| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3226786 = | 127 (0.840) | coding (553/1434 nt) | ygjI | putative transporter | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TTACTGCCTATACCTACTGGTTCGTAAACCTGTTCTTTTTCACCTCACTGTTGCCGCGCGTTATTGCTTATGCTTCGTATGCCTTCCTCGGATACGAATATATTATGACGCCGGTTGCCACCACCATTATCAGTATGGTGCTGTTCGCCTTCTCCACCTGGGTTTCCACCAACGGGGCGAAAATGTTGGGGCCAATTACCTCCGTCACTTCAACGCTGATGCTGCTGTTAACGCTCTCCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGG > NC_000913/3226493‑3227038 | gccgccatgccgtggaatacctgcaccgatccgccggtaaatttcaactctttgctgctgacgaagacgttaatcagcaccgaggagacggaatacagtacgccgataaaaatcccggcgaggatgatcactttaacgaacgatttcgaaccgcctttgacgtcgttaacgtacacagcgacggactccgcgccacctgcggccataaagatccaggtggtaacgccgaggaacgcccagttgaagttgggggacatcgggtcaaggggtatGGc < 4:284586‑M1/3‑1 (MQ=255) 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ctctCCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAgg > 7:153612/1‑137 (MQ=255) tctcCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCctg < 6:11726/51‑1 (MQ=255) tctcCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCctg > 5:11726/1‑51 (MQ=255) ctcCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGtc > 4:502652/1‑244 (MQ=255) ctcCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAAATGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGACATCGGTCGGTAAAGTGAGCATCATCGACGGGATTTTTATTGGCATACTTTATTCCGTGCCCCTGTGGCCGATTAACGGCTTCGTcagca > 4:109674/1‑275 (MQ=255) ccTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCgatg > 3:137296/1‑74 (MQ=255) ccTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCagcagc > 2:244951/1‑275 (MQ=255) ccTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGGCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGCTCTTCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACTGCTTCGTcagccgg > 2:353609/1‑272 (MQ=255) tACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAg > 7:969482/1‑42 (MQ=255) cATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCtt > 7:275694/1‑117 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCaa < 8:22486/79‑1 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTgg > 2:143054/1‑127 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTTAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGCTAAAGTGATCATCCTCGCAGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCCGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCCAAGAGTTg > 2:543907/1‑275 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCaacacgttg > 2:110565/1‑268 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCACCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCTGCAGCAGCAAAGAGTTg > 2:262655/1‑275 (MQ=255) aCTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGgcgc < 8:951467/129‑1 (MQ=255) cTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGa > 2:313505/1‑274 (MQ=255) ggCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGcgcg < 4:143053/127‑1 (MQ=255) 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gTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGt > 2:58059/1‑275 (MQ=255) gTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGt > 2:448467/1‑275 (MQ=255) ttGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTa < 6:491775/93‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTa > 5:491775/1‑93 (MQ=255) gcggcgTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGc < 2:246819/273‑1 (MQ=255) cggcgTTCAGCGTGCTGACTCACTCACCGTTCACGCTCTGACCACGAACGTCAACTTGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCGTGAGCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCAGCCTCGCCGGGATTGTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAgg < 4:353608/275‑1 (MQ=255) cggcgTACAGTCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAg < 1:99509/274‑1 (MQ=255) cggccTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGGCGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGGTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCg > 5:321117/1‑148 (MQ=255) | TTACTGCCTATACCTACTGGTTCGTAAACCTGTTCTTTTTCACCTCACTGTTGCCGCGCGTTATTGCTTATGCTTCGTATGCCTTCCTCGGATACGAATATATTATGACGCCGGTTGCCACCACCATTATCAGTATGGTGCTGTTCGCCTTCTCCACCTGGGTTTCCACCAACGGGGCGAAAATGTTGGGGCCAATTACCTCCGTCACTTCAACGCTGATGCTGCTGTTAACGCTCTCCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGCTGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGG > NC_000913/3226493‑3227038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |