| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1254732 | 145 (1.050) | 12 (0.090) | 9/210 | NT | 8.0% | coding (1221/2868 nt) | ycgV | putative adhesin |
| ? | NC_000913 | = 1254742 | 142 (1.110) | coding (1211/2868 nt) | ycgV | putative adhesin | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
GATTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATATCGGTA > NC_000913/1254594‑1254885 | gattAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGt < 2:172178/149‑1 (MQ=255)gattAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGt < 2:1322545/149‑1 (MQ=255) cccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatct > 3:765323‑M2/1‑143 (MQ=255) ccACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctg < 1:1404625‑M2/149‑8 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctgg > 2:1404625‑M2/1‑141 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctgg > 4:1436548‑M2/1‑141 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatc > 3:284676‑M2/1‑141 (MQ=255) cACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatc < 4:284676‑M2/146‑6 (MQ=255) tttGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatc > 2:1313946‑M2/1‑137 (MQ=255) tttGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatc < 1:1313946‑M2/142‑6 (MQ=255) tGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCAGGCTGTTg < 1:550377/149‑1 (MQ=255) gAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGt > 2:123059/1‑149 (MQ=255) tACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGt < 4:1322625/123‑1 (MQ=255) tACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGt > 3:1322625/1‑123 (MQ=255) tACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgat > 1:578914‑M2/1‑123 (MQ=255) gTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTc > 2:210228/1‑149 (MQ=255) tAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTg < 2:1031463/149‑1 (MQ=255) aGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGc > 3:1268873/1‑149 (MQ=255) tACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCt > 1:809683/1‑142 (MQ=255) 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(MQ=255) ccAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAgc < 3:719484/125‑1 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggtagcgttctttccaaaggtgg < 4:12209‑M2/149‑133 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggtagcgttctttccaaaggtgg < 1:1043740‑M2/149‑133 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTga < 4:1150805/107‑1 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTga > 3:231070/1‑107 (MQ=255) cAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTga < 4:231070/107‑1 (MQ=255) gATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGcc < 3:349418/59‑1 (MQ=255) gATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGcc > 4:349418/1‑59 (MQ=255) gATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTga > 3:418680/1‑105 (MQ=255) aTCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTaa > 3:1173728/1‑149 (MQ=255) g‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAatat < 3:1137736/149‑1 (MQ=255) cTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATATc < 3:113504/149‑1 (MQ=255) tCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCca < 1:301964/106‑1 (MQ=255) tCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAata < 3:940595/146‑1 (MQ=255) tCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAata > 4:940595/1‑146 (MQ=255) tCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATATCg > 2:128295/1‑149 (MQ=255) tCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATATCg < 2:985216/149‑1 (MQ=255) tGAGGTcgatctggtcattgatatgagtacacccgaccagatggccatcgcaacgcaacatgacgatggttatgccgccagccgcatcaacgcctcgggtcgtatgcttatcaacggtagcgttctttccaaaggtgggctaatcaatc > 2:571337‑M2/1‑6 (MQ=255) tGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATATCGGTa < 4:615851/149‑1 (MQ=255) | GATTAGCCCACCTTTGGAAAGAACGCTACCGTTGATAAGCATACGACCCGAGGCGTTGATGCGGCTGGCGGCATAACCATCGTCATGTTGCGTTGCGATGGCCATCTGGTCGGGTGTACTCATATCAATGACCAGATCG‑‑CTCGTGAGGTCGATCTGGCTGTTGGTCATGGCATAAATTCCCCTGGCTCCTGCCGCGCCGGTGATAGCCAAACTGTCTCCGGTTATTCTACCGCCGCTGAGAGCCCACAAACCCAGCGCCAGACTGCCATTACGATCAACTGTAATATCGGTA > NC_000913/1254594‑1254885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |