| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3240618 | 177 (1.030) | 4 (0.020) | 4/506 | 14.5 | 2.2% | coding (675/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
| ? | NC_000913 | 3240623 = | 177 (1.040) | coding (680/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3240346‑3240618‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACG > NC_000913/3240623‑3240894 AGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGTTGGTTGGCTGTc > 3:370580/1‑273AGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGCCTACGCGCAACTGCTGGTCGCGCTGGTTGGCTGTTt > 3:513222/1‑274 CATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACTTCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGACTGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTGGCACCGATTGGTATTTTTGGGGTGGTTTCTTCTACCTTGGCCACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTCTTCGTGCGTGTTGGGTGTTttt > 3:195830/1‑272 TGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCAGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCATGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTAGGCTGgttgtta > 1:504529/1‑268 TGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGA > 1:275367/1‑275 CTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCC < 3:275366/275‑1 ctggttggtctttTGTTACTTGTGGCTCTGGTGGTTAACCCGTTGCTGGTGTTGTGGAAGAATCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGGGCCTGCGCCAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGC < 4:506951/265‑1 tgttcGTTAGTGGTGGCGCTGGTGGTGAACCCATTGCTGGTGTGGTGGCAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCGGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATAC < 2:247373/273‑1 TGTTACTGGTGTGGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACG < 1:703763/275‑1 TGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCG > 2:710311/1‑192 TGTTACTGGGGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGATGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATAC < 3:566704/274‑1 GTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAATTTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACG < 1:182644/274‑1 GTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGT < 4:710311/192‑1 AGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTACGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3240346‑3240618‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGTGAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACG > NC_000913/3240623‑3240894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |