| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3884855 | 110 (0.810) | 23 (0.180) | 9/166 | NT | 17.9% | coding (40/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 3884868 | 109 (0.860) | coding (53/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TTGCCGACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAT > NC_000913/3884770‑3884967 | ttGCCGACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAGAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTc > 1:1535726‑M2/1‑99 (MQ=255) ccGACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctat > 2:357343‑M2/1‑96 (MQ=255) gACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAACTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatca < 1:3202‑M2/100‑7 (MQ=255) gACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatca > 2:3306383‑M2/1‑94 (MQ=255) gACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatca < 1:280226‑M2/100‑7 (MQ=255) gACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatc > 1:987184‑M2/1‑94 (MQ=255) aCCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCaa < 2:3137624/100‑1 (MQ=255) tCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGc < 2:3096597/100‑1 (MQ=255) cGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGcc < 2:1514436/100‑1 (MQ=255) cGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGcc < 2:367462/100‑1 (MQ=255) gATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCt > 2:3491450/1‑100 (MQ=255) gATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCt > 1:3644937/1‑100 (MQ=255) tagccGTGCCCTCTTGGACGCCTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCATTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGGTAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGct < 1:444161/94‑2 (MQ=255) aaCCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGAt < 2:235975/100‑1 (MQ=255) aCCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGAtt < 2:2171733/100‑1 (MQ=255) aCCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGAtt < 2:3272873/100‑1 (MQ=255) aCCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGAtt < 1:322772/100‑1 (MQ=255) aCCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGAtt > 2:3419367/1‑100 (MQ=255) cGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAg < 1:3357186/100‑1 (MQ=255) gTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCTTTCGGGTCTATCAACGCCTGAt < 1:2209033/96‑1 (MQ=255) tGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTc < 1:408286/100‑1 (MQ=255) gCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTcc < 2:2911501/100‑1 (MQ=255) gCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTcc < 1:1780188/100‑1 (MQ=255) ctctctCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCg > 1:3605110/1‑100 (MQ=255) tctctcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGAGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGc > 1:1880186/1‑100 (MQ=255) nctctcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGc > 2:3680164/2‑100 (MQ=255) nggAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTc > 2:1466407/2‑100 (MQ=255) gCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGcc < 2:796888/100‑1 (MQ=255) cGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCg < 2:1254547/100‑1 (MQ=255) gTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGc > 2:3523445/1‑100 (MQ=255) ttGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCa > 1:737664/1‑100 (MQ=255) tGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCAt > 2:505606/1‑100 (MQ=255) aaaaaTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGt > 2:1073357/1‑100 (MQ=255) aaaTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGCTAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCGACTCGGGCCGCATTGTCg > 1:3252173/1‑100 (MQ=255) aTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGtt < 2:280231/100‑1 (MQ=255) aTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGGCTTTCAACGCCTGATTCGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGtt > 1:2930860/1‑100 (MQ=255) ttATGGCGCCGCCACTGTGGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGttt < 1:59287/100‑1 (MQ=255) tATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTc > 1:2523646/1‑100 (MQ=255) tATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTc < 2:1468242/100‑1 (MQ=255) aTGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCTCATTGTCGTTTc < 1:1677501/99‑1 (MQ=255) tGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCAc < 1:1048585/100‑1 (MQ=255) gcgcCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTc > 2:3739473/1‑100 (MQ=255) cgccgcCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTcc < 2:93017/100‑1 (MQ=255) gccgccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTcn < 1:1466398/99‑2 (MQ=255) cgccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAAc > 2:2071438/1‑100 (MQ=255) ccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTGCTGATAGCCCTCACTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAAcc > 1:1270301/1‑99 (MQ=255) cACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTg > 2:2666855/1‑100 (MQ=255) aCTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGt > 1:3758690/1‑100 (MQ=255) cTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGtt < 2:2526344/100‑1 (MQ=255) tGTCGCCTGGCTCGCGGTTCCTGAGAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCTGCATTGTCTTTTCACTCCAACCTg < 1:607669/97‑1 (MQ=255) tGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTNGGGTCTANCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCTCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTc < 2:2325291/100‑1 (MQ=255) gTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCa > 1:350217/1‑100 (MQ=255) gTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCa < 2:2523658/100‑1 (MQ=255) gTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCa < 2:901972/100‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCaa < 2:553033/100‑1 (MQ=255) gCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGc > 1:1086117/1‑100 (MQ=255) gCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGc < 1:3349444/100‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCt > 2:1319850/1‑100 (MQ=255) ggCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACg > 2:1647263/1‑100 (MQ=255) cgcgGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAAt < 2:95874/100‑1 (MQ=255) cgGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggaccggcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttat < 1:2041330‑M2/100‑75 (MQ=255) cgGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTg > 2:1889786/1‑100 (MQ=255) cgGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTg < 2:2878754/100‑1 (MQ=255) ggTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAg < 2:217116/100‑1 (MQ=255) ggTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAg < 2:2630966/100‑1 (MQ=255) ggCCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaagaaccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagaccggctatcg < 1:2509222‑M2/100‑77 (MQ=255) gTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcga < 1:2697068‑M2/100‑78 (MQ=255) gTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcga < 1:967872‑M2/100‑78 (MQ=255) gTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttctccaacgcttccgagagagcacggttatcga < 1:875158‑M2/100‑78 (MQ=255) gTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAgg < 2:638970/100‑1 (MQ=255) gTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAgg < 1:1937453/100‑1 (MQ=255) gTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAgg < 2:3163839/100‑1 (MQ=255) ccTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcgggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataattgttacaacgattccgagagagtatggtta < 1:2181086‑M2/94‑74 (MQ=255) ccTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcgagg < 2:1854575‑M2/100‑80 (MQ=255) ccTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcgagg > 1:3555198‑M2/1‑21 (MQ=255) ccTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCa > 2:2256213/1‑100 (MQ=255) cTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcgaggt < 2:3388221‑M2/100‑81 (MQ=255) cTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcgaggt < 2:352528‑M2/100‑81 (MQ=255) cTGATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcgaggt < 2:1140069‑M2/100‑81 (MQ=255) tGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCAtt > 2:3017273/1‑100 (MQ=255) gATAGCCCTCATTCGGGTctatcaggacccgcgagccgggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccgagagagcacggttatcgaggtcg < 1:2039567‑M2/100‑83 (MQ=255) gATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTg > 1:700962/1‑100 (MQ=255) gCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCa > 1:2663089/1‑100 (MQ=255) gCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCa < 2:1112320/100‑1 (MQ=255) gCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCa > 1:2198947/1‑100 (MQ=255) gCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCa < 2:3722926/100‑1 (MQ=255) cccTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAg > 1:2661182/1‑100 (MQ=255) cccTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAg > 2:3796733/1‑100 (MQ=255) ccTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAgg > 1:197732/1‑100 (MQ=255) cATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGttt > 1:769207/1‑100 (MQ=255) aTTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTg < 2:1136053/100‑1 (MQ=255) tCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGa < 2:430991/100‑1 (MQ=255) cGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTGCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCTAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGGAGGTTTGGAg > 1:3714103/1‑100 (MQ=255) cGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAg > 2:2836552/1‑100 (MQ=255) cGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAg < 2:1978438/100‑1 (MQ=255) ggTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTg > 1:2166269/1‑100 (MQ=255) ggTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTg > 2:1662965/1‑100 (MQ=255) gTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTg < 2:414671/99‑1 (MQ=255) tCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAt > 1:3063500/1‑100 (MQ=255) tCTATCAACGCCTGATTAGTCACCCACTCGGGCCGCATTGTCGTCTCACTCCAACCTGTTCACGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAt < 1:1123920/100‑1 (MQ=255) | TTGCCGACCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAT > NC_000913/3884770‑3884967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |