| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 122 [0] | [0] 123 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 110 (1.170) | 60/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603416‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCG < 1:6940962/50‑1 CTGCTTAAATGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:6629821/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:5417309/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:3482962/49‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:5288292/1‑49 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:2303558/1‑49 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:4575714/49‑1 TGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT > 1:1280269/1‑49 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA > 1:233505/1‑50 CTTAAATGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTA < 1:1712339/48‑1 TTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC > 1:5438839/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:4775392/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:3166776/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:6323765/48‑1 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:6374096/48‑1 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:7401864/48‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:1600085/50‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:7029608/50‑1 ATGCGCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:3743777/50‑1 ATGCGCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:120390/50‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:5513109/50‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:3828890/50‑1 GCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:6532831/1‑50 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:4495257/1‑49 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:3668714/1‑50 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:2081299/50‑1 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:4307270/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC < 1:3791548/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:5755880/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:5177809/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:1037914/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:6319377/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:90615/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:1057825/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:2741965/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:268904/1‑50 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG > 1:7395275/1‑50 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG > 1:4404271/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:306748/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT < 1:418222/50‑1 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:4526910/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT > 1:3539588/1‑50 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG > 1:5072137/1‑50 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG < 1:6016594/50‑1 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG > 1:3375389/1‑50 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG > 1:3710637/1‑50 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:804440/1‑50 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:4800195/1‑50 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTC < 1:2070178/50‑1 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:237437/50‑1 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:382327/50‑1 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG > 1:5441942/1‑50 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG > 1:1757290/1‑50 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG > 1:4900305/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:6937609/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:2521416/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:3641931/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGCCAGGT > 1:5211859/1‑50 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTC < 1:6484510/50‑1 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTC < 1:511617/50‑1 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:1372448/1‑49 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCA < 1:4705350/50‑1 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:4303394/1‑48 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:2052639/1‑48 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:6076299/1‑50 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:1593495/1‑50 ATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:3915524/1‑49 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA < 1:3641798/50‑1 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA > 1:849242/1‑50 CATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT > 1:4186964/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT < 1:1008429/49‑1 TTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGG > 1:682866/1‑50 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTA < 1:3303120/49‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:2707928/1‑48 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG > 1:5049651/1‑50 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG > 1:6507198/1‑50 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG < 1:896796/50‑1 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG < 1:4543784/50‑1 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:4403537/1‑50 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:1434662/1‑50 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:3934386/1‑50 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGC < 1:4379486/50‑1 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:7349713/1‑49 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:6011152/1‑50 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT > 1:4968200/1‑50 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT < 1:5220569/50‑1 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC < 1:1740640/49‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:1089814/1‑50 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG < 1:2708235/50‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:2110076/1‑50 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:4876768/1‑50 GAGTAATCTCCGCATATCCGGTTGTCAGGCCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:5850597/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:3396454/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:1495089/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC < 1:3414876/50‑1 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:7200397/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:700451/1‑50 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > 1:3269541/1‑50 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |