| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 481,071 | IS1 (+) +9 bp | 53.4% | intergenic (‑363/+175) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 149 (0.550) | 108/258 | NT | 49.7% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 481071 = | 140 (0.550) | intergenic (‑363/+183) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 172 (0.630) | 106/258 | NT | 53.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 481079 | 140 (0.550) | intergenic (‑371/+175) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein | |||||
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
TATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTT > NC_000913/480931‑481226 | cATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATAACAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAATAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTATAAATGATTATGGATTATTAAATCTAtt < 4:722625/149‑1 (MQ=255) aTAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTa > 2:1603160/1‑149 (MQ=255) aaCATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatg < 3:1468109‑M2/149‑8 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAgcg > 3:787866‑M2/133‑149 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAgcg > 2:2340180‑M2/133‑149 (MQ=255) gaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTaa > 1:2340312‑M2/125‑149 (MQ=255) ggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAata < 4:2303312‑M2/27‑1 (MQ=255) tCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATaaa < 2:827745/149‑1 (MQ=255) gcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATaaa < 3:174391‑M2/31‑1 (MQ=255) cGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgat > 1:2006635‑M2/1‑126 (MQ=255) gCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatt < 3:116041‑M2/149‑25 (MQ=255) cAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaa < 1:1603160/149‑1 (MQ=255) gATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaact > 3:532092/1‑149 (MQ=255) aTGAAATTGGTGACACTAATACCAGTATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGGATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgacaacttactgatttagtg < 4:89614‑M2/149‑30 (MQ=255) tGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaactaa < 4:314012/149‑1 (MQ=255) cacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaactaa < 3:342813‑M2/39‑1 (MQ=255) aTTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 3:2443004‑M2/1‑115 (MQ=255) ggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTAttt < 1:1124680‑M2/51‑1 (MQ=255) cacTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt > 2:1433051‑M2/1‑107 (MQ=255) acTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:1407813‑M2/149‑44 (MQ=255) gtcgctgtcgttcgcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTAtttt > 4:2411519‑M2/95‑146 (MQ=255) aaTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 3:262215‑M2/1‑103 (MQ=255) aaTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:562021‑M2/1‑103 (MQ=255) aCCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaactaa < 1:1004695/130‑1 (MQ=255) tgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAAGCAGTATTTTTTATGAAt < 4:1395607‑M2/60‑1 (MQ=255) aGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAAtt < 3:1269643/149‑1 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGaa > 3:2126092‑M2/85‑143 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGaa < 4:2126092‑M2/59‑1 (MQ=255) ctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATcc < 3:665977‑M2/67‑1 (MQ=255) tcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCg > 4:148676‑M2/82‑149 (MQ=255) ctctGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 4:1908321‑M2/149‑60 (MQ=255) tctGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc < 1:1281252‑M2/149‑61 (MQ=255) ctGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTg > 2:67872/1‑149 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAAttt < 1:2303146‑M2/62‑1 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAAttt > 2:2303146‑M2/80‑141 (MQ=255) tGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTgg > 2:2035324/1‑149 (MQ=255) gAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGt > 1:2449103/1‑149 (MQ=255) tatGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGTATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt > 2:984700‑M2/1‑83 (MQ=255) cggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTaa < 3:2276682‑M2/75‑1 (MQ=255) gACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTCTTATGACTTTTATCCGTGGTTAATAc > 3:725044/1‑149 (MQ=255) cGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTg < 3:177335/149‑1 (MQ=255) gctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGtt < 1:1079412‑M2/73‑1 (MQ=255) ataaCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGttt < 2:277116/149‑1 (MQ=255) aaCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTc < 1:175894/149‑1 (MQ=255) aCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCa > 1:705795/1‑107 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGt > 1:644159‑M2/62‑149 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGt > 3:693939‑M2/62‑149 (MQ=255) gacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTa > 2:2020758‑M2/61‑149 (MQ=255) gacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTa < 1:2246142‑M2/89‑1 (MQ=255) gAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTAt < 3:598010/149‑1 (MQ=255) gaatgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 3:1356834‑M2/1‑65 (MQ=255) agtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATgaga > 3:2046246‑M2/56‑149 (MQ=255) tgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTa < 4:1091602/108‑1 (MQ=255) gaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATcc > 2:783420/1‑149 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGtt > 4:1661527‑M2/52‑134 (MQ=255) atAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 3:902119‑M2/103‑45 (MQ=255) tAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGa > 4:381735/1‑149 (MQ=255) aaGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagc < 4:552011‑M2/149‑94 (MQ=255) aGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGtt > 4:1776479/1‑149 (MQ=255) aaTTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac > 1:314426‑M2/1‑53 (MQ=255) aaTTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac > 1:1855860‑M2/1‑53 (MQ=255) ttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTtggt < 4:1247597‑M2/106‑1 (MQ=255) ttACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 2:2481103‑M2/149‑99 (MQ=255) ccGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 4:1297145‑M2/149‑102 (MQ=255) tgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTc > 1:917991‑M2/39‑149 (MQ=255) cGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTCTATCCGTGGTTAATACTGGGTTTc < 1:2143610/124‑1 (MQ=255) gaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCa > 1:532947‑M2/38‑149 (MQ=255) gCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 4:101659‑M2/149‑104 (MQ=255) aataatTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAAtt < 2:1846293/149‑1 (MQ=255) ataatTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:2417876‑M2/149‑108 (MQ=255) atTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTc < 2:114894/149‑1 (MQ=255) ttAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatcctaacaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgttcctcttgttctgctactgacggggtggttcg < 4:470622‑M2/149‑112 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTcc < 3:45949‑M2/120‑1 (MQ=255) tAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 4:633573‑M2/149‑113 (MQ=255) tAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatgtagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 2:1681240‑M2/149‑113 (MQ=255) tAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCt < 3:1556813/149‑1 (MQ=255) gAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGtt < 2:1191180/108‑1 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAAt > 2:2244399‑M2/25‑149 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATg < 2:1082547‑M2/126‑1 (MQ=255) aTAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATg > 2:428682/1‑149 (MQ=255) ctctAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaa > 1:1918646‑M2/1‑27 (MQ=255) ctctAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcataacggcaaaa > 3:1602319‑M2/1‑27 (MQ=255) ctctAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTgg < 3:1661667/89‑1 (MQ=255) tctAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 2:1901856‑M2/1‑26 (MQ=255) tAAGTGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAgg < 4:1603964/149‑1 (MQ=255) tAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagca > 2:1263318‑M2/1‑24 (MQ=255) tGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTAt < 2:2119375/149‑1 (MQ=255) gagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAg > 3:1938831‑M2/12‑144 (MQ=255) ttATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgg > 4:1962718‑M2/1‑17 (MQ=255) tATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagttgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgga < 2:1343972‑M2/149‑134 (MQ=255) attaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATg > 1:1712086‑M2/7‑145 (MQ=255) aTGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt < 1:1302501‑M2/83‑69 (MQ=255) ttaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGaa < 1:2049708‑M2/59‑1 (MQ=255) tGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATaa > 1:1453111/1‑149 (MQ=255) cTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATaaaaaa < 1:98738‑M2/148‑1 (MQ=255) attaAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAgg > 2:1303178/1‑149 (MQ=255) ttaAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGc < 1:777801/149‑1 (MQ=255) ttaAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTGTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGc > 2:738720/1‑149 (MQ=255) aTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatc < 2:1773186‑M2/149‑147 (MQ=255) aTCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGtt > 1:854048/1‑130 (MQ=255) | TATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTT > NC_000913/480931‑481226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |