| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3240618 | 177 (1.030) | 4 (0.020) | 4/506 | 14.5 | 2.2% | coding (675/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
| ? | NC_000913 | 3240623 = | 177 (1.040) | coding (680/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGT‑GAAAAGCTGAATC‑TGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACG > NC_000913/3240350‑3240894 | tGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTCTGTTa > 1:990/1‑275 (MQ=255) ggTTTCCAACCCCATCGACCCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCCTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCGGGTTTCTTCTACCCTGTCAACCAACGGGTTCTCCACTCTCTGGGGCGA‑CGCGCCACTGCGGTGCGAGCGGGTTGGCTGTATGtttccgg > 4:145508/1‑273 (MQ=255) ccAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACtggt < 1:56945/274‑1 (MQ=255) aaCCCCTGCGCCGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGCATCTGGGGTGGGCGATCGCCCTCCGCTCCGCACTGCGTGACGGTAAAGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGgcgc < 2:743003/277‑1 (MQ=255) tCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTACCGATATTTCGATGGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTGCCACCGATTGGTATTTTGGGCTTGGTTCCTCCTACCCTGCAAACCACCGTTTTC‑CCACCCCCGGGGGGTACCGCCCAACGGCGGGCCGTCCTGTTTGGTGTTATGTACTTGGTTGCGCtg > 3:128027/1‑272 (MQ=255) tCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCACCCACCGGTTTTTCAACACTGTGGGGCTA‑GGCGCAACTGCTGTTCGTGCGGGTGGGCTGTATGTTACtggtgggggtg > 3:507542/1‑267 (MQ=255) accggctgctGAAAGGTAACTACATCGGGTTTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGtt < 3:545423/271‑1 (MQ=255) gctgctGAAAAGTAACTTCATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGAACACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAcc < 1:128027/275‑1 (MQ=255) aaGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtg < 1:570736/275‑1 (MQ=255) tAACTACATCGGGATGCTGGTGTGAGCGTTCGGCGTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCAACGATTGGTATTTTTGGGTTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtg < 1:194755/274‑1 (MQ=255) aCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACGGGTGGCGCGGGTGGTTAACCACTGGCtggttggg > 3:437921/1‑271 (MQ=255) tCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCCCACCTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTCCTCGTGGCCGTGGGGGTTAACCCGTTGCGGTTGTGGTGGGATAtt > 4:676836/1‑278 (MQ=255) gggATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCAGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAt < 1:610329/275‑1 (MQ=255) ggATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAtt < 1:228359/275‑1 (MQ=255) cTGGTGTGGGCAGTCGCCCTCGTCTTCGCATTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATtcgtcg < 1:674324/275‑1 (MQ=255) gtgGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGt < 2:132377/278‑1 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCg > 1:584669/1‑274 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCCCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATGGCTGGTTTGGTGGAAAATTCGTCGTAAGCCg > 3:292942/1‑274 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGCAACGAGACCACCACAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATCGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTCTGGGGTTC‑CGCGTAACTGCTGGTCGTTCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGTGCTGGGGGTTTACCCCCTGCTGGTTTGGTGCAACACTcgtcgttccc > 3:126635/1‑268 (MQ=255) 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cGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTgcg > 3:583929/1‑275 (MQ=255) gTCACGAGAACAAGAACACCAAAAACCTATGTAACGATATGGCGAATGCCGTTACTTGTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTGGGGCTGGTTTCGTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTgcg < 3:178141/274‑1 (MQ=255) gTAACGAGACCCGCAAAAACCTGGTTAACGATATTGCGAATGCCGTTGCCTTTATGGTGACACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGc < 1:412785/275‑1 (MQ=255) 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acggtgccTTTATGGTGAAACTGGTCATTCCCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGCGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTGATCCACACTGTGGGGCGA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACAtt < 1:320865/269‑1 (MQ=255) cGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCT‑CTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGt < 2:643328/278‑1 (MQ=255) aCCTTTATTGTGGAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGt < 1:507543/275‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |