| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TATCCAGATTGATTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATAT > NC_000913/1254584‑1254880 | tCCAGATTGATTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑Ct > 3:788588/1‑149 (MQ=255) ccAGATTGATTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTc < 1:1237702/149‑1 (MQ=255) attgattAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGa > 3:715242/1‑149 (MQ=255) ttgattAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAg < 4:715242/149‑1 (MQ=255) ttgattAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAg > 2:550377/1‑149 (MQ=255) aTTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTc < 1:237787‑M2/149‑2 (MQ=255) ccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCGacctcacgagcgatctg < 1:571337‑M1/149‑18 (MQ=255) ccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCGacctcacgagcgatctg < 1:1043740‑M1/149‑18 (MQ=255) ccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTc > 2:1398060/1‑135 (MQ=255) ccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGa < 3:1045260/139‑1 (MQ=255) ccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGa > 4:1045260/1‑139 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctgg > 3:1135699‑M2/1‑141 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctgg > 4:1436548‑M2/1‑141 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatc > 3:284676‑M2/1‑141 (MQ=255) tttGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatc > 2:1313946‑M2/1‑137 (MQ=255) gAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTg > 1:882330/1‑129 (MQ=255) gAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGt > 2:123059/1‑149 (MQ=255) gCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCAt > 2:606889/1‑149 (MQ=255) gTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCGacctcacgagcgatctggtc < 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ccAGATCGacctcacgagcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaac < 3:612748‑M1/71‑64 (MQ=255) ccAGATCGacctcacgagcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaac > 4:612748‑M1/1‑8 (MQ=255) ccAGATCGacctcacgagcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccaga > 2:1011775‑M1/1‑8 (MQ=255) cAGATCGacctcacgagcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggtagcgttctttccaaaggtgg < 1:1404625‑M1/149‑143 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggtagcgttctttccaaaggtgg < 4:12209‑M2/149‑133 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTga < 4:231070/107‑1 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTga > 3:231070/1‑107 (MQ=255) 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aTCGacctcacgagcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggta > 1:578914‑M1/1‑4 (MQ=255) aTCGacctcacgagcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggta < 2:578914‑M1/127‑124 (MQ=255) cG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAata < 2:866128/149‑1 (MQ=255) g‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGACATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAatat < 1:417028/149‑1 (MQ=255) | TATCCAGATTGATTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATAT > NC_000913/1254584‑1254880 |
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |