| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3613601 = | 145 (1.030) | 30 (0.240) | 14/158 | NT | 19.4% | intergenic (+45/‑66) | acpT/nikA | 4'‑phosphopantetheinyl transferase/nickel/heme ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 3613631 = | 120 (0.960) | intergenic (+75/‑36) | acpT/nikA | 4'‑phosphopantetheinyl transferase/nickel/heme ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
AGCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3613708‑3613601‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCAT > NC_000913/3613631‑3613729 AGCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTC > 2:3166235/1‑100AGCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTC > 1:94885/1‑100 GCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCG > 1:54329/1‑100 GCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCG > 2:2396755/1‑100 GCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCG > 2:1210559/1‑100 GCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCG > 1:2608770/1‑100 GCCAGCAGCGCAAATAGAGGGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCG > 2:3273687/1‑100 AGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCA > 1:3842567/1‑100 GCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCAT < 2:2950012/100‑1 GCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCAT > 2:2055440/1‑100 CAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATA < 1:1168030/100‑1 AGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATAC < 2:3892406/100‑1 AGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATAC < 1:821581/100‑1 AGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATAC > 1:665169/1‑100 tctCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACT < 2:854230/97‑1 GCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACT < 2:146357/100‑1 GCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACT > 1:95010/1‑100 GCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACT < 2:2913071/100‑1 CAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTaga > 1:854235/1‑97 GGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTA > 1:1666705/1‑100 CCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATG > 1:2451521/1‑100 TGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTCTGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCC < 2:148950/100‑1 GCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTC > 1:963876/1‑100 GCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTC > 1:2948917/1‑100 GCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTC > 1:2160103/1‑100 CGGAAATAAGTATGACGTTTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCT > 2:3839007/1‑100 GGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCTTTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCTACCGCTCTCTA > 2:3223373/1‑100 GGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTA > 2:1427964/1‑100 GGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTA > 2:2598219/1‑100 GGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTA > 1:2812661/1‑100 GGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTA > 1:2562905/1‑100 GGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATAAGCGTTAACATGCTCTCCACACTACGCCGCACTCTA > 2:1340984/1‑100 GAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAT > 1:3092251/1‑100 GAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTATAT > 1:3092152/1‑100 AATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTT > 2:667265/1‑100 AATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTACGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTT > 2:1853204/1‑100 ATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTG > 1:1899568/1‑100 TAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGC > 1:492397/1‑100 TAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGC > 1:2157629/1‑100 TAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGC > 2:3763813/1‑100 AAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCG > 2:2892588/1‑100 AGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCCCTCTATTTGCGC > 1:273722/1‑100 AGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGC > 1:2102289/1‑100 AGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGC > 2:2963571/1‑100 AGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGC > 2:1006813/1‑100 AGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGC > 1:2979356/1‑100 GTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCT > 1:1851353/1‑100 GTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCT > 1:3798832/1‑100 TGACGATTTTAAGTATTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCT > 1:238269/1‑100 CGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTA < 1:2561577/100‑1 CGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTA < 1:235972/100‑1 CGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTA < 1:1502642/100‑1 CGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTA < 2:1426421/100‑1 CGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTA < 2:2826029/100‑1 gttgtagTTATTTCTGCCAACTATTTTAATCCATTGGAGTTACCATGCTCCCCACACTTCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTA < 2:258448/92‑1 GTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTAT < 2:3542327/100‑1 GTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTAT < 2:3496557/100‑1 CATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCTCTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCG < 1:3747700/100‑1 CATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTAGTGCGTCTTTTATCG > 1:3886996/1‑100 ATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGTGTCTTTTATCGT < 1:2586814/100‑1 ATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGT > 2:3589098/1‑100 ATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGT > 2:1515706/1‑100 ATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGT > 1:1966389/1‑100 TACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTC < 1:1427973/100‑1 TACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTC < 2:2891791/100‑1 TACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTAACATGCTCTCCACACTCCGCCGCATTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTC > 2:2440364/1‑100 ACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCC < 2:268932/100‑1 ACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCC < 2:1740068/100‑1 ACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCC < 2:516025/100‑1 ACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCC < 1:2037431/100‑1 CTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCA > 2:3063732/1‑100 CTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCA > 1:2433040/1‑100 CTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCA > 1:2048274/1‑100 CTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCA < 1:2044384/100‑1 CTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCA < 2:942010/100‑1 TTATTCCCGCCACCTATTTTACTCCATTGGGCGTACCATGCTCGCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCAT < 2:1302295/100‑1 AGCCAGCAGCGCAAATAGAGTGCGGCGGAGTGTGGAGAGCATGGTAACCCCAATGGATTAAAATAGATGGCGGAAATAAGTATGACGATTTTAAGTATTCGTCATACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3613708‑3613601‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCAT > NC_000913/3613631‑3613729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |