| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3226786 = | 127 (0.840) | coding (553/1434 nt) | ygjI | putative transporter | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CCTCACTGTTGCCGCGCGTTATTGCTTATGCTTCGTATGCCTTCCTCGGATACGAATATATTATGACGCCGGTTGCCACCACCATTATCAGTATGGTGCTGTTCGCCTTCTCCACCTGGGTTTCCACCAACGGGGCGAAAATGTTGGGGCCAATTACCTCCGTCACTTCAACGCTGATGCTGCTGTTAACGCTCTCCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGGTATTCCACGGCATGGCGGC > NC_000913/3226535‑3227057 | ccGCGCGTTATTGCTTATGCTTCGTATGCCTTCCTCGGATACGAATATATTATGACGCCGGTTGCCACCACCATTATCAGTATGGTGCTGTTTGCCTTCTCCACCTGGGTTTCCACCAACGGGGCGAAAATGTTGGGGCCAATTACCTCCGTCCCTTCAACGCTGATGCTGCTGTTAACGCTCTCCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTCGACGCGAAGATCCCGAACTTTAAcgg > 4:415844/1‑273 (MQ=255) 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ttttACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTa > 6:52698/1‑102 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTgg > 2:143054/1‑127 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTa < 5:898707/148‑1 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTa < 6:1018463/148‑1 (MQ=255) tACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCACCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCTGCAGCAGCAAAGAGTTg > 2:262655/1‑275 (MQ=255) cTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACGGTATTCCGTCTCCCCGGTGCTGCTTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGGGTTGaa > 4:342623/1‑275 (MQ=255) cAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCCTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAATTGCTCATCCTCGCGGGGATTTTTATCGGCGGACTGTATTCGGTCTCCACGGTTCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGTAAAGCGTTGAAAttt > 1:149284/1‑275 (MQ=255) ggTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGAt > 8:676451/1‑101 (MQ=255) aCGGCGCTGGTTGGCGGCGGACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTGCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACcgg < 2:442795/275‑1 (MQ=255) gcTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTaa > 6:459156/1‑138 (MQ=255) gTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGt > 2:58059/1‑275 (MQ=255) gTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGt > 2:448467/1‑275 (MQ=255) ttGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTa > 5:491775/1‑93 (MQ=255) ttGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTa < 6:491775/93‑1 (MQ=255) gcggcgTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGc < 2:246819/273‑1 (MQ=255) tggcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTacca > 8:184008‑M2/23‑77 (MQ=255) tggcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTacca < 7:184008‑M2/55‑1 (MQ=255) cggcgTTCAGCGTGCTGACTCACTCACCGTTCACGCTCTGACCACGAACGTCAACTTGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCGTGAGCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCAGCCTCGCCGGGATTGTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAgg < 4:353608/275‑1 (MQ=255) cggcgTACAGTCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAg < 1:99509/274‑1 (MQ=255) cggcgTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCAGCGGATCGGTGCAgg > 4:277624/1‑275 (MQ=255) cggccTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGGCGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGG‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCg > 5:321117/1‑148 (MQ=255) GGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAgg > 4:72707‑M1/1‑274 (MQ=255) gcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCg > 7:1051824‑M2/21‑69 (MQ=255) gcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCg < 8:1051824‑M2/49‑1 (MQ=255) gcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGt > 6:189488‑M2/21‑124 (MQ=255) gcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGt < 5:189488‑M2/104‑1 (MQ=255) gcgtcagcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGaa > 8:796756‑M2/21‑148 (MQ=255) GCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGaa > 6:339441‑M1/1‑148 (MQ=255) TACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGGTATTc < 2:244780‑M1/275‑1 (MQ=255) TACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGGTATTc < 2:335881‑M1/275‑1 (MQ=255) gcaggctgtacgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAAtcgtt < 7:796756‑M2/134‑1 (MQ=255) ccTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACg < 6:92482/115‑1 (MQ=255) tgctgACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATgg > 7:681856/1‑80 (MQ=255) tgctgACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATcgttcgtt > 8:685072/1‑148 (MQ=255) ctgACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTaa < 6:779236/148‑1 (MQ=255) cgccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGGTATTCCACGGCATggcg < 2:12320‑M2/270‑1 (MQ=255) ccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGgcgc < 7:652376‑M2/83‑1 (MQ=255) ccATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGgcgc > 8:652376‑M2/3‑85 (MQ=255) | CCTCACTGTTGCCGCGCGTTATTGCTTATGCTTCGTATGCCTTCCTCGGATACGAATATATTATGACGCCGGTTGCCACCACCATTATCAGTATGGTGCTGTTCGCCTTCTCCACCTGGGTTTCCACCAACGGGGCGAAAATGTTGGGGCCAATTACCTCCGTCACTTCAACGCTGATGCTGCTGTTAACGCTCTCCTACATTTTACTGGCAGGTACGGCGCTGGTTGGCGGCGTACAGCCTGCTGACGCCATCACCGTTGACGCGATGATCCCGAACTTCAACTGGGCGTTCCTCGGCGTTACCACCTGGATCTTTATGGCCGCAGGTGGCGCGGAGTCCGTCGC‑TGTGTACGTTAACGACGTCAAAGGCGGTTCGAAATCGTTCGTTAAAGTGATCATCCTCGCCGGGATTTTTATCGGCGTACTGTATTCCGTCTCCTCGGTGCTGATTAACGTCTTCGTCAGCAGCAAAGAGTTGAAATTTACCGGCGGATCGGTGCAGGTATTCCACGGCATGGCGGC > NC_000913/3226535‑3227057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |