Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 729,365 | Δ9,598 bp | rhsC–ybfD | rhsC, ybfB, ybfO, ybfC, ybfQ, ybfL, ybfD |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 729365 | 738962 | 9598 | 109 [0] | [0] 106 | rhsC–ybfD | rhsC,ybfB,ybfO,ybfC,ybfQ,ybfL,ybfD |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 729364 | 0 (0.000) | 98 (1.050) | 62/94 | 0.0 | 100% | intergenic (+24/‑219) | ybfA/rhsC | DUF2517 domain‑containing protein YbfA/rhs element protein RhsC |
? | NC_000913 | 738963 = | 0 (0.000) | intergenic (+110/‑38) | ybfD/ybgA | H repeat‑associated putative transposase YbfD/DUF1722 domain‑containing protein YbgA |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACTTACTCCTGTAAACCGCTCAGGAGCAGTAATGAATCTACA > NC_000913/738914‑739011 | aaaggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaac > 1:4968103‑M2/50‑50 (MQ=255) aaaggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaac > 1:931287‑M2/50‑50 (MQ=255) aaggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCg > 1:7172572‑M2/49‑50 (MQ=255) aaggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCg > 1:684464‑M2/49‑50 (MQ=255) aggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGt > 1:2394183‑M2/48‑50 (MQ=255) ggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGTc < 1:7125577‑M2/4‑1 (MQ=255) ggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGTc > 1:7014014‑M2/47‑50 (MQ=255) ggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGTc < 1:4412581‑M2/4‑1 (MQ=255) ggcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGTc > 1:6334448‑M2/47‑50 (MQ=255) gcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGTc > 1:2203938‑M2/46‑49 (MQ=255) gcaactggtgatttttattgattgctgagttttgaatacattgaaCGTCt < 1:3357022‑M2/5‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |