| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 504 total aligned reads displayed.
GGCATAGCTTTAACGATTACATTAATTTCAGCGACAAAACAGGCTGGGATAAATGGTGGGGAAAAAACTGGATCAGAACGGATATCGGCGATTACGACAATCCTGGATTCGACGATCTCACTATGTCGCTAGCCTTTTTGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATGGATACCCACGCCAAAGCCATTGACGGCTATACGCCGCGCGATTACTTAACCCACTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATGACAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCCTGGGGCCACGGCGTGATGCAAAGTGACTACTATCGCCACGGCTTCGATGCGATGATCAATTTCGATTATCAGGAGCAGGCGGCGAAAGCAGTCGACTGT > NC_000913/3738569‑3739107 | aTAGCTTTAAGCATTACATTAATTTCAGCGAAAAAACAGGCTGGGATAAATGGTGGGGAAAAAACTGGGTCAGAACGGTTATTGGCGATTACGACAATCCTGGATTCGACGATCTCACTATGTCGCTAGCCTTTTTGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATGGATACCCACGCCAAAGCCATTGACGGCTATACGCCGCGCGATTACTTAACCCACTGGTTAAGTCAGTGGGTCcgc < 4:43056/275‑1 (MQ=255) 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8:1028998‑M1/1‑114 (MQ=255) accagtgggttaagtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTcg < 7:361557‑M2/107‑1 (MQ=255) accagtgggttaagtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTcg > 8:361557‑M2/16‑122 (MQ=255) cACTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGaa < 6:972106/102‑1 (MQ=255) cACTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGaa > 5:972106/1‑102 (MQ=255) cACTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAg > 7:494413/1‑148 (MQ=255) cACTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAg > 5:389922/1‑148 (MQ=255) aCTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGa > 5:1018528/1‑100 (MQ=255) cTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGc > 8:495093/1‑102 (MQ=255) cTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGaa > 6:90526/1‑121 (MQ=255) cTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGaa < 5:90526/121‑1 (MQ=255) cTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGc > 6:36952/1‑147 (MQ=255) cTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCa > 7:1041977/1‑148 (MQ=255) cTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCa > 6:442314/1‑148 (MQ=255) ttaagtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAg < 8:55948‑M2/142‑1 (MQ=255) ttaagtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATGACAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCCTGGGGCCACGGCGTGATGCAAAGTGACTACTATCGCCACGGCTTCGATGCGATGATCAATTTCGATTATCAGGAGCAGGCGGCGAAAGCAGTCGa < 2:96496‑M2/269‑1 (MQ=255) taagtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATGACAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCCTGGGGCCACGGCGTGATGCAAAGTGACTACTATCGCCACGGCTTCGATGCGATGATCAATTTCGATTATCAGGAGCAGGCGGCGa < 2:278925‑M2/259‑1 (MQ=255) agtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCAtt > 7:429876‑M2/4‑143 (MQ=255) agtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCAtt < 8:429876‑M2/140‑1 (MQ=255) agtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATg > 8:922314‑M2/4‑148 (MQ=255) gtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTcg < 5:303949‑M2/107‑1 (MQ=255) gtCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACACAGCATTAGATGACAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCCTGGGGCCACGGCGTGATGCGAAGTGACTACTATCGCCACGGCTTCGATGCGATCATCCATTTCGATTATCAGGGGCAGGCGTCGAAAGCAGTCCACTGt > 2:445829‑M2/3‑275 (MQ=255) tCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGa > 5:120341‑M2/2‑90 (MQ=255) cAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGa < 8:255776/59‑1 (MQ=255) cAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGa > 7:255776/1‑59 (MQ=255) cAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGc < 7:814538/64‑1 (MQ=255) cAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGc > 8:814538/1‑64 (MQ=255) cAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGcc > 5:480565/1‑93 (MQ=255) | GGCATAGCTTTAACGATTACATTAATTTCAGCGACAAAACAGGCTGGGATAAATGGTGGGGAAAAAACTGGATCAGAACGGATATCGGCGATTACGACAATCCTGGATTCGACGATCTCACTATGTCGCTAGCCTTTTTGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATGGATACCCACGCCAAAGCCATTGACGGCTATACGCCGCGCGATTACTTAACCCACTGGTTAAGTCAGTGGGTCCGCGACTATGGGATTGATGGTTTTCGGGTCGATACCGCCAAACATGTTGAGTTGCCCGCCTGGCAGCAACTGAAAACCGAAGCCAGCGCCGCGCTTCGCGAATGGAAAAAAGCTAACCCCGACAAAGCATTAGATGACAAACCTTTCTGGATGACCGGTGAAGCCTGGGGCCACGGCGTGATGCAAAGTGACTACTATCGCCACGGCTTCGATGCGATGATCAATTTCGATTATCAGGAGCAGGCGGCGAAAGCAGTCGACTGT > NC_000913/3738569‑3739107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |