| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 481,071 | IS1 (+) +9 bp | 53.4% | intergenic (‑363/+175) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 149 (0.550) | 108/258 | NT | 49.7% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 481071 = | 140 (0.550) | intergenic (‑363/+183) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 172 (0.630) | 106/258 | NT | 53.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 481079 | 140 (0.550) | intergenic (‑371/+175) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein | |||||
Only 100 of 522 total aligned reads displayed.
GCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAG > NC_000913/480923‑481219 | cTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGatta < 4:534856/149‑1 (MQ=255) ttgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAt > 4:1452848‑M2/147‑149 (MQ=255) tCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAGTAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGattat > 3:826020/1‑149 (MQ=255) gcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacct < 1:1000189‑M2/1‑1 (MQ=255) cATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtg < 1:2029275‑M2/149‑5 (MQ=255) cATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATAACAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAATAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTATAAATGATTATGGATTATTAAATCTAtt < 4:722625/149‑1 (MQ=255) aTAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTa > 1:645917/1‑149 (MQ=255) aTAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTa > 2:1603160/1‑149 (MQ=255) aTAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAAGATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATGATTAAATCTATTa > 4:1573797/1‑149 (MQ=255) aaCATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatg < 2:106178‑M2/149‑8 (MQ=255) aaCATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatg < 3:1468109‑M2/149‑8 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAgcg > 3:339367‑M2/133‑149 (MQ=255) tttCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgc < 4:1081917‑M2/149‑12 (MQ=255) aTTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaactta > 1:563491‑M2/1‑131 (MQ=255) aTCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATaa > 4:2062883/1‑149 (MQ=255) gcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATaaa < 3:174391‑M2/31‑1 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggcggagctgcatgacaaagtcatcaggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAAt > 1:1956663‑M2/118‑149 (MQ=255) cAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgattta > 1:1052284‑M2/1‑123 (MQ=255) aTGAAATTGGTGACACTAATACCAGTATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGGATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgacaacttactgatttagtg < 4:89614‑M2/149‑30 (MQ=255) tGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgt < 1:227565‑M2/149‑31 (MQ=255) tGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaactaa < 4:314012/149‑1 (MQ=255) gctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAAt < 2:778041‑M2/43‑1 (MQ=255) aTTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAAt > 2:2498619/1‑149 (MQ=255) tGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAGTCTAGTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCa < 2:1142375/149‑1 (MQ=255) tGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTa < 1:910494/149‑1 (MQ=255) acTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 2:2124030‑M2/149‑44 (MQ=255) acTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTAtttt > 2:956047/1‑149 (MQ=255) tAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg < 1:1862549‑M2/149‑46 (MQ=255) tAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTAtttttt < 2:1861302/149‑1 (MQ=255) aaTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:1966426‑M2/1‑103 (MQ=255) aTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 4:119695‑M2/1‑102 (MQ=255) aTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:314426‑M2/149‑48 (MQ=255) aTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 3:2468952‑M2/1‑102 (MQ=255) aTACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 2:202589‑M2/1‑102 (MQ=255) aGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAAtt < 3:1269643/149‑1 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAAttt > 2:2246142‑M2/88‑149 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGaa > 3:2126092‑M2/85‑143 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTAt > 1:1639745‑M2/85‑149 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTAt > 2:1322845‑M2/85‑149 (MQ=255) tctGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTATCGCTACTTAATATAAATtaacta > 1:1806997/1‑118 (MQ=255) tGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:1329433‑M2/1‑87 (MQ=255) tGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTgg > 2:2035324/1‑149 (MQ=255) gAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGCATTTTTTATGAATTTTATCCTTGGt > 3:723128/1‑149 (MQ=255) cggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTaa < 2:734318‑M2/75‑1 (MQ=255) tGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATa > 4:183594/1‑149 (MQ=255) tGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATa < 2:1449328/149‑1 (MQ=255) gACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATAc > 1:2390660/1‑149 (MQ=255) cGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTg < 3:177335/149‑1 (MQ=255) aataaCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGatta < 3:399050/68‑1 (MQ=255) aataaCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGtt > 1:148404/1‑149 (MQ=255) taaCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggcgctccagtggcttctgtttctatcagc > 3:1661800‑M2/1‑73 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactaccaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTc > 3:1536971‑M2/64‑149 (MQ=255) aaCCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAatat > 2:817095/1‑91 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctaaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGt > 4:45949‑M2/62‑149 (MQ=255) cGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTa > 1:2087430/1‑149 (MQ=255) gAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgattta < 2:230922‑M2/94‑27 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATga < 3:581361‑M2/92‑1 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATga > 4:1630286‑M2/58‑149 (MQ=255) gaatgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 3:1356834‑M2/1‑65 (MQ=255) gaatgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 2:608101‑M2/139‑75 (MQ=255) gaatgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGAGTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:2201097‑M2/149‑85 (MQ=255) tgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTa > 3:1091602/1‑108 (MQ=255) tgaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATc < 4:2172905/149‑1 (MQ=255) gaatAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggttctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt < 3:636563‑M2/149‑89 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCt < 3:693588‑M2/98‑1 (MQ=255) atAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 4:172148‑M2/149‑91 (MQ=255) tAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGa > 4:381735/1‑149 (MQ=255) gggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATtaactaa > 3:94163‑M2/49‑87 (MQ=255) aaGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagc > 4:1265710‑M2/1‑56 (MQ=255) gAATTACCGCAAACAATTAAGAATAGCCTATAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgttgctgccaacttactgatttagagtatgagggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta < 2:1388312‑M2/149‑96 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTtgg > 1:1082547‑M2/45‑149 (MQ=255) atccgaacataaaacattaacaataagtttgagttattatcTAATAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACCATCAGTAATTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTtggtgg < 2:1777940‑M2/108‑1 (MQ=255) cGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgcccctcctgttcagctactgacgg < 3:226749‑M2/149‑103 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAAt < 2:2340312‑M2/114‑1 (MQ=255) aaaTAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAAt < 4:1387790/149‑1 (MQ=255) aataatTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTg > 4:2433999/1‑114 (MQ=255) aataatTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTg < 3:2433999/114‑1 (MQ=255) ataatTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:2417876‑M2/149‑108 (MQ=255) ttAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg < 1:2470899‑M2/149‑112 (MQ=255) ttAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTcc < 1:1289375/149‑1 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAg > 3:513746‑M2/30‑130 (MQ=255) tAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatgtagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 2:1681240‑M2/149‑113 (MQ=255) tAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCt < 1:1414761/149‑1 (MQ=255) gAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGtt < 2:1191180/108‑1 (MQ=255) gAATAGCCTCTAAATGATTACGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGtt > 1:1191180/1‑108 (MQ=255) aaTAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacg > 4:1949013‑M2/1‑33 (MQ=255) ctctAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcataacggcaaaa > 3:1602319‑M2/1‑27 (MQ=255) tctAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTg > 1:230939/1‑87 (MQ=255) ctAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTCACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTAACCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAAGGTTCGTAg < 3:2062883/149‑1 (MQ=255) ctAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAg < 1:736391/149‑1 (MQ=255) tAAATGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagca > 2:1263318‑M2/1‑24 (MQ=255) tAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAgg > 4:2330458/1‑149 (MQ=255) gttggagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGt > 3:767489‑M2/16‑87 (MQ=255) aaaTGATTATGGATTATTAAATCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac > 4:606072‑M2/1‑23 (MQ=255) tGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTAt < 1:783420/149‑1 (MQ=255) gagtcattaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAg > 3:1938831‑M2/12‑144 (MQ=255) attaccTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATg > 1:1712086‑M2/7‑145 (MQ=255) attaccTATTAAATCAATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATa > 1:980598‑M2/7‑149 (MQ=255) gcattattAAATTAATTAGCGCTACTTAATATAACTTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGCATTATATCCGTTATTACTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTCAATGTTCGTAGGTTATGCATaaa < 2:510315/147‑1 (MQ=255) cTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATaaaaaa < 1:379908‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAG > NC_000913/480923‑481219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |