| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3240618 | 177 (1.030) | 4 (0.020) | 4/506 | 14.5 | 2.2% | coding (675/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
| ? | NC_000913 | 3240623 = | 177 (1.040) | coding (680/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
AGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGGTGTGTATGCCTTCTTCACCCGCAGCTCTGCAGCGAACATTCCGGTGAATATGGCGCTGTGT‑GAAAAGCTGAATCTGGATCGCGATACCTATTCCGTTTCTATTCCGCTGGGAGCCACCATCAATATGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATA > NC_000913/3240346‑3240892 | aGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGTTGGTTGGCTGtc > 3:370580/1‑273 (MQ=255)aGCATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGCCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGCGCTGGTTGGCTGttt > 3:513222/1‑273 (MQ=255) cATGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACTTCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGACTGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTGGCACCGATTGGTATTTTTGGGGTGGTTTCTTCTACCTTGGCCACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTCTTCGTGCGTGTTGGgtgttttt > 3:195830/1‑271 (MQ=255) tGGTTTCCAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CTCGCAACTGCTGGTCTTGCTTGTTGGCTTTATGTTCCtg > 2:790942/1‑278 (MQ=255) ccAACCCCATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACtggt < 1:56945/274‑1 (MQ=255) aaCCCCTGCGCCGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGCATCTGGGGTGGGCGATCGCCCTCCGCTCCGCACTGCGTGACGGTAAAGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGgcgc < 2:743003/277‑1 (MQ=255) cccATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACCGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGTGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCAACACTGTGGGGCTA‑CTCGCACCTCCTGGTCTTGCTGTTTGGCTTTATGTTCCTGTTGGCGCtgtt > 4:643328/1‑276 (MQ=255) cATCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGCTCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGACACCACCAAACACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATCGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTCCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGCTCGTCCTGGCGTGGTGTGGGTTACTGGTGGCGCggg > 3:110173/1‑275 (MQ=255) tCGACGCGCTGCTGAAAGGTAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTACCGATATTTCGATGGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTGCCACCGATTGGTATTTTGGGCTTGGTTCCTCCTACCCTGCAAACCACCGTTTTC‑CCACCCCCGGGGGGTACCGCCCAACGGCGGGCCGTCCTGTTTGGTGTTATGTACTTGGTTGCGCtg > 3:128027/1‑272 (MQ=255) gcctgcgcgctgAAAGGTACCGACTTCGTGCTTCTTGTGTGGGCGTTCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTTGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTggtggt < 3:44215/267‑1 (MQ=255) gctgctGAAAAGTAACTTCATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGAACACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAcc < 1:128027/275‑1 (MQ=255) tAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCtggtg > 1:185413/1‑274 (MQ=255) tAACTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑AGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCcggtgt > 1:823517/1‑275 (MQ=255) aCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACCCTGTTGGGCTA‑CGCGCCACTGCCGGTCGTGCTGGTTGGCTGTTTGTTTCTGGTGGCGCTGTGGGTTAACCCATTGCtgggtgggtgg > 4:575956/1‑270 (MQ=255) aCTACATCGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCTCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTCACCCGTTGGTGGTGtggggg > 4:481292/1‑278 (MQ=255) cGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTTTGGGGCTA‑CGCTCCACTGCAGGTCGTGCTTGTTGGCTGTATGATACTGGTGGCGCTGGGGGTTACCCCATTTCTGGTTTGGGTGAATATtc > 4:705622/1‑278 (MQ=255) cGGGATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGGCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTCCTGGTGGCCCTGGTGGTTAACCCCTTGCTGGTGTGGGGGAGAAttg > 4:146183/1‑277 (MQ=255) gggATTCTGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCAGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAAt < 1:610329/275‑1 (MQ=255) cTGGTGTGGGCAGTCGCCCTCGTCTTCGCATTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATtcgtcg < 1:674324/275‑1 (MQ=255) tGGTGTGGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCCCACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGTCTGTATGTTACGGGTGGCCGTGGTGGTTAACCCATTGCTGCTGTGGGGGAAAATTcggcgt > 3:408256/1‑275 (MQ=255) gtgGGCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGt < 2:132377/278‑1 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGTTAGTTCGGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCGGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGGGGCAAATTCTTCGTTAGCTGTTca > 4:508330/1‑277 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCg > 1:9714/1‑274 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCCCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATGGCTGGTTTGGTGGAAAATTCGTCGTAAGCCg > 3:292942/1‑274 (MQ=255) ggCGATCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGCAACGAGACCACCACAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATCGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTCTGGGGTTC‑CGCGTAACTGCTGGTCGTTCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGTGCTGGGGGTTTACCCCCTGCTGGTTTGGTGCAACACTcgtcgttccc > 3:126635/1‑268 (MQ=255) tCGGCCTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTCTTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGCATATTCGTCGTAACCCGTTcgc > 1:644622/1‑272 (MQ=255) cGGCCACGGCTTCGCACTGAGTCACGGTAACGAGACCACAAAAAACCTGGTTATCGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCGCCGATTGGTATTTTTGAGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTTTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCATAACCCGTTCCCGc < 1:504416/275‑1 (MQ=255) cTCGGCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGAGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGtgct > 2:235042/1‑278 (MQ=255) tgggCTTCGCACTGCGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGt < 1:292943/272‑1 (MQ=255) cGTCACGGTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGTCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTCCTGGTCTTGCTGGTTGGCTGTCTGTTCCTGGTGGCGTTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGGGGGGGAAAATTAGTCGTAAGCCGTTCCCGCGGGTGGTGGTGTGCGTggggga > 4:766523/1‑273 (MQ=255) gTCACGAGAACAAGAACACCAAAAACCTATGTAACGATATGGCGAATGCCGTTACTTGTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTGGGGCTGGTTTCGTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTgcg < 3:178141/274‑1 (MQ=255) ggTAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTTCCTGCGCGAAAg > 1:23085/1‑275 (MQ=255) gTAACGAGACCCGCAAAAACCTGGTTAACGATATTGCGAATGCCGTTGCCTTTATGGTGACACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGc < 1:412785/275‑1 (MQ=255) tAACGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCg < 1:583930/275‑1 (MQ=255) aCGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGTTGGCGCTGGTGGTTACCCCATTGCTGGTGTGGTGGAACATTCGTCGTAACCCGTTCCCGATGGTGCTGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGgt > 1:841749/1‑275 (MQ=255) aCGAGACCACCAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGCCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTAACCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑TGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAACCCATTGCTGGTGTGGTGCAATATTCGTCGCACCCGGTTCCCGCTGGTCCTGCTTGGCCTGCGCCAAAGCgg > 3:501323/1‑274 (MQ=255) accaccAAAAACCTGGTTAACGATATGTCGAATGCCGTTACCTTTATGGTGAAACTGGTCATTCGCTTCGCACCGATTGGTATTTTTGGGCTGGTTTCTTCTACCCTGGCAACCACCGGTTTCTCCACACTGTGGGGCTA‑CGCGCAACTGCTGGTCGTGCTGGTTGGCTGTATGTTACTGGTGGCGCTGGTGGTTAAGCCATTGCTGGTGTGGTGGAAAATTCGTCGTAACCCGTTCCCGCTGGTGATGCTGTGCCTGCGCGAAAGCGgtgtgga > 1:239867/1‑273 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |