| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 687,860 | Δ1,185 bp | IS5‑mediated | insH‑3 | insH‑3 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 687860 | 689044 | 1185 | 92 [0] | [0] 93 | insH‑3 | insH‑3 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 687859 | 0 (0.000) | 89 (0.930) | 64/96 | 0.0 | 100% | noncoding (1187/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 689045 = | 0 (0.000) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/687810‑687859‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATT > NC_000913/689045‑689093 TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC < 1:4828561/50‑1TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC < 1:2488808/50‑1 TATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC > 1:4902418/1‑50 TATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC > 1:4513050/1‑50 ATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC < 1:2891019/49‑1 TCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT < 1:5129727/49‑1 CGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT > 1:3479132/1‑48 CGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT > 1:335780/1‑48 GTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG < 1:690093/50‑1 GTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG > 1:729268/1‑50 GTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG < 1:1586173/50‑1 GTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG < 1:1593017/50‑1 TCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGG < 1:737006/50‑1 TGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGT > 1:7327645/1‑49 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAAC < 1:1919648/50‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAAC < 1:6899308/50‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:6774496/1‑49 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:4823251/49‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTA < 1:2556355/48‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTA < 1:5386040/48‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGT < 1:4799296/47‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGT < 1:6549903/47‑1 AACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAAaa < 1:5287077/50‑3 AACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA > 1:4196045/1‑50 ACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT < 1:6503933/50‑1 CTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT > 1:2956904/1‑50 CTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT < 1:4123523/50‑1 TTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT > 1:1767402/1‑49 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTA < 1:4209142/49‑1 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTA < 1:1971382/49‑1 ATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGT > 1:470768/1‑50 ATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAG < 1:4724384/49‑1 TTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTT < 1:2083226/50‑1 TTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGT < 1:1367768/49‑1 TTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGT < 1:6831827/49‑1 GTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG > 1:12947/1‑50 GTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG > 1:2295056/1‑50 GTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTT < 1:6446022/49‑1 TGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGG > 1:6264020/1‑50 TGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG < 1:7072474/49‑1 GCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC > 1:6968377/1‑50 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCT < 1:3292917/50‑1 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC < 1:5612326/49‑1 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC < 1:123442/49‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA < 1:2291327/50‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCT > 1:6372190/1‑49 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAA < 1:4173732/50‑1 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAA < 1:5216025/50‑1 GTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAAT > 1:5615929/1‑50 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:1192016/50‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAAT < 1:3758957/49‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAAT < 1:7197301/49‑1 TGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG > 1:4291974/1‑49 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT > 1:5304212/1‑49 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:1204885/49‑1 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:2492466/49‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA < 1:721893/50‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA < 1:3293207/50‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA < 1:909374/49‑1 GCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA > 1:277189/1‑48 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAG < 1:6862927/50‑1 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAG < 1:3994893/50‑1 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:981430/49‑1 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA > 1:2331139/1‑47 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA > 1:6835516/1‑47 TGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA > 1:1238759/1‑49 TTAGGGAAGGTGCCTTGGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATA < 1:5153084/49‑1 TTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATAT > 1:3247959/1‑50 TAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATT > 1:6758511/1‑50 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTG > 1:3500989/1‑50 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATT < 1:5232348/49‑1 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATT < 1:6601306/49‑1 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATT < 1:6666674/49‑1 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATT < 1:4047328/49‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGC < 1:1228290/50‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGC > 1:3023534/1‑50 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTG < 1:1879220/49‑1 GGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCT > 1:260360/1‑50 GGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCT < 1:667796/50‑1 GAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTG < 1:4660040/50‑1 GAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTG < 1:847291/50‑1 GAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTG < 1:6016785/50‑1 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGT > 1:2937969/1‑50 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGT < 1:4676181/50‑1 GGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTT < 1:4010557/50‑1 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTT < 1:3496203/50‑1 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTT > 1:446458/1‑49 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTT > 1:862467/1‑49 TGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTA < 1:3647145/50‑1 GCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT > 1:4476753/1‑50 GCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT > 1:70415/1‑50 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATT < 1:4043940/50‑1 TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/687810‑687859‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATT > NC_000913/689045‑689093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |