New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 77 (0.880) +CGAGAT |
43/86 | 0.1 | 68.2% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
? | NC_000913 | 4070444 = | 82 (0.820) | intergenic (‑43/+71) | yihR/yihS | putative aldose 1‑epimerase YihR/sulfoquinovose isomerase |
GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAG > NC_000913/380062‑380155 | gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:3335208/1‑50 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:6163244/1‑50 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:359846/50‑1 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:4850396‑M1/50‑2 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:3448236‑M1/50‑2 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:3173631‑M1/50‑2 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAAGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 1:765506‑M1/50‑3 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:466146‑M1/1‑46 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:5249320‑M1/1‑46 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:527055‑M1/1‑46 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:3483364‑M1/1‑46 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:1287263‑M1/1‑46 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat > 1:4436068‑M1/1‑44 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:3593278‑M1/50‑8 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:110900‑M1/1‑43 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:1914568‑M1/50‑8 (MQ=255) cAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:4551013‑M1/1‑42 (MQ=255) cAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:4687211‑M1/1‑42 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 1:1223570‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga < 1:102759‑M1/50‑10 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgg < 1:2895905‑M1/49‑9 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac < 1:5532915‑M1/50‑11 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 1:3625403‑M1/1‑39 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg < 1:5392359‑M1/50‑12 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 1:3460033‑M1/1‑39 (MQ=255) ttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc > 1:5056188‑M1/1‑36 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:3484648‑M1/1‑35 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:1370044‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc < 1:4265051‑M1/49‑17 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc < 1:6548553‑M1/49‑17 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:4194430‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:3760976‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:1386923‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:1650427‑M1/1‑32 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc > 1:4746913‑M1/1‑31 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc > 1:1283626‑M1/1‑31 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2652081‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2369438‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2447382‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:3833507‑M1/50‑20 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg > 1:6230339‑M1/1‑30 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg > 1:6739057‑M1/1‑30 (MQ=255) tCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgc < 1:3777318‑M1/50‑22 (MQ=255) cAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcc > 1:323764‑M1/1‑28 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:6805056‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:5455839‑M1/1‑27 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc > 1:6211783‑M1/1‑26 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc < 1:2090875‑M1/50‑25 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc > 1:5125137‑M1/1‑26 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 1:7614189‑M1/1‑25 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc < 1:5876606‑M1/50‑26 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:5464921‑M1/50‑27 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:2525718‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:6225129‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:6093376‑M1/1‑23 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:3190413‑M1/1‑23 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg > 1:2006672‑M1/1‑22 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg < 1:5545203‑M1/50‑29 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:7612336‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:6833553‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:2917853‑M1/50‑30 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 1:1519757‑M1/50‑31 (MQ=255) tGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:762487‑M1/1‑19 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1901685‑M1/1‑18 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 1:895880‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga < 1:3086181‑M1/49‑33 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggg < 1:1550497‑M1/48‑32 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggg < 1:1726666‑M1/48‑32 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1608641‑M1/1‑17 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:7385983‑M1/1‑17 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 1:907247‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 1:1016092‑M1/50‑35 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:2640378‑M1/50‑36 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:6257323‑M1/50‑36 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:7078101‑M1/50‑36 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg > 1:6901779‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg > 1:4914017‑M1/1‑14 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 1:5169010‑M1/1‑13 (MQ=255) gCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt < 1:6171412‑M1/49‑39 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:7472615‑M1/50‑41 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:2784418‑M1/50‑41 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:5586832‑M1/50‑42 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:2072075‑M1/50‑42 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:5806560‑M1/50‑42 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:3741230‑M1/50‑42 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg < 1:5415156‑M1/50‑43 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg > 1:7499150‑M1/1‑8 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg > 1:3061571‑M1/1‑8 (MQ=255) aCCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttaggg < 1:1408363‑M1/50‑44 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:3220682‑M1/50‑45 (MQ=255) | GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAG > NC_000913/380062‑380155 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |