| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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GTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCG > 6:303949/1‑109 GTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCG < 5:303949/109‑1 GTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAAACGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACACCGACAAAGCATTAGATGAAAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCATGGGGCCACGGCGAGATGCAAAGTGACTACTATCGACACGGCTTCGATGCGATGATAAATTTCGATTATCAGGAGCAGGCGGAGAAAGCAGTCGACgga > 2:3879/1‑272 GTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACAT < 8:509437/56‑1 GTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACAT > 7:509437/1‑56 TCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATGAC < 5:442314/148‑1 TCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCG < 5:130200/108‑1 TCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCG > 6:130200/1‑108 TCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGA > 5:120341/1‑90 TCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGA < 6:120341/90‑1 TCGCCGCCTGCTCCTGATAATCGAAATTGATCATCGCATCGAAGCCGTGGCGATAGTAGTCACTTTGCATCACGCCGTGGCCCCAGGCTTCACCGGTCATCCAGAAAGGTTTGTCATCTAATGCTTTGTCGGGGTTAGCTTTTTTCCATTCGCGAAGCGCGGCGCTGGCTTCGGTTTTCAGTTGCTGCCAGGCGGGCAACTCAACATGTTTGGCGGTATCGACCCGAAAACCATCAATCCCATAGTCGCGGACCCACTGACTTAACCAGTGGGTTAAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3739093‑3738815‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttaagtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATGACAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCCTGGGGCCACGGCGTGATGCAAAGTGACTACTATCGCCACGGCTTCGATGCGATGATCAATTTCGATTATCAGGAGCAGGCGGCGAAAGCAGTCGACTGT > NC_000913/3738835‑3739107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |