| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 122 [0] | [0] 123 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 110 (1.170) | 60/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609304‑609401 | ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:2303558‑M2/49‑49 (MQ=255)ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt < 1:5417309‑M2/2‑1 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 1:1280269‑M2/48‑49 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:4236974‑M2/47‑50 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:233505‑M2/47‑50 (MQ=255) cttaaatgcccccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTa < 1:1712339‑M2/3‑1 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:4481990‑M2/46‑50 (MQ=255) ttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc > 1:5438839‑M2/45‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:3166776‑M2/43‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:4775392‑M2/43‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:7401864‑M2/6‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:6323765‑M2/6‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 1:1600085‑M2/9‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 1:7029608‑M2/9‑1 (MQ=255) atgcgcccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:120390‑M2/10‑1 (MQ=255) atgcgcccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:3743777‑M2/10‑1 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:6532831‑M2/39‑50 (MQ=255) cccccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCat < 1:515036‑M2/13‑1 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:60593‑M2/38‑49 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:4495257‑M2/38‑49 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:3668714‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:2952546‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:6392999‑M2/14‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:2081299‑M2/15‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:4307270‑M2/15‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc > 1:5755880‑M2/35‑50 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:3791548‑M2/16‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:5177809‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:6319377‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg < 1:90615‑M2/18‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg < 1:1037914‑M2/18‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg < 1:1057825‑M2/18‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:268904‑M2/33‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:7395275‑M2/32‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg < 1:2130310‑M2/19‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:306748‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:4526910‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:418222‑M2/20‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:3539588‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:4889772‑M2/30‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 1:3375389‑M2/29‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 1:5072137‑M2/29‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:804440‑M2/28‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:4800195‑M2/28‑50 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:2070178‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAGCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:3348707‑M2/24‑1 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:6790668‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:237437‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:382327‑M2/26‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:4900305‑M2/24‑50 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:1757290‑M2/24‑50 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:5441942‑M2/24‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:3641931‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:6937609‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2521416‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgccaggt > 1:5211859‑M2/23‑50 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 1:6484510‑M2/29‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:1372448‑M2/22‑49 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAAGCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 1:2399725‑M2/29‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtca < 1:4705350‑M2/30‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:4303394‑M2/21‑48 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2052639‑M2/21‑48 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:1593495‑M2/20‑50 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:6076299‑M2/20‑50 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:3493392‑M2/31‑1 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:3915524‑M2/19‑49 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa > 1:849242‑M2/18‑50 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:3641798‑M2/33‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 1:1008429‑M2/34‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg > 1:682866‑M2/15‑50 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt > 1:2707928‑M2/12‑48 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:5334697‑M2/38‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:4543784‑M2/40‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:896796‑M2/40‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg > 1:6507198‑M2/11‑50 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg > 1:5049651‑M2/11‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:3934386‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:4403537‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:1434662‑M2/10‑50 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:7349713‑M2/9‑49 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc < 1:4379486‑M2/42‑1 (MQ=255) tggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:6011152‑M2/7‑50 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc < 1:1740640‑M2/45‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt > 1:4968200‑M2/5‑50 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt < 1:5220569‑M2/46‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt > 1:3829558‑M2/5‑50 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg < 1:2708235‑M2/47‑1 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg > 1:1089814‑M2/4‑50 (MQ=255) gaGTAATCTCCGCATATCCGGTTGTCAGGCCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:5850597‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:700451‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:3396454‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc < 1:3414876‑M2/48‑1 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:7200397‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:1495089‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc < 1:5595499‑M2/48‑1 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:6000333‑M2/2‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:3269541‑M2/2‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:3739719‑M2/2‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGCCAGGACGGTAAGGCACCTGCt > 1:4618426‑M2/2‑50 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCtt > 1:2019795/1‑50 (MQ=255) | GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609304‑609401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |