| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 481,071 | IS1 (+) +9 bp | 53.4% | intergenic (‑363/+175) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 481071 = | 140 (0.550) | intergenic (‑363/+183) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 172 (0.630) | 106/258 | NT | 53.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 481079 | 140 (0.550) | intergenic (‑371/+175) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein | |||||
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GAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/258528‑258675‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTTATGAAT < NC_000913/481079‑480932 GATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGAT < 2:1773186/149‑1 ATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATT < 2:1277578/149‑1 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CTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCT > 1:694347/1‑149 TAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTG > 1:1694348/1‑149 TAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTG > 1:1052284/1‑149 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGC > 1:1077294/1‑149 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGC < 3:116041/149‑1 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCG > 1:2006635/1‑149 TCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGA < 4:1356834/149‑1 GTAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAA > 3:921392/1‑149 TAAGTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAAT > 1:563491/1‑149 GTTGGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATT < 2:2198317/55‑1 GGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATT < 4:1653348/72‑1 GGCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTCAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATT > 3:1653348/1‑72 GCAGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAA < 4:1081917/149‑1 AGCATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATG > 3:1440939/1‑149 CATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTT < 2:106178/149‑1 CATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTT < 3:1345229/149‑1 ATCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTTA > 4:1132323/1‑149 TCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTTAT > 1:2327309/1‑149 TCACCGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTTAT > 3:1678152/1‑149 CGATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTTATGAAT > 2:2525823/1‑149 GAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/258528‑258675‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTTAATAATCCATAATCATTTAGAGGCTATTCTTAATTATTTGCGGTAATTCTTTATTCATTCCTCGGTTATTACGTCATATTCAGAGCAATCCTGGTATTAGTGTCACCAATTTCATCTGGCGATAATCCTGAAATGTTATGAAT < NC_000913/481079‑480932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |