| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 390,437 | +TTT :: IS3 (–) :: +TCA | pseudogene (187/1458 nt) | yaiT → | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 315229 = | NA (NA) | 154 (1.030) +TCA |
87/516 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1255 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 390438 = | 0 (0.000) | pseudogene (188/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 390437 | 0 (0.000) | 109 (0.720) | 70/522 | 0.9 | 100% | pseudogene (187/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| ? | NC_000913 | 1094242 = | NA (NA) | intergenic (+8/+33) | ycdT/insF1 | diguanylate cyclase, membrane‑anchored/IS3 transposase B | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CGTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/315505‑315229‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACACTGGCGTGATGGTG > NC_000913/390438‑390707 ||| GTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGAT > 2:380862/1‑277 GTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGATCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTAACCTCTGACTGAGAGTTTACTAACTTAGCCGCTTGTCCACTCTTGCTGGGTCAGATC > 2:216062/1‑278 TGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTAACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATC < 2:9155/277‑1 GCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGAT < 1:660970/275‑1 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ATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA < 1:102489/274‑1 aTCGGTAGACATCTCCCTTTTACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACCGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCGGTCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGGCTGAGGGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATTAGTT < 3:644993/274‑1 tgAGACATTTCCAGTTCACGTTCGGAAGACGCTGGTTGATTTTGCTGTTTGTTGGGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTG < 3:56181/272‑1 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TCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAA > 3:222471/1‑275 CCAGTTTACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTTAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAAC < 1:250329/275‑1 CCAGTTCACGTTCAGAAGAAGGCTGCTGATGTTGCTGGTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGGGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAAC < 3:730070/275‑1 aagTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGAGTTTGCTGTGTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAA < 3:389653/272‑1 CACGTTCAGAAGACGTCTTCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACC < 1:112654/275‑1 CACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTCGCCGCGTGTCCAATATTGCTGGGTACGATCAGTTTTTTCTATTACAAAAACACCAct > 2:593046/1‑276 CACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAAT > 4:555598/1‑278 CACGTTAAGAAGACGTGTGCTGAGTTTGCTGTTTACGGCGCCAGTTGTATAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACC < 3:356508/275‑1 ACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATG < 2:393638/278‑1 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TGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGC < 4:152832/265‑1 ATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACC > 3:516911/1‑275 TCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTA < 1:222471/275‑1 CAGGCCGAGGTCAAGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTG < 2:344959/277‑1 gggtAGTTGACGGGCTGAGGTAGTAACAACGAGGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGATTAACTGCGAAATTCAGGCTAATGCGGTTTACGGGGTTTTGTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAAC < 2:377697/273‑1 GCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGCTTTTGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGAACGATCTTAACTTATTATTTAAACC > 2:464799/1‑278 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CAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGAT < 1:61722/274‑1 GCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATG < 3:615669/275‑1 TACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTTATGGGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGACGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATTGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGG < 4:159694/277‑1 GGGGTTTTTTTCTGGTTGATACTGTTTTTGTAATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACGTATACGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCCATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGACCCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGG < 1:433058/274‑1 GGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCT < 1:582255/272‑1 GTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGG < 1:523482/274‑1 ttttgtCTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCAGCTCTGACTGAGAGTTTACTCAGTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTATATTACAACAACAACAATGGTGATTTCGATCAGTCCTATAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACGGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTA < 1:775383/269‑1 TTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTTATATCAGTAATTAAGTGATTCACGGTTCGATTATTTCTATGCTGCCTGTCGTTTTTTA > 4:485506/1‑278 TTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTT < 2:231598/277‑1 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TGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGAGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATT < 1:604252/158‑1 GTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGG > 1:126447/1‑275 GTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAATCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATA > 1:783749/1‑275 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NC_000913/315505‑315229‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGCACGATCTCAACCTATTATTTGAACCATGATTATGCAGACAGTACTGCTAATCAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACACTGGCGTGATGGTG > NC_000913/390438‑390707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |