sulfoquinovose isomerase | |||||
AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGA > NC_000913/4070444‑4070481 |||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC < 1:3173631/50‑1AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC < 1:3448236/50‑1AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC < 1:4850396/50‑1 AGGAATCAGAATTTCCAAGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACG < 1:765506/50‑1 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:1287263/1‑47 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:3483364/1‑47 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:527055/1‑47 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:5249320/1‑47 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:466146/1‑47 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT > 1:4436068/1‑50 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG > 1:110900/1‑50 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG < 1:3593278/50‑1 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG < 1:1914568/50‑1 CAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG > 1:4687211/1‑49 CAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG > 1:4551013/1‑49 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA > 1:1223570/1‑50 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA < 1:102759/50‑1 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGG < 1:2895905/49‑1 GAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAC < 1:5532915/50‑1 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG < 1:5392359/50‑1 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG > 1:3625403/1‑50 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG > 1:3460033/1‑50 TTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTC > 1:5056188/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:3484648/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:1370044/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCC < 1:4265051/49‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCC < 1:6548553/49‑1 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT < 1:4194430/50‑1 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:3760976/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:1650427/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT < 1:1386923/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2447382/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC > 1:4746913/1‑50 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2369438/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:3833507/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2652081/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC > 1:1283626/1‑50 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG > 1:6230339/1‑50 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG > 1:6739057/1‑50 TCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGC < 1:3777318/50‑1 CAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCC > 1:323764/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:5455839/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:6805056/1‑50 GACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCC < 1:2090875/50‑1 GACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCC > 1:5125137/1‑50 GACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCC > 1:6211783/1‑50 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc > 1:7614189/1‑49 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc < 1:5876606/50‑2 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:5464921/50‑3 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:6225129/50‑1 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:3190413/1‑50 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:6093376/1‑50 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:2525718/50‑1 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG > 1:2006672/1‑50 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG < 1:5545203/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:6833553/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:7612336/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:2917853/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG < 1:1519757/50‑1 TGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:762487/1‑49 GCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1901685/1‑48 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAG < 1:895880/50‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA < 1:3086181/49‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:1726666/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:1550497/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:1608641/1‑47 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:7385983/1‑47 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:907247/50‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:1016092/50‑1 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:6257323/50‑1 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:2640378/50‑1 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:7078101/50‑1 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG > 1:4914017/1‑50 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG > 1:6901779/1‑50 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG > 1:5169010/1‑50 GCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT < 1:6171412/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:2784418/50‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:7472615/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:5806560/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:3741230/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:2072075/50‑1 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:5586832/50‑1 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG > 1:7499150/1‑50 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:5415156/50‑1 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG > 1:3061571/1‑50 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:1408363/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGt < 1:3220682/50‑2 |||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGA > NC_000913/4070444‑4070481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |