| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2327300 = | 35 (0.370) | 10 (0.120) | 7/174 | NT | 28.0% | intergenic (+7/+67) | atoB/yfaP | acetyl‑CoA acetyltransferase/DUF2135 family protein, putative host defense protein |
| ? | NC_000913 | 2327334 = | 21 (0.260) | intergenic (+41/+33) | atoB/yfaP | acetyl‑CoA acetyltransferase/DUF2135 family protein, putative host defense protein | |||||
TCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGC > NC_000913/2327155‑2327412 | ccaactgacgctgatcaccgatgaaggatcggtcaatgagaaacaggaaacatttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagaaa > 3:811273‑M1/146‑148 (MQ=255) ccTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaaaa > 1:478614/1‑148 (MQ=255) actgacgctgatcaccgatgaaggatcggtcaatgagaaacaggaaacatttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAaca < 3:461120‑M1/6‑1 (MQ=255) cGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAacac > 2:754146/1‑130 (MQ=255) cGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAacac < 1:754146/130‑1 (MQ=255) tCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGTGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaa > 3:920972/1‑120 (MQ=255) tCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaa < 4:920972/120‑1 (MQ=255) tCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaaaa > 3:1039023/1‑117 (MQ=255) tCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaaaa < 4:1039023/117‑1 (MQ=255) cacaCTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAACTTTCGCTATCGGGTGttttta < 3:1131647/148‑3 (MQ=38) cTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTGATCAATaaa > 3:966269/1‑110 (MQ=255) cTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATGAATaaa < 4:966269/110‑1 (MQ=255) aTTACATGCTATGCAGGCATGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGa < 4:747407/123‑1 (MQ=255) aTTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGa > 3:747407/1‑123 (MQ=255) tACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAac < 4:667756/109‑1 (MQ=255) tACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAac > 3:667756/1‑109 (MQ=255) gaaacatttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCg > 3:812623‑M1/100‑125 (MQ=255) gaaacatttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCg < 4:812623‑M1/26‑1 (MQ=255) atgcAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCg > 1:629937/1‑106 (MQ=255) atgcAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCg < 2:629937/106‑1 (MQ=255) tttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAacac < 1:917219‑M1/7‑1 (MQ=255) tttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAacac > 2:917219‑M1/94‑100 (MQ=255) tAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTc > 2:1035648/1‑117 (MQ=255) tAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTc < 1:1035648/117‑1 (MQ=255) aaaaCGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGa < 1:64997/133‑1 (MQ=255) aaaaCGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGa > 2:64997/1‑133 (MQ=255) gggCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATATCGAAAGTTa < 4:738965/95‑1 (MQ=255) gggCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa > 3:738965/1‑95 (MQ=255) ggCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATc > 3:858729/1‑96 (MQ=255) ggCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATc < 4:858729/96‑1 (MQ=255) acacTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCaaaa > 4:163949/1‑143 (MQ=255) acacTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCaaaa < 3:163949/143‑1 (MQ=255) gacgcttgtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAaca < 2:609759‑M1/6‑1 (MQ=255) gacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAaca > 1:609759‑M1/62‑67 (MQ=255) acTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGaa < 4:529635/79‑1 (MQ=255) acTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGaa > 3:529635/1‑79 (MQ=255) tttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg > 1:347618‑M1/46‑73 (MQ=255) tttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg < 2:347618‑M1/28‑1 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa > 3:114988/1‑67 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa < 4:114988/67‑1 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAAc < 1:181034/103‑1 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAAc > 2:181034/1‑103 (MQ=255) gAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg > 1:317161/1‑66 (MQ=255) gAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg < 2:317161/66‑1 (MQ=255) aTTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACttt < 1:54876/120‑1 (MQ=255) aTTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACttt > 2:54876/1‑120 (MQ=255) atggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGaaa > 4:1071677‑M1/31‑49 (MQ=255) atggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGaaa < 1:151842‑M1/19‑1 (MQ=255) atggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGaaa > 2:151842‑M1/31‑49 (MQ=255) atggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGaaa < 3:1071677‑M1/19‑1 (MQ=255) gATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACtt > 3:796832/1‑108 (MQ=255) gATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACtt < 4:796832/108‑1 (MQ=255) ttGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACt < 3:460546/105‑1 (MQ=255) ttGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACt > 4:460546/1‑105 (MQ=255) taccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg > 4:426238‑M1/24‑51 (MQ=255) taccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg < 3:426238‑M1/28‑1 (MQ=255) gTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGc < 2:708946/129‑1 (MQ=255) gTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGc > 1:708946/1‑129 (MQ=255) ttGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGa > 2:156266/1‑67 (MQ=255) ttGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGa < 1:156266/67‑1 (MQ=255) cAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAg > 4:360827/1‑59 (MQ=255) cAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAg < 3:360827/59‑1 (MQ=255) aaaaaCACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAAt > 4:226788/1‑69 (MQ=255) aaaaaCACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAAt < 3:226788/69‑1 (MQ=255) AAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAg > 1:1118948‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAg > 1:777834‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAg < 2:1118948‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAg < 2:777834‑M1/91‑1 (MQ=255) | TCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGC > NC_000913/2327155‑2327412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |